RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	SULF1	Q8IWU6	871 aa		22.63	■■□□□ 1.21
MRPL28-203	ENST00000429738	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	22.63	■■□□□ 1.21
MRPL28-203	ENST00000429738	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		22.63	■■□□□ 1.21
MRPL28-203	ENST00000429738	GGA1	Q9UJY5	639 aa		22.63	■■□□□ 1.21
MRPL28-203	ENST00000429738	PSME4	Q14997	1843 aa		22.63	■■□□□ 1.21
MRPL28-203	ENST00000429738	XDH	P47989	1333 aa		22.62	■■□□□ 1.21
MRPL28-203	ENST00000429738	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	22.62	■■□□□ 1.21
MRPL28-203	ENST00000429738	RNF186	Q9NXI6	227 aa		22.62	■■□□□ 1.21
MRPL28-203	ENST00000429738		G3V3G9	751 aa		22.61	■■□□□ 1.21
MRPL28-203	ENST00000429738	TRPA1	O75762	1119 aa		22.61	■■□□□ 1.21
MRPL28-203	ENST00000429738	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		22.61	■■□□□ 1.21
MRPL28-203	ENST00000429738	CSRNP1	Q96S65	589 aa		22.6	■■□□□ 1.21
MRPL28-203	ENST00000429738	GGA3	Q9NZ52	723 aa		22.6	■■□□□ 1.21
MRPL28-203	ENST00000429738	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		22.6	■■□□□ 1.21
MRPL28-203	ENST00000429738	CSF1R	P07333	972 aa		22.59	■■□□□ 1.21
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC10A3	P09131	477 aa		22.59	■■□□□ 1.21
MRPL28-203	ENST00000429738	BEND3	Q5T5X7	828 aa		22.59	■■□□□ 1.21
MRPL28-203	ENST00000429738	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		22.59	■■□□□ 1.21
MRPL28-203	ENST00000429738	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	22.58	■■□□□ 1.21
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF609	O15014	1411 aa		22.58	■■□□□ 1.21
MRPL28-203	ENST00000429738		F6X3S4	739 aa		22.58	■■□□□ 1.21
MRPL28-203	ENST00000429738	ATP2B4	P23634	1241 aa		22.58	■■□□□ 1.21
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	22.58	■■□□□ 1.21
MRPL28-203	ENST00000429738	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	22.58	■■□□□ 1.21
MRPL28-203	ENST00000429738	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		22.58	■■□□□ 1.21
MRPL28-203	ENST00000429738	CDCA5	Q96FF9	252 aa		22.58	■■□□□ 1.21
MRPL28-203	ENST00000429738	SCARF1	Q14162	830 aa		22.57	■■□□□ 1.2
MRPL28-203	ENST00000429738	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	22.57	■■□□□ 1.2
MRPL28-203	ENST00000429738	ITGA6	P23229	1130 aa		22.56	■■□□□ 1.2
MRPL28-203	ENST00000429738	MED23	Q9ULK4	1368 aa		22.55	■■□□□ 1.2
MRPL28-203	ENST00000429738	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	22.55	■■□□□ 1.2
MRPL28-203	ENST00000429738	FKBP1B	P68106	108 aa		22.55	■■□□□ 1.2
MRPL28-203	ENST00000429738	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	22.55	■■□□□ 1.2
MRPL28-203	ENST00000429738	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	22.55	■■□□□ 1.2
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	22.54	■■□□□ 1.2
MRPL28-203	ENST00000429738	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	22.54	■■□□□ 1.2
MRPL28-203	ENST00000429738	GML	Q99445	158 aa		22.54	■■□□□ 1.2
MRPL28-203	ENST00000429738	USP17L8	P0C7I0	530 aa		22.53	■■□□□ 1.2
MRPL28-203	ENST00000429738	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	22.53	■■□□□ 1.2
MRPL28-203	ENST00000429738	PODN	Q7Z5L7	613 aa		22.53	■■□□□ 1.2
MRPL28-203	ENST00000429738	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		22.53	■■□□□ 1.2
MRPL28-203	ENST00000429738	FOXO4	P98177	505 aa		22.52	■■□□□ 1.2
MRPL28-203	ENST00000429738	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	22.52	■■□□□ 1.2
MRPL28-203	ENST00000429738	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		22.52	■■□□□ 1.2
MRPL28-203	ENST00000429738	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		22.52	■■□□□ 1.2
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A1B0GUL6	1792 aa		22.51	■■□□□ 1.19
MRPL28-203	ENST00000429738	USP17L3	A6NCW0	530 aa		22.51	■■□□□ 1.19
MRPL28-203	ENST00000429738	USP17L4	A6NCW7	530 aa		22.51	■■□□□ 1.19
MRPL28-203	ENST00000429738		E9PSI1	815 aa		22.51	■■□□□ 1.19
MRPL28-203	ENST00000429738	SOX10	P56693	466 aa		22.51	■■□□□ 1.19
MRPL28-203	ENST00000429738	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		22.51	■■□□□ 1.19
MRPL28-203	ENST00000429738	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		22.51	■■□□□ 1.19
