RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423941.5

HDAC6-205, Transcript of histone deacetylase 6, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC6, Length 583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6-205ENST00000423941 COA1Q9GZY4 146 aa22.98■■□□□ 1.27
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HDAC6-205ENST00000423941 IL15P40933 162 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
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HDAC6-205ENST00000423941 CIAPIN1Q6FI81 312 aa22.96■■□□□ 1.27
HDAC6-205ENST00000423941 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
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HDAC6-205ENST00000423941 CRBNQ96SW2 442 aa22.87■■□□□ 1.25
HDAC6-205ENST00000423941 GPR108Q9NPR9 543 aa22.87■■□□□ 1.25
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HDAC6-205ENST00000423941 EPS15P42566 896 aa22.86■■□□□ 1.25
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HDAC6-205ENST00000423941 CAVIN4Q5BKX8 364 aa22.85■■□□□ 1.25
HDAC6-205ENST00000423941 HMMRO75330 724 aa22.84■■□□□ 1.25
HDAC6-205ENST00000423941 EPHX2P34913 555 aa22.84■■□□□ 1.25
HDAC6-205ENST00000423941 BCAMP50895 628 aa22.84■■□□□ 1.25
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HDAC6-205ENST00000423941 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.83■■□□□ 1.25
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HDAC6-205ENST00000423941 MYH13Q9UKX3 1938 aa22.8■■□□□ 1.24
HDAC6-205ENST00000423941 SHTN1A0MZ66 631 aa22.8■■□□□ 1.24
HDAC6-205ENST00000423941 ADORA1P30542 326 aa22.8■■□□□ 1.24
HDAC6-205ENST00000423941 MICALL2Q8IY33 904 aa22.8■■□□□ 1.24
HDAC6-205ENST00000423941 CERS5Q8N5B7 392 aa22.8■■□□□ 1.24
HDAC6-205ENST00000423941 XAGE2Q96GT9 111 aa22.8■■□□□ 1.24
HDAC6-205ENST00000423941 MXD3Q9BW11 206 aa22.8■■□□□ 1.24
HDAC6-205ENST00000423941 TNNI3KQ59H18 835 aa22.79■■□□□ 1.24
HDAC6-205ENST00000423941 VPS37DQ86XT2 251 aa22.79■■□□□ 1.24
HDAC6-205ENST00000423941 ERC1Q8IUD2 1116 aa22.79■■□□□ 1.24
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