RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428253.1

MMP11-202, Transcript of matrix metallopeptidase 11, humanhuman

TSL 4

Gene MMP11, Length 537 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11-202ENST00000428253 SIRT2Q8IXJ6 389 aa22.24■■□□□ 1.15
MMP11-202ENST00000428253 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
MMP11-202ENST00000428253 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
MMP11-202ENST00000428253 NMRK2Q9NPI5 230 aa22.24■■□□□ 1.15
MMP11-202ENST00000428253 KCNQ5Q9NR82 932 aa22.24■■□□□ 1.15
MMP11-202ENST00000428253 PSME4Q14997 1843 aa22.24■■□□□ 1.15
MMP11-202ENST00000428253 COA1Q9GZY4 146 aa22.23■■□□□ 1.15
MMP11-202ENST00000428253 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
MMP11-202ENST00000428253 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
MMP11-202ENST00000428253 CIAPIN1Q6FI81 312 aa22.22■■□□□ 1.15
MMP11-202ENST00000428253 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
MMP11-202ENST00000428253 KIF3CO14782 793 aa22.21■■□□□ 1.15
MMP11-202ENST00000428253 RAD17O75943 681 aa22.21■■□□□ 1.15
MMP11-202ENST00000428253 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
MMP11-202ENST00000428253 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.21■■□□□ 1.15
MMP11-202ENST00000428253 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
MMP11-202ENST00000428253 TNIP1Q15025 636 aa22.2■■□□□ 1.14
MMP11-202ENST00000428253 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
MMP11-202ENST00000428253 CRBNQ96SW2 442 aa22.2■■□□□ 1.14
MMP11-202ENST00000428253 RRAGCQ9HB90 399 aa22.2■■□□□ 1.14
MMP11-202ENST00000428253 CD209Q9NNX6 404 aa22.2■■□□□ 1.14
MMP11-202ENST00000428253 SCN4AP35499 1836 aa22.2■■□□□ 1.14
MMP11-202ENST00000428253 PSMD14O00487 310 aa22.19■■□□□ 1.14
MMP11-202ENST00000428253 SASH1O94885 1247 aa22.19■■□□□ 1.14
MMP11-202ENST00000428253 VIL1P09327 827 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
MMP11-202ENST00000428253 IL1R1P14778 569 aa22.19■■□□□ 1.14
MMP11-202ENST00000428253 SCNN1DP51172 638 aa22.19■■□□□ 1.14
MMP11-202ENST00000428253 FBXO33Q7Z6M2 555 aa22.19■■□□□ 1.14
MMP11-202ENST00000428253 LPIN2Q92539 896 aa22.19■■□□□ 1.14
MMP11-202ENST00000428253 ZNF609O15014 1411 aa22.19■■□□□ 1.14
MMP11-202ENST00000428253 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
MMP11-202ENST00000428253 GJA3Q9Y6H8 435 aa22.18■■□□□ 1.14
MMP11-202ENST00000428253 G3V3G9 751 aa22.17■■□□□ 1.14
MMP11-202ENST00000428253 SURF6O75683 361 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
MMP11-202ENST00000428253 GYG1P46976 350 aa22.17■■□□□ 1.14
MMP11-202ENST00000428253 TFCP2Q12800 502 aa22.17■■□□□ 1.14
MMP11-202ENST00000428253 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.14
MMP11-202ENST00000428253 DCAF8Q5TAQ9 597 aa22.17■■□□□ 1.14
MMP11-202ENST00000428253 ZNF804AQ7Z570 1209 aa22.17■■□□□ 1.14
MMP11-202ENST00000428253 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
MMP11-202ENST00000428253 ATP2B3Q16720 1220 aa22.16■■□□□ 1.14
MMP11-202ENST00000428253 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
MMP11-202ENST00000428253 GMLQ99445 158 aa22.16■■□□□ 1.14
MMP11-202ENST00000428253 ARAP2Q8WZ64 1704 aa22.15■■□□□ 1.14
MMP11-202ENST00000428253 USP17L3A6NCW0 530 aa22.15■■□□□ 1.14
MMP11-202ENST00000428253 USP17L4A6NCW7 530 aa22.15■■□□□ 1.14
MMP11-202ENST00000428253 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
MMP11-202ENST00000428253 SLC5A1P13866 664 aa22.15■■□□□ 1.14
MMP11-202ENST00000428253 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
MMP11-202ENST00000428253 DACT2Q5SW24 774 aa22.15■■□□□ 1.14
MMP11-202ENST00000428253 STRIP1Q5VSL9 837 aa22.15■■□□□ 1.14
MMP11-202ENST00000428253 USP17L1Q7RTZ2 530 aa22.15■■□□□ 1.14
MMP11-202ENST00000428253 DPF2Q92785 391 aa22.15■■□□□ 1.14
MMP11-202ENST00000428253 GPRC5DQ9NZD1 345 aa22.15■■□□□ 1.14
MMP11-202ENST00000428253 IQCA1LA6NCM1 817 aa22.14■■□□□ 1.13
MMP11-202ENST00000428253 ZBTB22O15209 634 aa22.14■■□□□ 1.13
MMP11-202ENST00000428253 HMMRO75330 724 aa22.14■■□□□ 1.13
MMP11-202ENST00000428253 RPS12P25398 132 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
MMP11-202ENST00000428253 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
MMP11-202ENST00000428253 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
MMP11-202ENST00000428253 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.14■■□□□ 1.13
MMP11-202ENST00000428253 EPS15P42566 896 aa22.13■■□□□ 1.13
MMP11-202ENST00000428253 BCAMP50895 628 aa22.13■■□□□ 1.13
MMP11-202ENST00000428253 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
MMP11-202ENST00000428253 GPR108Q9NPR9 543 aa22.13■■□□□ 1.13
MMP11-202ENST00000428253 HACL1Q9UJ83 578 aa22.13■■□□□ 1.13
MMP11-202ENST00000428253 AKAP2Q9Y2D5 859 aa22.13■■□□□ 1.13
MMP11-202ENST00000428253 FAM205AQ6ZU69 1335 aa22.12■■□□□ 1.13
MMP11-202ENST00000428253 A0A1B0GUL7 405 aa22.12■■□□□ 1.13
MMP11-202ENST00000428253 TIMM10P62072 90 aa22.12■■□□□ 1.13
MMP11-202ENST00000428253 CAVIN4Q5BKX8 364 aa22.12■■□□□ 1.13
MMP11-202ENST00000428253 TTLL5Q6EMB2 1281 aa22.12■■□□□ 1.13
MMP11-202ENST00000428253 AGBL3Q8NEM8 1001 aa22.12■■□□□ 1.13
MMP11-202ENST00000428253 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa22.12■■□□□ 1.13
MMP11-202ENST00000428253 ADORA1P30542 326 aa22.11■■□□□ 1.13
MMP11-202ENST00000428253 GTF2IP78347 998 aa22.11■■□□□ 1.13
MMP11-202ENST00000428253 AAMPQ13685 434 aa22.11■■□□□ 1.13
MMP11-202ENST00000428253 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa22.1■■□□□ 1.13
MMP11-202ENST00000428253 EPHX2P34913 555 aa22.1■■□□□ 1.13
MMP11-202ENST00000428253 MXD3Q9BW11 206 aa22.1■■□□□ 1.13
MMP11-202ENST00000428253 SHTN1A0MZ66 631 aa22.09■■□□□ 1.13
MMP11-202ENST00000428253 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
MMP11-202ENST00000428253 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
MMP11-202ENST00000428253 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa22.09■■□□□ 1.13
MMP11-202ENST00000428253 CERS5Q8N5B7 392 aa22.09■■□□□ 1.13
MMP11-202ENST00000428253 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
MMP11-202ENST00000428253 TOMM70O94826 608 aa22.08■■□□□ 1.13
MMP11-202ENST00000428253 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
MMP11-202ENST00000428253 PHKA1P46020 1223 aa22.08■■□□□ 1.13
MMP11-202ENST00000428253 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
MMP11-202ENST00000428253 TNNI3KQ59H18 835 aa22.08■■□□□ 1.13
MMP11-202ENST00000428253 ERC1Q8IUD2 1116 aa22.08■■□□□ 1.13
MMP11-202ENST00000428253 MICALL2Q8IY33 904 aa22.08■■□□□ 1.13
MMP11-202ENST00000428253 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.08■■□□□ 1.13
MMP11-202ENST00000428253 XAGE2Q96GT9 111 aa22.08■■□□□ 1.13
MMP11-202ENST00000428253 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa22.08■■□□□ 1.13
MMP11-202ENST00000428253 MYO3BQ8WXR4 1341 aa22.07■■□□□ 1.12
MMP11-202ENST00000428253 POTEIP0CG38 1075 aa22.07■■□□□ 1.12
MMP11-202ENST00000428253 POTEJP0CG39 1038 aa22.07■■□□□ 1.12
MMP11-202ENST00000428253 CCDC102BQ68D86 513 aa22.07■■□□□ 1.12
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