RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465957.1

HPS1-207, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene HPS1, Length 922 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-207ENST00000465957 SAPCD2Q86UD0 394 aa20.66■□□□□ 0.9
HPS1-207ENST00000465957 TNS4Q8IZW8 715 aa20.66■□□□□ 0.9
HPS1-207ENST00000465957 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
HPS1-207ENST00000465957 SSH1Q8WYL5 1049 aa20.66■□□□□ 0.9
HPS1-207ENST00000465957 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa20.65■□□□□ 0.9
HPS1-207ENST00000465957 USP17L3A6NCW0 530 aa20.65■□□□□ 0.9
HPS1-207ENST00000465957 USP17L4A6NCW7 530 aa20.65■□□□□ 0.9
HPS1-207ENST00000465957 ADM5C9JUS6 153 aa20.65■□□□□ 0.9
HPS1-207ENST00000465957 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
HPS1-207ENST00000465957 USP17L1Q7RTZ2 530 aa20.65■□□□□ 0.9
HPS1-207ENST00000465957 KRT26Q7Z3Y9 468 aa20.65■□□□□ 0.9
HPS1-207ENST00000465957 AGBL3Q8NEM8 1001 aa20.65■□□□□ 0.9
HPS1-207ENST00000465957 AIDAQ96BJ3 306 aa20.65■□□□□ 0.9
HPS1-207ENST00000465957 GMLQ99445 158 aa20.65■□□□□ 0.9
HPS1-207ENST00000465957 MXD3Q9BW11 206 aa20.65■□□□□ 0.9
HPS1-207ENST00000465957 ANKRD2Q9GZV1 360 aa20.65■□□□□ 0.9
HPS1-207ENST00000465957 LEMD3Q9Y2U8 911 aa20.65■□□□□ 0.9
HPS1-207ENST00000465957 CHMP3Q9Y3E7 222 aa20.65■□□□□ 0.9
HPS1-207ENST00000465957 ZNF804BA4D1E1 1349 aa20.64■□□□□ 0.89
HPS1-207ENST00000465957 SNAP23O00161 211 aa20.64■□□□□ 0.89
HPS1-207ENST00000465957 GRM8O00222 908 aa20.64■□□□□ 0.89
HPS1-207ENST00000465957 KCNA4P22459 653 aa20.64■□□□□ 0.89
HPS1-207ENST00000465957 CHRNDQ07001 517 aa20.64■□□□□ 0.89
HPS1-207ENST00000465957 LMBR1LQ6UX01 489 aa20.64■□□□□ 0.89
HPS1-207ENST00000465957 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
HPS1-207ENST00000465957 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
HPS1-207ENST00000465957 ZBED9Q6R2W3 1325 aa20.63■□□□□ 0.89
HPS1-207ENST00000465957 USP17L8P0C7I0 530 aa20.63■□□□□ 0.89
HPS1-207ENST00000465957 ECE1P42892 770 aa20.63■□□□□ 0.89
HPS1-207ENST00000465957 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
HPS1-207ENST00000465957 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
HPS1-207ENST00000465957 FBXW7Q969H0 707 aa20.63■□□□□ 0.89
HPS1-207ENST00000465957 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa20.63■□□□□ 0.89
HPS1-207ENST00000465957 GGA3Q9NZ52 723 aa20.63■□□□□ 0.89
HPS1-207ENST00000465957 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
HPS1-207ENST00000465957 PSME4Q14997 1843 aa20.62■□□□□ 0.89
HPS1-207ENST00000465957 AOC2O75106 756 aa20.62■□□□□ 0.89
HPS1-207ENST00000465957 TAF5LO75529 589 aa20.62■□□□□ 0.89
HPS1-207ENST00000465957 SCARF1Q14162 830 aa20.62■□□□□ 0.89
HPS1-207ENST00000465957 DACT2Q5SW24 774 aa20.62■□□□□ 0.89
HPS1-207ENST00000465957 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
HPS1-207ENST00000465957 COA1Q9GZY4 146 aa20.62■□□□□ 0.89
HPS1-207ENST00000465957 ZNF609O15014 1411 aa20.61■□□□□ 0.89
HPS1-207ENST00000465957 ALDH1L1O75891 902 aa20.61■□□□□ 0.89
HPS1-207ENST00000465957 KCNJ4P48050 445 aa20.61■□□□□ 0.89
HPS1-207ENST00000465957 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
HPS1-207ENST00000465957 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
HPS1-207ENST00000465957 MYOZ2Q9NPC6 264 aa20.61■□□□□ 0.89
HPS1-207ENST00000465957 LBX1P52954 281 aa20.6■□□□□ 0.89
HPS1-207ENST00000465957 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
