RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452979.5

HERC3-207, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 3

Gene HERC3, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-207ENST00000452979 MMP14P50281 582 aa15.03■□□□□ -0
HERC3-207ENST00000452979 CTSWP56202 376 aa15.03■□□□□ -0
HERC3-207ENST00000452979 DACT2Q5SW24 774 aa15.03■□□□□ -0
HERC3-207ENST00000452979 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
HERC3-207ENST00000452979 SPEF2Q9C093 1822 aa15.03■□□□□ -0
HERC3-207ENST00000452979 TM4SF4P48230 202 aa15.02■□□□□ -0
HERC3-207ENST00000452979 NBPF9Q3BBW0 867 aa15.02■□□□□ -0
HERC3-207ENST00000452979 STRIP1Q5VSL9 837 aa15.02■□□□□ -0
HERC3-207ENST00000452979 MYO3BQ8WXR4 1341 aa15.01□□□□□ -0.01
HERC3-207ENST00000452979 PI4KAP2A4QPH2 592 aa15.01□□□□□ -0.01
HERC3-207ENST00000452979 UBE2Q2LH0YL09 131 aa15.01□□□□□ -0.01
HERC3-207ENST00000452979 CCT4P50991 539 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
HERC3-207ENST00000452979 MOB2Q70IA6 237 aa15.01□□□□□ -0.01
HERC3-207ENST00000452979 OGFOD1Q8N543 542 aa15.01□□□□□ -0.01
HERC3-207ENST00000452979 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa15.01□□□□□ -0.01
HERC3-207ENST00000452979 COA1Q9GZY4 146 aa15.01□□□□□ -0.01
HERC3-207ENST00000452979 GREM2Q9H772 168 aa15.01□□□□□ -0.01
HERC3-207ENST00000452979 H7C1W4 665 aa15□□□□□ -0.01
HERC3-207ENST00000452979 WNT10BO00744 389 aa15□□□□□ -0.01
HERC3-207ENST00000452979 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
HERC3-207ENST00000452979 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
HERC3-207ENST00000452979 TSPYL6Q8N831 410 aa15□□□□□ -0.01
HERC3-207ENST00000452979 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
HERC3-207ENST00000452979 LEMD3Q9Y2U8 911 aa15□□□□□ -0.01
HERC3-207ENST00000452979 NEURL1BA8MQ27 555 aa14.99□□□□□ -0.01
HERC3-207ENST00000452979 SOX10P56693 466 aa14.99□□□□□ -0.01
HERC3-207ENST00000452979 NEXNQ0ZGT2 675 aa14.99□□□□□ -0.01
HERC3-207ENST00000452979 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa14.99□□□□□ -0.01
HERC3-207ENST00000452979 MXD3Q9BW11 206 aa14.99□□□□□ -0.01
HERC3-207ENST00000452979 PCDH10Q9P2E7 1040 aa14.99□□□□□ -0.01
HERC3-207ENST00000452979 TXNRD3Q86VQ6 643 aa14.98□□□□□ -0.01
HERC3-207ENST00000452979 PLA2G12BQ9BX93 195 aa14.98□□□□□ -0.01
HERC3-207ENST00000452979 CFHR5Q9BXR6 569 aa14.98□□□□□ -0.01
HERC3-207ENST00000452979 HPS5Q9UPZ3 1129 aa14.98□□□□□ -0.01
HERC3-207ENST00000452979 TBC1D8O95759 1140 aa14.97□□□□□ -0.01
HERC3-207ENST00000452979 CSF1RP07333 972 aa14.97□□□□□ -0.01
HERC3-207ENST00000452979 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
HERC3-207ENST00000452979 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
HERC3-207ENST00000452979 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
HERC3-207ENST00000452979 STK31Q9BXU1 1019 aa14.97□□□□□ -0.01
HERC3-207ENST00000452979 ANKRD2Q9GZV1 360 aa14.97□□□□□ -0.01
HERC3-207ENST00000452979 ZNF804BA4D1E1 1349 aa14.96□□□□□ -0.01
HERC3-207ENST00000452979 NF2P35240 595 aa14.96□□□□□ -0.01
HERC3-207ENST00000452979 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
HERC3-207ENST00000452979 CCDC27Q2M243 656 aa14.96□□□□□ -0.01
HERC3-207ENST00000452979 LDLRAD1Q5T700 205 aa14.96□□□□□ -0.01
HERC3-207ENST00000452979 TTLL5Q6EMB2 1281 aa14.96□□□□□ -0.01
HERC3-207ENST00000452979 G2E3Q7L622 706 aa14.96□□□□□ -0.01
HERC3-207ENST00000452979 CACNA1FO60840 1977 aa14.95□□□□□ -0.02
HERC3-207ENST00000452979 GPR25O00155 361 aa14.95□□□□□ -0.02
