RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436200.2

CCDC18-AS1-210, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCDC18-AS1, Length 492 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa6.55□□□□□ -1.36
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 ANKRD33BA6NCL7 494 aa6.55□□□□□ -1.36
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 SPDYE3A6NKU9 549 aa6.55□□□□□ -1.36
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 COL8A1P27658 744 aa6.55□□□□□ -1.36
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 MAPK8P45983 427 aa6.55□□□□□ -1.36
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 BAG6P46379 1132 aa6.55□□□□□ -1.36
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa6.55□□□□□ -1.36
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 IL22RA1Q8N6P7 574 aa6.55□□□□□ -1.36
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 NPHS2Q9NP85 383 aa6.55□□□□□ -1.36
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 A0A1W2PP55 124 aa6.54□□□□□ -1.36
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 KCNMA1Q12791 1236 aa6.54□□□□□ -1.36
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 NXPE3Q969Y0 559 aa6.54□□□□□ -1.36
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 FAM229AH3BQW9 127 aa6.53□□□□□ -1.36
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 P4HBP07237 508 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 PTPRAP18433 802 aa6.53□□□□□ -1.36
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 CDC27P30260 824 aa6.53□□□□□ -1.36
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 GSK3AP49840 483 aa6.53□□□□□ -1.36
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 RASSF7Q02833 373 aa6.53□□□□□ -1.36
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 PRRT3Q5FWE3 981 aa6.53□□□□□ -1.36
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 TMCO4Q5TGY1 634 aa6.53□□□□□ -1.36
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 ILDR2Q71H61 639 aa6.53□□□□□ -1.36
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa6.53□□□□□ -1.36
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 A0A0A0MRY4 1105 aa6.52□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 FAM177BA6PVY3 158 aa6.52□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 CDC25BP30305 580 aa6.52□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 RAC1P63000 192 aa6.52□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 KIAA0319Q5VV43 1072 aa6.52□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 ASAP3Q8TDY4 903 aa6.52□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 SETDB2Q96T68 719 aa6.52□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 ADAM19Q9H013 955 aa6.52□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 EHD4Q9H223 541 aa6.52□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 LIN7BQ9HAP6 207 aa6.52□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 PPME1Q9Y570 386 aa6.52□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 PI16Q6UXB8 463 aa6.51□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 NPAS4Q8IUM7 802 aa6.51□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 CCNJLQ8IV13 435 aa6.51□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 DTWD1Q8N5C7 304 aa6.51□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 DCAF5Q96JK2 942 aa6.51□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 TCF12Q99081 682 aa6.51□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 MUC3BQ9H195 1237 aa6.51□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 NLRP2Q9NX02 1062 aa6.51□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 WWC3Q9ULE0 1092 aa6.51□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 METTL12A8MUP2 240 aa6.5□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 LINC01387J3KSC0 135 aa6.5□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 GDF11O95390 407 aa6.5□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 LDHBP07195 334 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa6.5□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 EPHA1P21709 976 aa6.5□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 ATP2B2Q01814 1243 aa6.5□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 COL19A1Q14993 1142 aa6.5□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 ALG1LQ6GMV1 187 aa6.5□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 TXNDC11Q6PKC3 985 aa6.5□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 TMEM151AQ8N4L1 468 aa6.5□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 BSNDQ8WZ55 320 aa6.5□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 ELNP15502 786 aa6.49□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 GRIA4P48058 902 aa6.49□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 CABP4P57796 275 aa6.49□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 GRM2Q14416 872 aa6.49□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 FBXO11Q86XK2 927 aa6.49□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 FBF1Q8TES7 1133 aa6.49□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 SOX13Q9UN79 622 aa6.49□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 A0A096LPE4 126 aa6.48□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 A0A1W2PPZ6 126 aa6.48□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 KRBA1A5PL33 1030 aa6.48□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 H3BRJ5 948 aa6.48□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 ERCC3P19447 782 aa6.48□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 SETDB1Q15047 1291 aa6.48□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 GRIK4Q16099 956 aa6.48□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 SPRED3Q2MJR0 410 aa6.48□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 FAM117BQ6P1L5 589 aa6.48□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 VN1R5Q7Z5H4 357 aa6.48□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 TRAK1Q9UPV9 953 aa6.48□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 FSCN2O14926 492 aa6.47□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 MAP4K3Q8IVH8 894 aa6.47□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 CARD10Q9BWT7 1032 aa6.47□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 BCO2Q9BYV7 579 aa6.47□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 ABCB6Q9NP58 842 aa6.47□□□□□ -1.37
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 APBA3O96018 575 aa6.46□□□□□ -1.38
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 IKBKEQ14164 716 aa6.46□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15 ms