HPS1-207ENST00000465957 CAPN15O75808 1086 aa20.59■□□□□ 0.89
HPS1-207ENST00000465957 HUNKP57058 714 aa20.59■□□□□ 0.89
HPS1-207ENST00000465957 CCDC57Q2TAC2 916 aa20.59■□□□□ 0.89
HPS1-207ENST00000465957 STRIP1Q5VSL9 837 aa20.59■□□□□ 0.89
HPS1-207ENST00000465957 SULF1Q8IWU6 871 aa20.59■□□□□ 0.89
HPS1-207ENST00000465957 KAZALD1Q96I82 304 aa20.59■□□□□ 0.89
HPS1-207ENST00000465957 SUCLG2Q96I99 432 aa20.59■□□□□ 0.89
HPS1-207ENST00000465957 SMC4Q9NTJ3 1288 aa20.59■□□□□ 0.89
HPS1-207ENST00000465957 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
HPS1-207ENST00000465957 ALDH1L2Q3SY69 923 aa20.58■□□□□ 0.89
HPS1-207ENST00000465957 HHIPL1Q96JK4 782 aa20.58■□□□□ 0.89
HPS1-207ENST00000465957 PRDM10Q9NQV6 1147 aa20.58■□□□□ 0.89
HPS1-207ENST00000465957 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
HPS1-207ENST00000465957 IRS2Q9Y4H2 1338 aa20.57■□□□□ 0.88
HPS1-207ENST00000465957 THSD7BQ9C0I4 1608 aa20.57■□□□□ 0.88
HPS1-207ENST00000465957 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
HPS1-207ENST00000465957 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
HPS1-207ENST00000465957 RARSP54136 660 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
HPS1-207ENST00000465957 GTF2IP78347 998 aa20.57■□□□□ 0.88
HPS1-207ENST00000465957 NBPF9Q3BBW0 867 aa20.57■□□□□ 0.88
HPS1-207ENST00000465957 TAF7LQ5H9L4 462 aa20.57■□□□□ 0.88
HPS1-207ENST00000465957 TTLL5Q6EMB2 1281 aa20.57■□□□□ 0.88
HPS1-207ENST00000465957 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa20.57■□□□□ 0.88
HPS1-207ENST00000465957 CDCA5Q96FF9 252 aa20.57■□□□□ 0.88
HPS1-207ENST00000465957 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
HPS1-207ENST00000465957 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
HPS1-207ENST00000465957 PLIN1O60240 522 aa20.56■□□□□ 0.88
HPS1-207ENST00000465957 MAP2K2P36507 400 aa20.56■□□□□ 0.88
HPS1-207ENST00000465957 ZIC5Q96T25 663 aa20.56■□□□□ 0.88
HPS1-207ENST00000465957 CD209Q9NNX6 404 aa20.56■□□□□ 0.88
HPS1-207ENST00000465957 CNNM1Q9NRU3 951 aa20.56■□□□□ 0.88
HPS1-207ENST00000465957 OGFOD1Q8N543 542 aa20.55■□□□□ 0.88
HPS1-207ENST00000465957 C2orf69Q8N8R5 385 aa20.55■□□□□ 0.88
HPS1-207ENST00000465957 MYO3BQ8WXR4 1341 aa20.54■□□□□ 0.88
HPS1-207ENST00000465957 KIAA0825Q8IV33 1275 aa20.54■□□□□ 0.88
HPS1-207ENST00000465957 BEGAINQ9BUH8 593 aa20.54■□□□□ 0.88
HPS1-207ENST00000465957 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
HPS1-207ENST00000465957 TSKSQ9UJT2 592 aa20.54■□□□□ 0.88
HPS1-207ENST00000465957 UTYO14607 1347 aa20.53■□□□□ 0.88
HPS1-207ENST00000465957 PTPRCP08575 1304 aa20.53■□□□□ 0.88
HPS1-207ENST00000465957 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
HPS1-207ENST00000465957 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
HPS1-207ENST00000465957 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
HPS1-207ENST00000465957 A0A1B0GUL6 1792 aa20.53■□□□□ 0.88
HPS1-207ENST00000465957 WNT10BO00744 389 aa20.52■□□□□ 0.88
HPS1-207ENST00000465957 SASH1O94885 1247 aa20.52■□□□□ 0.88
HPS1-207ENST00000465957 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa20.52■□□□□ 0.88
HPS1-207ENST00000465957 RGMBQ6NW40 437 aa20.52■□□□□ 0.88
HPS1-207ENST00000465957 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa20.52■□□□□ 0.87
HPS1-207ENST00000465957 BCAR3O75815 825 aa20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms