RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425184.5

RBM39-210, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 3

Gene RBM39, Length 526 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-210ENST00000425184 ADGRE1Q14246 886 aa7.26□□□□□ -1.25
RBM39-210ENST00000425184 MBTPS1Q14703 1052 aa7.26□□□□□ -1.25
RBM39-210ENST00000425184 IGF2-ASQ6U949 168 aa7.26□□□□□ -1.25
RBM39-210ENST00000425184 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
RBM39-210ENST00000425184 DZANK1Q9NVP4 752 aa7.26□□□□□ -1.25
RBM39-210ENST00000425184 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa7.26□□□□□ -1.25
RBM39-210ENST00000425184 SOWAHDA6NJG2 315 aa7.25□□□□□ -1.25
RBM39-210ENST00000425184 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
RBM39-210ENST00000425184 DLL1O00548 723 aa7.25□□□□□ -1.25
RBM39-210ENST00000425184 NEFLP07196 543 aa7.25□□□□□ -1.25
RBM39-210ENST00000425184 TXNRD3Q86VQ6 643 aa7.25□□□□□ -1.25
RBM39-210ENST00000425184 CITED4Q96RK1 184 aa7.25□□□□□ -1.25
RBM39-210ENST00000425184 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa7.25□□□□□ -1.25
RBM39-210ENST00000425184 LINC01387J3KSC0 135 aa7.24□□□□□ -1.25
RBM39-210ENST00000425184 ACPPP15309 386 aa7.24□□□□□ -1.25
RBM39-210ENST00000425184 DOC2BQ14184 412 aa7.24□□□□□ -1.25
RBM39-210ENST00000425184 SETDB1Q15047 1291 aa7.24□□□□□ -1.25
RBM39-210ENST00000425184 FAM117BQ6P1L5 589 aa7.24□□□□□ -1.25
RBM39-210ENST00000425184 OSMRQ99650 979 aa7.24□□□□□ -1.25
RBM39-210ENST00000425184 ADAM19Q9H013 955 aa7.24□□□□□ -1.25
RBM39-210ENST00000425184 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
RBM39-210ENST00000425184 NFKBIEO00221 500 aa7.23□□□□□ -1.25
RBM39-210ENST00000425184 FURINP09958 794 aa7.23□□□□□ -1.25
RBM39-210ENST00000425184 CDC25BP30305 580 aa7.23□□□□□ -1.25
RBM39-210ENST00000425184 CABP4P57796 275 aa7.23□□□□□ -1.25
RBM39-210ENST00000425184 TXNDC11Q6PKC3 985 aa7.23□□□□□ -1.25
RBM39-210ENST00000425184 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
RBM39-210ENST00000425184 TMC1Q8TDI8 760 aa7.23□□□□□ -1.25
RBM39-210ENST00000425184 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa7.23□□□□□ -1.25
RBM39-210ENST00000425184 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
RBM39-210ENST00000425184 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RBM39-210ENST00000425184 EPHA1P21709 976 aa7.22□□□□□ -1.25
RBM39-210ENST00000425184 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa7.22□□□□□ -1.25
RBM39-210ENST00000425184 HHIPQ96QV1 700 aa7.22□□□□□ -1.25
RBM39-210ENST00000425184 FAM129BQ96TA1 746 aa7.22□□□□□ -1.25
RBM39-210ENST00000425184 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RBM39-210ENST00000425184 TPSG1Q9NRR2 321 aa7.22□□□□□ -1.25
RBM39-210ENST00000425184 TRPA1O75762 1119 aa7.21□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 KCNA1Q09470 495 aa7.21□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 KLHL23Q8NBE8 558 aa7.21□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 NXPE3Q969Y0 559 aa7.21□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 TRAIPQ9BWF2 469 aa7.21□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 H3BRJ5 948 aa7.2□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 FSCN2O14926 492 aa7.2□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 ADAM23O75077 832 aa7.2□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 GALNT12Q8IXK2 581 aa7.2□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 GALNT11Q8NCW6 608 aa7.2□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 WFDC12Q8WWY7 111 aa7.2□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 BSNDQ8WZ55 320 aa7.2□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 WNT8BQ93098 351 aa7.2□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 DMRTB1Q96MA1 342 aa7.2□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 RBCK1Q9BYM8 510 aa7.2□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 AKTIPQ9H8T0 292 aa7.2□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 LATS2Q9NRM7 1088 aa7.2□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 NOS3P29474 1203 aa7.19□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 CD68P34810 354 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 IREB2P48200 963 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 PIP4K2BP78356 416 aa7.19□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 TMEM130Q8N3G9 435 aa7.19□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 CARD10Q9BWT7 1032 aa7.19□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 SEC31BQ9NQW1 1179 aa7.19□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 SOX13Q9UN79 622 aa7.19□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 GPR182O15218 404 aa7.18□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 ORC1Q13415 861 aa7.18□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 ASAP3Q8TDY4 903 aa7.18□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 NIF3L1Q9GZT8 377 aa7.18□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 DCTN4Q9UJW0 460 aa7.18□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa7.18□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 F8W735 103 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 ARL4DP49703 201 aa7.17□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 NKAPLQ5M9Q1 402 aa7.17□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 USPL1Q5W0Q7 1092 aa7.17□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 TP53INP1Q96A56 240 aa7.17□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 DNAJC25Q9H1X3 360 aa7.17□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 SEMA6BQ9H3T3 888 aa7.17□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 OSGEPQ9NPF4 335 aa7.17□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 A0A1W2PP55 124 aa7.16□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 TM4SF5O14894 197 aa7.16□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 ALX3O95076 343 aa7.16□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 IGHA2P01877 340 aa7.16□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 MAPK1P28482 360 aa7.16□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 IKBKEQ14164 716 aa7.16□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 TMC7Q7Z402 723 aa7.16□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 VN1R5Q7Z5H4 357 aa7.16□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 SLC7A3Q8WY07 619 aa7.16□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 C19orf57Q0VDD7 668 aa7.15□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 DUOXA2Q1HG44 320 aa7.15□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 ACAD11Q709F0 780 aa7.15□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms