RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409945.1

USP40-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene USP40, Length 1,946 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-202ENST00000409945 XKR5Q6UX68 686 aa9.56□□□□□ -0.88
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USP40-202ENST00000409945 ATP10AO60312 1499 aa9.56□□□□□ -0.88
USP40-202ENST00000409945 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa9.56□□□□□ -0.88
USP40-202ENST00000409945 C9orf84Q5VXU9 1444 aa9.56□□□□□ -0.88
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USP40-202ENST00000409945 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
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USP40-202ENST00000409945 ZBTB42B2RXF5 422 aa9.47□□□□□ -0.89
USP40-202ENST00000409945 SORBS3O60504 671 aa9.47□□□□□ -0.89
USP40-202ENST00000409945 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
USP40-202ENST00000409945 OR13H1Q8NG92 308 aa9.47□□□□□ -0.89
USP40-202ENST00000409945 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa9.47□□□□□ -0.89
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