MRPL28-203	ENST00000429738	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		22.51	■■□□□ 1.19
MRPL28-203	ENST00000429738	GRM8	O00222	908 aa		22.5	■■□□□ 1.19
MRPL28-203	ENST00000429738	ALDH1L1	O75891	902 aa		22.5	■■□□□ 1.19
MRPL28-203	ENST00000429738	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		22.5	■■□□□ 1.19
MRPL28-203	ENST00000429738	SLFN5	Q08AF3	891 aa		22.49	■■□□□ 1.19
MRPL28-203	ENST00000429738	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		22.49	■■□□□ 1.19
MRPL28-203	ENST00000429738	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		22.48	■■□□□ 1.19
MRPL28-203	ENST00000429738	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		22.48	■■□□□ 1.19
MRPL28-203	ENST00000429738	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		22.48	■■□□□ 1.19
MRPL28-203	ENST00000429738	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	22.48	■■□□□ 1.19
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		22.48	■■□□□ 1.19
MRPL28-203	ENST00000429738	CHRND	Q07001	517 aa		22.47	■■□□□ 1.19
MRPL28-203	ENST00000429738	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		22.47	■■□□□ 1.19
MRPL28-203	ENST00000429738	COA1	Q9GZY4	146 aa		22.47	■■□□□ 1.19
MRPL28-203	ENST00000429738	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		22.47	■■□□□ 1.19
MRPL28-203	ENST00000429738	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		22.46	■■□□□ 1.19
MRPL28-203	ENST00000429738	CCER2	I3L3R5	266 aa		22.46	■■□□□ 1.19
MRPL28-203	ENST00000429738	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	22.46	■■□□□ 1.19
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		22.46	■■□□□ 1.19
MRPL28-203	ENST00000429738	MOB2	Q70IA6	237 aa		22.46	■■□□□ 1.19
MRPL28-203	ENST00000429738	KLRK1	P26718	216 aa		22.45	■■□□□ 1.18
MRPL28-203	ENST00000429738	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	22.45	■■□□□ 1.18
MRPL28-203	ENST00000429738	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		22.45	■■□□□ 1.18
MRPL28-203	ENST00000429738	DACT2	Q5SW24	774 aa		22.45	■■□□□ 1.18
MRPL28-203	ENST00000429738	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		22.45	■■□□□ 1.18
MRPL28-203	ENST00000429738	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	22.45	■■□□□ 1.18
MRPL28-203	ENST00000429738	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	22.45	■■□□□ 1.18
MRPL28-203	ENST00000429738	UTY	O14607	1347 aa		22.45	■■□□□ 1.18
MRPL28-203	ENST00000429738	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		22.45	■■□□□ 1.18
MRPL28-203	ENST00000429738	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		22.44	■■□□□ 1.18
MRPL28-203	ENST00000429738	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	22.44	■■□□□ 1.18
MRPL28-203	ENST00000429738	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		22.44	■■□□□ 1.18
MRPL28-203	ENST00000429738	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		22.44	■■□□□ 1.18
MRPL28-203	ENST00000429738	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		22.44	■■□□□ 1.18
MRPL28-203	ENST00000429738	PTPRC	P08575	1304 aa		22.43	■■□□□ 1.18
MRPL28-203	ENST00000429738	TBC1D8	O95759	1140 aa		22.43	■■□□□ 1.18
MRPL28-203	ENST00000429738	TM4SF4	P48230	202 aa		22.43	■■□□□ 1.18
MRPL28-203	ENST00000429738	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		22.43	■■□□□ 1.18
MRPL28-203	ENST00000429738	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	22.43	■■□□□ 1.18
MRPL28-203	ENST00000429738	OGFOD1	Q8N543	542 aa		22.43	■■□□□ 1.18
MRPL28-203	ENST00000429738	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		22.43	■■□□□ 1.18
MRPL28-203	ENST00000429738	KAZALD1	Q96I82	304 aa		22.43	■■□□□ 1.18
MRPL28-203	ENST00000429738	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		22.43	■■□□□ 1.18
MRPL28-203	ENST00000429738	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	22.42	■■□□□ 1.18
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	22.42	■■□□□ 1.18
MRPL28-203	ENST00000429738	SUCLG2	Q96I99	432 aa		22.42	■■□□□ 1.18
MRPL28-203	ENST00000429738	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		22.41	■■□□□ 1.18
MRPL28-203	ENST00000429738	WNT10B	O00744	389 aa		22.41	■■□□□ 1.18

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