RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477304.1

CYS1-202, Transcript of cystin 1, humanhuman

TSL 4

Gene CYS1, Length 507 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYS1-202ENST00000477304 SCN9AQ15858 1988 aa23.37■■□□□ 1.33
CYS1-202ENST00000477304 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
CYS1-202ENST00000477304 COL4A1P02462 1669 aa23.36■■□□□ 1.33
CYS1-202ENST00000477304 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
CYS1-202ENST00000477304 ANKRD2Q9GZV1 360 aa23.36■■□□□ 1.33
CYS1-202ENST00000477304 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa23.35■■□□□ 1.33
CYS1-202ENST00000477304 CCT4P50991 539 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
CYS1-202ENST00000477304 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
CYS1-202ENST00000477304 IGKV5-2P06315 115 aa23.34■■□□□ 1.33
CYS1-202ENST00000477304 DACT2Q5SW24 774 aa23.34■■□□□ 1.33
CYS1-202ENST00000477304 AKAP11Q9UKA4 1901 aa23.33■■□□□ 1.33
CYS1-202ENST00000477304 CCDC27Q2M243 656 aa23.33■■□□□ 1.33
CYS1-202ENST00000477304 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
CYS1-202ENST00000477304 GREM2Q9H772 168 aa23.33■■□□□ 1.33
CYS1-202ENST00000477304 HDAC9Q9UKV0 1011 aa23.33■■□□□ 1.33
CYS1-202ENST00000477304 NEURL1BA8MQ27 555 aa23.32■■□□□ 1.32
CYS1-202ENST00000477304 H7C1W4 665 aa23.32■■□□□ 1.32
CYS1-202ENST00000477304 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
CYS1-202ENST00000477304 PLA2G12BQ9BX93 195 aa23.32■■□□□ 1.32
CYS1-202ENST00000477304 PSME4Q14997 1843 aa23.31■■□□□ 1.32
CYS1-202ENST00000477304 WNT10BO00744 389 aa23.31■■□□□ 1.32
CYS1-202ENST00000477304 TM4SF4P48230 202 aa23.31■■□□□ 1.32
CYS1-202ENST00000477304 SREBF2Q12772 1141 aa23.31■■□□□ 1.32
CYS1-202ENST00000477304 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
CYS1-202ENST00000477304 MPHOSPH8Q99549 860 aa23.31■■□□□ 1.32
CYS1-202ENST00000477304 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.31■■□□□ 1.32
CYS1-202ENST00000477304 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
CYS1-202ENST00000477304 NBPF9Q3BBW0 867 aa23.3■■□□□ 1.32
CYS1-202ENST00000477304 TTLL5Q6EMB2 1281 aa23.3■■□□□ 1.32
CYS1-202ENST00000477304 ARMC9Q7Z3E5 817 aa23.3■■□□□ 1.32
CYS1-202ENST00000477304 PCDH10Q9P2E7 1040 aa23.3■■□□□ 1.32
CYS1-202ENST00000477304 TSPYL6Q8N831 410 aa23.29■■□□□ 1.32
CYS1-202ENST00000477304 ZNF804BA4D1E1 1349 aa23.29■■□□□ 1.32
CYS1-202ENST00000477304 UBE2Q2LH0YL09 131 aa23.28■■□□□ 1.32
CYS1-202ENST00000477304 SLC4A2P04920 1241 aa23.28■■□□□ 1.32
CYS1-202ENST00000477304 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
CYS1-202ENST00000477304 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa23.28■■□□□ 1.32
CYS1-202ENST00000477304 FBXW7Q969H0 707 aa23.28■■□□□ 1.32
CYS1-202ENST00000477304 CFHR5Q9BXR6 569 aa23.28■■□□□ 1.32
CYS1-202ENST00000477304 IL16Q14005 1332 aa23.28■■□□□ 1.32
CYS1-202ENST00000477304 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa23.27■■□□□ 1.32
CYS1-202ENST00000477304 GCKRQ14397 625 aa23.27■■□□□ 1.32
CYS1-202ENST00000477304 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
CYS1-202ENST00000477304 UNCXA6NJT0 531 aa23.26■■□□□ 1.31
CYS1-202ENST00000477304 ALDH1A1P00352 501 aa23.26■■□□□ 1.31
CYS1-202ENST00000477304 CSF1RP07333 972 aa23.26■■□□□ 1.31
CYS1-202ENST00000477304 ITGA6P23229 1130 aa23.26■■□□□ 1.31
CYS1-202ENST00000477304 KCNJ4P48050 445 aa23.26■■□□□ 1.31
CYS1-202ENST00000477304 INHBEP58166 350 aa23.26■■□□□ 1.31
