RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460041.5

HOXB-AS3-202, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3

Gene HOXB-AS3, Length 728 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-202ENST00000460041 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CSRNP1Q96S65 589 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-202ENST00000460041 STK31Q9BXU1 1019 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MINPP1Q9UNW1 487 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MYO3BQ8WXR4 1341 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ECM29Q5VYK3 1845 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-202ENST00000460041 NEURL1BA8MQ27 555 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-202ENST00000460041 H7C1W4 665 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CCT4P50991 539 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PLA2G12BQ9BX93 195 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GREM2Q9H772 168 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RNF186Q9NXI6 227 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-202ENST00000460041 DACT2Q5SW24 774 aa13.18□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-202ENST00000460041 STRIP1Q5VSL9 837 aa13.18□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RASAL3Q86YV0 1011 aa13.18□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-202ENST00000460041 COA1Q9GZY4 146 aa13.18□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-202ENST00000460041 LEMD3Q9Y2U8 911 aa13.18□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-202ENST00000460041 A0A1B0GUL6 1792 aa13.17□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-202ENST00000460041 IL16Q14005 1332 aa13.17□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TRPA1O75762 1119 aa13.17□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-202ENST00000460041 OGFOD1Q8N543 542 aa13.17□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-202ENST00000460041 LAMB1P07942 1786 aa13.17□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-202ENST00000460041 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CSF1RP07333 972 aa13.16□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-202ENST00000460041 WWC1Q8IX03 1113 aa13.16□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ANKRD2Q9GZV1 360 aa13.16□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-202ENST00000460041 WNT10BO00744 389 aa13.15□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SLC34A2O95436 690 aa13.15□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SLC4A2P04920 1241 aa13.15□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-202ENST00000460041 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CASP7P55210 303 aa13.15□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GCKRQ14397 625 aa13.15□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-202ENST00000460041 NBPF9Q3BBW0 867 aa13.15□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-202ENST00000460041 G2E3Q7L622 706 aa13.15□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-202ENST00000460041 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa13.15□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CENPFP49454 3210 aa13.15□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZNF804BA4D1E1 1349 aa13.14□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-202ENST00000460041 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TXNRD3Q86VQ6 643 aa13.14□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-202ENST00000460041 LINS1Q8NG48 757 aa13.14□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MYH16Q9H6N6 1097 aa13.14□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-202ENST00000460041 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ITGA6P23229 1130 aa13.13□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-202ENST00000460041 NF2P35240 595 aa13.13□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TM4SF4P48230 202 aa13.13□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-202ENST00000460041 FLIIQ13045 1269 aa13.13□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TTLL5Q6EMB2 1281 aa13.13□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MPHOSPH8Q99549 860 aa13.13□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-202ENST00000460041 HTTP42858 3142 aa13.12□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-202ENST00000460041 UBE2Q2LH0YL09 131 aa13.12□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-202ENST00000460041 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-202ENST00000460041 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-202ENST00000460041 DNAAF4Q8WXU2 420 aa13.12□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MXD3Q9BW11 206 aa13.12□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CFHR5Q9BXR6 569 aa13.12□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-202ENST00000460041 HDAC9Q9UKV0 1011 aa13.12□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-202ENST00000460041 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CCDC184Q52MB2 194 aa13.11□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MOB2Q70IA6 237 aa13.11□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MTMR14Q8NCE2 650 aa13.11□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-202ENST00000460041 IRS2Q9Y4H2 1338 aa13.11□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-202ENST00000460041 BRCA2P51587 3418 aa13.1□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa13.1□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-202ENST00000460041 VAMP4O75379 141 aa13.1□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CHRNDQ07001 517 aa13.1□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa13.1□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ARMC9Q7Z3E5 817 aa13.1□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-202ENST00000460041 WDR63Q8IWG1 891 aa13.1□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CD209Q9NNX6 404 aa13.1□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-202ENST00000460041 FANCIQ9NVI1 1328 aa13.1□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-202ENST00000460041 UNCXA6NJT0 531 aa13.09□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SASH1O94885 1247 aa13.09□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-202ENST00000460041 KLRK1P26718 216 aa13.09□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-202ENST00000460041 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GTF2IP78347 998 aa13.09□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SREBF2Q12772 1141 aa13.09□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-202ENST00000460041 LDLRAD1Q5T700 205 aa13.09□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-202ENST00000460041 KIAA0825Q8IV33 1275 aa13.09□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-202ENST00000460041 FBXW7Q969H0 707 aa13.09□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-202ENST00000460041 IL1R1P14778 569 aa13.08□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-202ENST00000460041 KCNJ4P48050 445 aa13.08□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-202ENST00000460041 FOXO4P98177 505 aa13.08□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MAP3K11Q16584 847 aa13.08□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa13.08□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TBC1D8O95759 1140 aa13.07□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-202ENST00000460041 INHBEP58166 350 aa13.07□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-202ENST00000460041 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
HOXB-AS3-202ENST00000460041 DLGAP5Q15398 846 aa13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms