RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421019.1

SMIM25-201, Transcript of small integral membrane protein 25, humanhuman

TSL 2

Gene SMIM25, Length 686 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM25-201ENST00000421019 NF2P35240 595 aa14.03□□□□□ -0.16
SMIM25-201ENST00000421019 CCT4P50991 539 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
SMIM25-201ENST00000421019 STRIP1Q5VSL9 837 aa14.03□□□□□ -0.16
SMIM25-201ENST00000421019 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa14.03□□□□□ -0.16
SMIM25-201ENST00000421019 COA1Q9GZY4 146 aa14.03□□□□□ -0.16
SMIM25-201ENST00000421019 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP14.03□□□□□ -0.16
SMIM25-201ENST00000421019 MED23Q9ULK4 1368 aa14.03□□□□□ -0.16
SMIM25-201ENST00000421019 IGKV5-2P06315 115 aa14.02□□□□□ -0.17
SMIM25-201ENST00000421019 SOX10P56693 466 aa14.02□□□□□ -0.17
SMIM25-201ENST00000421019 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP14.02□□□□□ -0.17
SMIM25-201ENST00000421019 NBPF9Q3BBW0 867 aa14.02□□□□□ -0.17
SMIM25-201ENST00000421019 DACT2Q5SW24 774 aa14.02□□□□□ -0.17
SMIM25-201ENST00000421019 MOB2Q70IA6 237 aa14.02□□□□□ -0.17
SMIM25-201ENST00000421019 STK31Q9BXU1 1019 aa14.02□□□□□ -0.17
SMIM25-201ENST00000421019 GREM2Q9H772 168 aa14.02□□□□□ -0.17
SMIM25-201ENST00000421019 HDAC9Q9UKV0 1011 aa14.02□□□□□ -0.17
SMIM25-201ENST00000421019 LEMD3Q9Y2U8 911 aa14.02□□□□□ -0.17
SMIM25-201ENST00000421019 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP14.01□□□□□ -0.17
SMIM25-201ENST00000421019 WNT10BO00744 389 aa14.01□□□□□ -0.17
SMIM25-201ENST00000421019 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP14.01□□□□□ -0.17
SMIM25-201ENST00000421019 TM4SF4P48230 202 aa14.01□□□□□ -0.17
SMIM25-201ENST00000421019 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa14.01□□□□□ -0.17
SMIM25-201ENST00000421019 TSPYL6Q8N831 410 aa14.01□□□□□ -0.17
SMIM25-201ENST00000421019 PCDH10Q9P2E7 1040 aa14.01□□□□□ -0.17
SMIM25-201ENST00000421019 H7C1W4 665 aa14□□□□□ -0.17
SMIM25-201ENST00000421019 TBC1D8O95759 1140 aa14□□□□□ -0.17
SMIM25-201ENST00000421019 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
SMIM25-201ENST00000421019 TTLL5Q6EMB2 1281 aa14□□□□□ -0.17
SMIM25-201ENST00000421019 ARMC9Q7Z3E5 817 aa14□□□□□ -0.17
SMIM25-201ENST00000421019 FBXW7Q969H0 707 aa14□□□□□ -0.17
SMIM25-201ENST00000421019 ANKRD2Q9GZV1 360 aa14□□□□□ -0.17
SMIM25-201ENST00000421019 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
SMIM25-201ENST00000421019 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa14□□□□□ -0.17
SMIM25-201ENST00000421019 AKAP11Q9UKA4 1901 aa14□□□□□ -0.17
SMIM25-201ENST00000421019 NEURL1BA8MQ27 555 aa13.99□□□□□ -0.17
SMIM25-201ENST00000421019 SREBF2Q12772 1141 aa13.99□□□□□ -0.17
SMIM25-201ENST00000421019 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
SMIM25-201ENST00000421019 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
SMIM25-201ENST00000421019 MXD3Q9BW11 206 aa13.99□□□□□ -0.17
SMIM25-201ENST00000421019 HPS5Q9UPZ3 1129 aa13.99□□□□□ -0.17
SMIM25-201ENST00000421019 ZNF804BA4D1E1 1349 aa13.98□□□□□ -0.17
SMIM25-201ENST00000421019 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
SMIM25-201ENST00000421019 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa13.98□□□□□ -0.17
SMIM25-201ENST00000421019 TXNRD3Q86VQ6 643 aa13.98□□□□□ -0.17
SMIM25-201ENST00000421019 MPHOSPH8Q99549 860 aa13.98□□□□□ -0.17
SMIM25-201ENST00000421019 PLA2G12BQ9BX93 195 aa13.98□□□□□ -0.17
SMIM25-201ENST00000421019 GPR25O00155 361 aa13.97□□□□□ -0.17
SMIM25-201ENST00000421019 SLC4A2P04920 1241 aa13.97□□□□□ -0.17
SMIM25-201ENST00000421019 ITGA6P23229 1130 aa13.97□□□□□ -0.17
SMIM25-201ENST00000421019 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
SMIM25-201ENST00000421019 MYH16Q9H6N6 1097 aa13.97□□□□□ -0.17
SMIM25-201ENST00000421019 SASH1O94885 1247 aa13.96□□□□□ -0.17
SMIM25-201ENST00000421019 CSF1RP07333 972 aa13.96□□□□□ -0.17
SMIM25-201ENST00000421019 KCNJ4P48050 445 aa13.96□□□□□ -0.17
SMIM25-201ENST00000421019 GTF2IP78347 998 aa13.96□□□□□ -0.17
SMIM25-201ENST00000421019 GCKRQ14397 625 aa13.96□□□□□ -0.17
SMIM25-201ENST00000421019 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
SMIM25-201ENST00000421019 LDLRAD1Q5T700 205 aa13.96□□□□□ -0.17
SMIM25-201ENST00000421019 KIAA0825Q8IV33 1275 aa13.96□□□□□ -0.17
SMIM25-201ENST00000421019 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
SMIM25-201ENST00000421019 CFHR5Q9BXR6 569 aa13.96□□□□□ -0.17
SMIM25-201ENST00000421019 PSME4Q14997 1843 aa13.95□□□□□ -0.18
SMIM25-201ENST00000421019 FKTNO75072 461 aa13.95□□□□□ -0.18
SMIM25-201ENST00000421019 ALDH1A1P00352 501 aa13.95□□□□□ -0.18
SMIM25-201ENST00000421019 INHBEP58166 350 aa13.95□□□□□ -0.18
SMIM25-201ENST00000421019 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
SMIM25-201ENST00000421019 DLGAP5Q15398 846 aa13.95□□□□□ -0.18
SMIM25-201ENST00000421019 CCDC27Q2M243 656 aa13.95□□□□□ -0.18
SMIM25-201ENST00000421019 CCDC184Q52MB2 194 aa13.95□□□□□ -0.18
SMIM25-201ENST00000421019 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
SMIM25-201ENST00000421019 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP13.95□□□□□ -0.18
SMIM25-201ENST00000421019 G2E3Q7L622 706 aa13.95□□□□□ -0.18
SMIM25-201ENST00000421019 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
SMIM25-201ENST00000421019 CD209Q9NNX6 404 aa13.95□□□□□ -0.18
SMIM25-201ENST00000421019 CASP7P55210 303 aa13.94□□□□□ -0.18
SMIM25-201ENST00000421019 CHRNDQ07001 517 aa13.94□□□□□ -0.18
SMIM25-201ENST00000421019 PRKG1Q13976 671 aa13.94□□□□□ -0.18
SMIM25-201ENST00000421019 SPRYD7Q5W111 196 aa13.94□□□□□ -0.18
SMIM25-201ENST00000421019 LINS1Q8NG48 757 aa13.94□□□□□ -0.18
SMIM25-201ENST00000421019 SLC10A4Q96EP9 437 aa13.94□□□□□ -0.18
SMIM25-201ENST00000421019 DEFB129Q9H1M3 183 aa13.94□□□□□ -0.18
SMIM25-201ENST00000421019 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP13.94□□□□□ -0.18
SMIM25-201ENST00000421019 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa13.93□□□□□ -0.18
SMIM25-201ENST00000421019 KLRK1P26718 216 aa13.93□□□□□ -0.18
SMIM25-201ENST00000421019 FLIIQ13045 1269 aa13.93□□□□□ -0.18
SMIM25-201ENST00000421019 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
SMIM25-201ENST00000421019 WWC1Q8IX03 1113 aa13.93□□□□□ -0.18
SMIM25-201ENST00000421019 MTMR14Q8NCE2 650 aa13.93□□□□□ -0.18
SMIM25-201ENST00000421019 DNAAF4Q8WXU2 420 aa13.93□□□□□ -0.18
SMIM25-201ENST00000421019 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa13.93□□□□□ -0.18
SMIM25-201ENST00000421019 IL16Q14005 1332 aa13.92□□□□□ -0.18
SMIM25-201ENST00000421019 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP13.92□□□□□ -0.18
SMIM25-201ENST00000421019 UNCXA6NJT0 531 aa13.92□□□□□ -0.18
SMIM25-201ENST00000421019 MYO1BO43795 1136 aa13.92□□□□□ -0.18
SMIM25-201ENST00000421019 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP13.92□□□□□ -0.18
SMIM25-201ENST00000421019 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP13.92□□□□□ -0.18
SMIM25-201ENST00000421019 MAP3K11Q16584 847 aa13.92□□□□□ -0.18
SMIM25-201ENST00000421019 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa13.92□□□□□ -0.18
SMIM25-201ENST00000421019 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
SMIM25-201ENST00000421019 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.4 ms