CYS1-202ENST00000477304 LINS1Q8NG48 757 aa23.25■■□□□ 1.31
CYS1-202ENST00000477304 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
CYS1-202ENST00000477304 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
CYS1-202ENST00000477304 WWC1Q8IX03 1113 aa23.24■■□□□ 1.31
CYS1-202ENST00000477304 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
CYS1-202ENST00000477304 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
CYS1-202ENST00000477304 HPS5Q9UPZ3 1129 aa23.24■■□□□ 1.31
CYS1-202ENST00000477304 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa23.24■■□□□ 1.31
CYS1-202ENST00000477304 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
CYS1-202ENST00000477304 SOX10P56693 466 aa23.23■■□□□ 1.31
CYS1-202ENST00000477304 FLIIQ13045 1269 aa23.23■■□□□ 1.31
CYS1-202ENST00000477304 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa23.23■■□□□ 1.31
CYS1-202ENST00000477304 MOB2Q70IA6 237 aa23.23■■□□□ 1.31
CYS1-202ENST00000477304 MYH3P11055 1940 aa23.22■■□□□ 1.31
CYS1-202ENST00000477304 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa23.22■■□□□ 1.31
CYS1-202ENST00000477304 GPR25O00155 361 aa23.22■■□□□ 1.31
CYS1-202ENST00000477304 TBC1D8O95759 1140 aa23.22■■□□□ 1.31
CYS1-202ENST00000477304 GTF2IP78347 998 aa23.22■■□□□ 1.31
CYS1-202ENST00000477304 LDLRAD1Q5T700 205 aa23.22■■□□□ 1.31
CYS1-202ENST00000477304 TXNRD3Q86VQ6 643 aa23.22■■□□□ 1.31
CYS1-202ENST00000477304 MTMR14Q8NCE2 650 aa23.22■■□□□ 1.31
CYS1-202ENST00000477304 DNAAF4Q8WXU2 420 aa23.22■■□□□ 1.31
CYS1-202ENST00000477304 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
CYS1-202ENST00000477304 MYO1BO43795 1136 aa23.21■■□□□ 1.31
CYS1-202ENST00000477304 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
CYS1-202ENST00000477304 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
CYS1-202ENST00000477304 DLGAP5Q15398 846 aa23.21■■□□□ 1.31
CYS1-202ENST00000477304 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
CYS1-202ENST00000477304 KIAA0825Q8IV33 1275 aa23.21■■□□□ 1.31
CYS1-202ENST00000477304 MXD3Q9BW11 206 aa23.21■■□□□ 1.31
CYS1-202ENST00000477304 CD209Q9NNX6 404 aa23.21■■□□□ 1.31
CYS1-202ENST00000477304 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
CYS1-202ENST00000477304 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
CYS1-202ENST00000477304 FKTNO75072 461 aa23.2■■□□□ 1.3
CYS1-202ENST00000477304 SASH1O94885 1247 aa23.2■■□□□ 1.3
CYS1-202ENST00000477304 CASP7P55210 303 aa23.2■■□□□ 1.3
CYS1-202ENST00000477304 CHRNDQ07001 517 aa23.2■■□□□ 1.3
CYS1-202ENST00000477304 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
CYS1-202ENST00000477304 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
CYS1-202ENST00000477304 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
CYS1-202ENST00000477304 MAP3K11Q16584 847 aa23.19■■□□□ 1.3
CYS1-202ENST00000477304 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa23.19■■□□□ 1.3
CYS1-202ENST00000477304 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
CYS1-202ENST00000477304 SPRYD7Q5W111 196 aa23.19■■□□□ 1.3
CYS1-202ENST00000477304 G2E3Q7L622 706 aa23.19■■□□□ 1.3
CYS1-202ENST00000477304 ZNF804AQ7Z570 1209 aa23.19■■□□□ 1.3
CYS1-202ENST00000477304 DEFB129Q9H1M3 183 aa23.19■■□□□ 1.3
CYS1-202ENST00000477304 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
CYS1-202ENST00000477304 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
CYS1-202ENST00000477304 SLC10A4Q96EP9 437 aa23.18■■□□□ 1.3
CYS1-202ENST00000477304 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms