RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427778.1

LINC00963-204, long intergenic non-protein coding RNA 963, human

TSL 2

Gene LINC00963, Length 382 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC00963-204	ENST00000427778	ALDH1L1	O75891	902 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LINC00963-204	ENST00000427778	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LINC00963-204	ENST00000427778	GPC2	Q8N158	579 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LINC00963-204	ENST00000427778	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		11.21	□□□□□ -0.61
LINC00963-204	ENST00000427778	SCN9A	Q15858	1988 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	CSF1R	P07333	972 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		11.2	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	UTY	O14607	1347 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	GRM8	O00222	908 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	SNPH	O15079	494 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	PPIP5K2	O43314	1243 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	AOC3	Q16853	763 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	NIM1K	Q8IY84	436 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	TMEM121B	Q9BXQ6	578 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	GREM2	Q9H772	168 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		11.19	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	ECE1	P42892	770 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	GPSM2	P81274	684 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	IFNL1	Q8IU54	200 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	HACL1	Q9UJ83	578 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	TSKS	Q9UJT2	592 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	ZNF609	O15014	1411 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	XDH	P47989	1333 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	EPHX2	P34913	555 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	FOXO4	P98177	505 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	GRM1	Q13255	1194 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	CNTROB	Q8N137	903 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	CAPNS2	Q96L46	248 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	POLL	Q9UGP5	575 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	KIF16B	Q96L93	1317 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	ITGA6	P23229	1130 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	11.16	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	WASHC4	Q2M389	1173 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	EYA3	Q99504	573 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	SCNN1D	P51172	638 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	CXCL9	Q07325	125 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	GGA1	Q9UJY5	639 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LINC00963-204	ENST00000427778	MED23	Q9ULK4	1368 aa		11.15	□□□□□ -0.63
LINC00963-204	ENST00000427778	YDJC	A8MPS7	323 aa		11.14	□□□□□ -0.63
LINC00963-204	ENST00000427778	C6orf229	H3BNL8	230 aa		11.14	□□□□□ -0.63
LINC00963-204	ENST00000427778	UFL1	O94874	794 aa		11.14	□□□□□ -0.63
LINC00963-204	ENST00000427778	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
LINC00963-204	ENST00000427778	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
LINC00963-204	ENST00000427778	DGKZ	Q13574	1117 aa		11.14	□□□□□ -0.63
LINC00963-204	ENST00000427778	TNIP1	Q15025	636 aa		11.14	□□□□□ -0.63
LINC00963-204	ENST00000427778	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
LINC00963-204	ENST00000427778	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		11.14	□□□□□ -0.63
LINC00963-204	ENST00000427778	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
LINC00963-204	ENST00000427778	FAM212A	Q96EL1	285 aa		11.14	□□□□□ -0.63
LINC00963-204	ENST00000427778	KAZALD1	Q96I82	304 aa		11.14	□□□□□ -0.63
LINC00963-204	ENST00000427778	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
LINC00963-204	ENST00000427778	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		11.13	□□□□□ -0.63
LINC00963-204	ENST00000427778	CA12	O43570	354 aa		11.13	□□□□□ -0.63
LINC00963-204	ENST00000427778	ATP2B4	P23634	1241 aa		11.13	□□□□□ -0.63
LINC00963-204	ENST00000427778	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
LINC00963-204	ENST00000427778	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
LINC00963-204	ENST00000427778	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		11.13	□□□□□ -0.63
LINC00963-204	ENST00000427778	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		11.13	□□□□□ -0.63
LINC00963-204	ENST00000427778	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
LINC00963-204	ENST00000427778	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
LINC00963-204	ENST00000427778	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		11.13	□□□□□ -0.63
LINC00963-204	ENST00000427778	USP44	Q9H0E7	712 aa		11.13	□□□□□ -0.63
LINC00963-204	ENST00000427778	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		11.13	□□□□□ -0.63
LINC00963-204	ENST00000427778	ECE2	O60344	883 aa		11.12	□□□□□ -0.63
LINC00963-204	ENST00000427778	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
LINC00963-204	ENST00000427778	MARVELD3	Q96A59	401 aa		11.12	□□□□□ -0.63
LINC00963-204	ENST00000427778	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		11.12	□□□□□ -0.63
LINC00963-204	ENST00000427778	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
LINC00963-204	ENST00000427778	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		11.12	□□□□□ -0.63
LINC00963-204	ENST00000427778	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		11.12	□□□□□ -0.63
LINC00963-204	ENST00000427778	AOC2	O75106	756 aa		11.11	□□□□□ -0.63

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