RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466245.1

TTLL3-223, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 3

Gene TTLL3, Length 616 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-223	ENST00000466245	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-223	ENST00000466245	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-223	ENST00000466245	POLL	Q9UGP5	575 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-223	ENST00000466245	PSME4	Q14997	1843 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF609	O15014	1411 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-223	ENST00000466245	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-223	ENST00000466245	UFL1	O94874	794 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-223	ENST00000466245	IGKV5-2	P06315	115 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-223	ENST00000466245	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-223	ENST00000466245	GPSM2	P81274	684 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-223	ENST00000466245	SCARF1	Q14162	830 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-223	ENST00000466245	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-223	ENST00000466245	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-223	ENST00000466245	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-223	ENST00000466245	FAM89A	Q96GI7	184 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-223	ENST00000466245	MYD88	Q99836	296 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-223	ENST00000466245	GGA1	Q9UJY5	639 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-223	ENST00000466245	SCN9A	Q15858	1988 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-223	ENST00000466245	RTL9	Q8NET4	1388 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TTLL3-223	ENST00000466245	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-223	ENST00000466245	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-223	ENST00000466245	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-223	ENST00000466245	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-223	ENST00000466245	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-223	ENST00000466245	PTPRC	P08575	1304 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TTLL3-223	ENST00000466245		H7C1W4	665 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TTLL3-223	ENST00000466245	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
TTLL3-223	ENST00000466245	USP17L8	P0C7I0	530 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
TTLL3-223	ENST00000466245	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TTLL3-223	ENST00000466245	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TTLL3-223	ENST00000466245	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TTLL3-223	ENST00000466245	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TTLL3-223	ENST00000466245	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TTLL3-223	ENST00000466245	GPR25	O00155	361 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TTLL3-223	ENST00000466245	PDE8A	O60658	829 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TTLL3-223	ENST00000466245	FKTN	O75072	461 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TTLL3-223	ENST00000466245	TBC1D8	O95759	1140 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TTLL3-223	ENST00000466245	ALDH1A1	P00352	501 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TTLL3-223	ENST00000466245	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
TTLL3-223	ENST00000466245	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TTLL3-223	ENST00000466245	OGFOD1	Q8N543	542 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TTLL3-223	ENST00000466245	ALDH1L1	O75891	902 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TTLL3-223	ENST00000466245	MMP14	P50281	582 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TTLL3-223	ENST00000466245	CASP7	P55210	303 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TTLL3-223	ENST00000466245	GCKR	Q14397	625 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TTLL3-223	ENST00000466245	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TTLL3-223	ENST00000466245	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
TTLL3-223	ENST00000466245	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TTLL3-223	ENST00000466245	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TTLL3-223	ENST00000466245	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
TTLL3-223	ENST00000466245	XDH	P47989	1333 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TTLL3-223	ENST00000466245	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TTLL3-223	ENST00000466245	USP17L3	A6NCW0	530 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TTLL3-223	ENST00000466245	USP17L4	A6NCW7	530 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TTLL3-223	ENST00000466245	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TTLL3-223	ENST00000466245	TM4SF4	P48230	202 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TTLL3-223	ENST00000466245	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	12.74	□□□□□ -0.37
TTLL3-223	ENST00000466245	BEND3	Q5T5X7	828 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TTLL3-223	ENST00000466245	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TTLL3-223	ENST00000466245	PODN	Q7Z5L7	613 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TTLL3-223	ENST00000466245	ATP2B4	P23634	1241 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TTLL3-223	ENST00000466245	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	12.73	□□□□□ -0.37
TTLL3-223	ENST00000466245	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	12.73	□□□□□ -0.37
TTLL3-223	ENST00000466245	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	12.72	□□□□□ -0.37
TTLL3-223	ENST00000466245	UTY	O14607	1347 aa		12.72	□□□□□ -0.37
TTLL3-223	ENST00000466245	CSF1R	P07333	972 aa		12.72	□□□□□ -0.37
TTLL3-223	ENST00000466245	CTSW	P56202	376 aa		12.72	□□□□□ -0.37
TTLL3-223	ENST00000466245	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	12.72	□□□□□ -0.37
TTLL3-223	ENST00000466245	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	12.72	□□□□□ -0.37
TTLL3-223	ENST00000466245	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	12.72	□□□□□ -0.37
TTLL3-223	ENST00000466245	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		12.72	□□□□□ -0.37
TTLL3-223	ENST00000466245	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		12.72	□□□□□ -0.37
TTLL3-223	ENST00000466245	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		12.72	□□□□□ -0.37
TTLL3-223	ENST00000466245	FBXW7	Q969H0	707 aa		12.72	□□□□□ -0.37
TTLL3-223	ENST00000466245	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		12.72	□□□□□ -0.37
TTLL3-223	ENST00000466245	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	12.71	□□□□□ -0.37
TTLL3-223	ENST00000466245	COL4A1	P02462	1669 aa		12.71	□□□□□ -0.37
TTLL3-223	ENST00000466245	KIF16B	Q96L93	1317 aa		12.71	□□□□□ -0.37
TTLL3-223	ENST00000466245	INHBE	P58166	350 aa		12.71	□□□□□ -0.37
TTLL3-223	ENST00000466245	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		12.71	□□□□□ -0.37
TTLL3-223	ENST00000466245	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		12.71	□□□□□ -0.37
TTLL3-223	ENST00000466245	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	12.71	□□□□□ -0.37
TTLL3-223	ENST00000466245	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		12.71	□□□□□ -0.37
TTLL3-223	ENST00000466245	TRIM17	Q9Y577	477 aa		12.71	□□□□□ -0.37
TTLL3-223	ENST00000466245	SPEF2	Q9C093	1822 aa		12.7	□□□□□ -0.38
TTLL3-223	ENST00000466245	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	12.7	□□□□□ -0.38
TTLL3-223	ENST00000466245		F6X3S4	739 aa		12.7	□□□□□ -0.38
TTLL3-223	ENST00000466245	GRM8	O00222	908 aa		12.7	□□□□□ -0.38
TTLL3-223	ENST00000466245	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	12.7	□□□□□ -0.38
TTLL3-223	ENST00000466245	MOB2	Q70IA6	237 aa		12.7	□□□□□ -0.38
TTLL3-223	ENST00000466245	ERO1A	Q96HE7	468 aa		12.7	□□□□□ -0.38
TTLL3-223	ENST00000466245	GML	Q99445	158 aa		12.7	□□□□□ -0.38
TTLL3-223	ENST00000466245	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		12.7	□□□□□ -0.38
TTLL3-223	ENST00000466245		A0A1B0GUL6	1792 aa		12.7	□□□□□ -0.38
TTLL3-223	ENST00000466245	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	12.7	□□□□□ -0.38
TTLL3-223	ENST00000466245	MED23	Q9ULK4	1368 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TTLL3-223	ENST00000466245	ARHGEF6	Q15052	776 aa		12.69	□□□□□ -0.38
TTLL3-223	ENST00000466245	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		12.69	□□□□□ -0.38

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