HERC3-207ENST00000452979 SASH1O94885 1247 aa14.95□□□□□ -0.02
HERC3-207ENST00000452979 SLC4A2P04920 1241 aa14.95□□□□□ -0.02
HERC3-207ENST00000452979 CASP7P55210 303 aa14.95□□□□□ -0.02
HERC3-207ENST00000452979 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
HERC3-207ENST00000452979 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
HERC3-207ENST00000452979 GCKRQ14397 625 aa14.95□□□□□ -0.02
HERC3-207ENST00000452979 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa14.95□□□□□ -0.02
HERC3-207ENST00000452979 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
HERC3-207ENST00000452979 HDAC9Q9UKV0 1011 aa14.95□□□□□ -0.02
HERC3-207ENST00000452979 LAMB1P07942 1786 aa14.94□□□□□ -0.02
HERC3-207ENST00000452979 ITGA6P23229 1130 aa14.94□□□□□ -0.02
HERC3-207ENST00000452979 SREBF2Q12772 1141 aa14.94□□□□□ -0.02
HERC3-207ENST00000452979 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
HERC3-207ENST00000452979 ARMC9Q7Z3E5 817 aa14.94□□□□□ -0.02
HERC3-207ENST00000452979 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HERC3-207ENST00000452979 FBXW7Q969H0 707 aa14.94□□□□□ -0.02
HERC3-207ENST00000452979 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa14.94□□□□□ -0.02
HERC3-207ENST00000452979 ECM29Q5VYK3 1845 aa14.94□□□□□ -0.02
HERC3-207ENST00000452979 IRS2Q9Y4H2 1338 aa14.93□□□□□ -0.02
HERC3-207ENST00000452979 KLRK1P26718 216 aa14.93□□□□□ -0.02
HERC3-207ENST00000452979 GTF2IP78347 998 aa14.93□□□□□ -0.02
HERC3-207ENST00000452979 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
HERC3-207ENST00000452979 KIAA0825Q8IV33 1275 aa14.93□□□□□ -0.02
HERC3-207ENST00000452979 WWC1Q8IX03 1113 aa14.93□□□□□ -0.02
HERC3-207ENST00000452979 MTMR14Q8NCE2 650 aa14.93□□□□□ -0.02
HERC3-207ENST00000452979 MPHOSPH8Q99549 860 aa14.93□□□□□ -0.02
HERC3-207ENST00000452979 CD209Q9NNX6 404 aa14.93□□□□□ -0.02
HERC3-207ENST00000452979 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
HERC3-207ENST00000452979 INHBEP58166 350 aa14.92□□□□□ -0.02
HERC3-207ENST00000452979 MAP3K11Q16584 847 aa14.92□□□□□ -0.02
HERC3-207ENST00000452979 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
HERC3-207ENST00000452979 SPRYD7Q5W111 196 aa14.92□□□□□ -0.02
HERC3-207ENST00000452979 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
HERC3-207ENST00000452979 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
HERC3-207ENST00000452979 A0A1B0GUL6 1792 aa14.92□□□□□ -0.02
HERC3-207ENST00000452979 IL16Q14005 1332 aa14.92□□□□□ -0.02
HERC3-207ENST00000452979 UNCXA6NJT0 531 aa14.91□□□□□ -0.02
HERC3-207ENST00000452979 FKTNO75072 461 aa14.91□□□□□ -0.02
HERC3-207ENST00000452979 ALDH1A1P00352 501 aa14.91□□□□□ -0.02
HERC3-207ENST00000452979 CHRNDQ07001 517 aa14.91□□□□□ -0.02
HERC3-207ENST00000452979 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
HERC3-207ENST00000452979 LINS1Q8NG48 757 aa14.91□□□□□ -0.02
HERC3-207ENST00000452979 DEFB129Q9H1M3 183 aa14.91□□□□□ -0.02
HERC3-207ENST00000452979 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa14.91□□□□□ -0.02
HERC3-207ENST00000452979 MYH16Q9H6N6 1097 aa14.91□□□□□ -0.02
HERC3-207ENST00000452979 FLIIQ13045 1269 aa14.9□□□□□ -0.02
HERC3-207ENST00000452979 PRKG1Q13976 671 aa14.9□□□□□ -0.02
HERC3-207ENST00000452979 DLGAP5Q15398 846 aa14.9□□□□□ -0.02
HERC3-207ENST00000452979 CERS5Q8N5B7 392 aa14.9□□□□□ -0.02
HERC3-207ENST00000452979 DNAAF4Q8WXU2 420 aa14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms