RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404040.5

HDAC11-204, Transcript of histone deacetylase 11, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HDAC11, Length 967 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11-204ENST00000404040 APAF1O14727 1248 aa23.02■■□□□ 1.28
HDAC11-204ENST00000404040 GNAI1P63096 354 aa23.02■■□□□ 1.28
HDAC11-204ENST00000404040 PODNQ7Z5L7 613 aa23.02■■□□□ 1.28
HDAC11-204ENST00000404040 CTSWP56202 376 aa23.01■■□□□ 1.27
HDAC11-204ENST00000404040 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
HDAC11-204ENST00000404040 DDX58O95786 925 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
HDAC11-204ENST00000404040 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
HDAC11-204ENST00000404040 MOB2Q70IA6 237 aa22.99■■□□□ 1.27
HDAC11-204ENST00000404040 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.99■■□□□ 1.27
HDAC11-204ENST00000404040 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
HDAC11-204ENST00000404040 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
HDAC11-204ENST00000404040 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa22.98■■□□□ 1.27
HDAC11-204ENST00000404040 NBPF9Q3BBW0 867 aa22.97■■□□□ 1.27
HDAC11-204ENST00000404040 DACT2Q5SW24 774 aa22.97■■□□□ 1.27
HDAC11-204ENST00000404040 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.97■■□□□ 1.27
HDAC11-204ENST00000404040 IGKV5-2P06315 115 aa22.96■■□□□ 1.27
HDAC11-204ENST00000404040 CCDC27Q2M243 656 aa22.96■■□□□ 1.27
HDAC11-204ENST00000404040 TTLL11Q8NHH1 800 aa22.96■■□□□ 1.27
HDAC11-204ENST00000404040 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
HDAC11-204ENST00000404040 MINPP1Q9UNW1 487 aa22.96■■□□□ 1.27
HDAC11-204ENST00000404040 MYO3BQ8WXR4 1341 aa22.96■■□□□ 1.27
HDAC11-204ENST00000404040 UBE2Q2LH0YL09 131 aa22.95■■□□□ 1.26
HDAC11-204ENST00000404040 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa22.95■■□□□ 1.26
HDAC11-204ENST00000404040 MXD3Q9BW11 206 aa22.95■■□□□ 1.26
HDAC11-204ENST00000404040 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.95■■□□□ 1.26
HDAC11-204ENST00000404040 GREM2Q9H772 168 aa22.95■■□□□ 1.26
HDAC11-204ENST00000404040 HPS5Q9UPZ3 1129 aa22.95■■□□□ 1.26
HDAC11-204ENST00000404040 CCT4P50991 539 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
HDAC11-204ENST00000404040 KSR2Q6VAB6 950 aa22.94■■□□□ 1.26
HDAC11-204ENST00000404040 OGFOD1Q8N543 542 aa22.94■■□□□ 1.26
HDAC11-204ENST00000404040 PI4KAP2A4QPH2 592 aa22.93■■□□□ 1.26
HDAC11-204ENST00000404040 WNT10BO00744 389 aa22.93■■□□□ 1.26
HDAC11-204ENST00000404040 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
HDAC11-204ENST00000404040 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
HDAC11-204ENST00000404040 STRIP1Q5VSL9 837 aa22.93■■□□□ 1.26
HDAC11-204ENST00000404040 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa22.93■■□□□ 1.26
HDAC11-204ENST00000404040 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
HDAC11-204ENST00000404040 PCDH10Q9P2E7 1040 aa22.93■■□□□ 1.26
HDAC11-204ENST00000404040 TBC1D8O95759 1140 aa22.92■■□□□ 1.26
HDAC11-204ENST00000404040 TSPYL6Q8N831 410 aa22.92■■□□□ 1.26
HDAC11-204ENST00000404040 FBXW7Q969H0 707 aa22.92■■□□□ 1.26
HDAC11-204ENST00000404040 COA1Q9GZY4 146 aa22.92■■□□□ 1.26
HDAC11-204ENST00000404040 HDAC9Q9UKV0 1011 aa22.92■■□□□ 1.26
HDAC11-204ENST00000404040 SASH1O94885 1247 aa22.91■■□□□ 1.26
HDAC11-204ENST00000404040 NF2P35240 595 aa22.91■■□□□ 1.26
HDAC11-204ENST00000404040 NEXNQ0ZGT2 675 aa22.91■■□□□ 1.26
HDAC11-204ENST00000404040 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
HDAC11-204ENST00000404040 TXNRD3Q86VQ6 643 aa22.91■■□□□ 1.26
HDAC11-204ENST00000404040 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
HDAC11-204ENST00000404040 NEURL1BA8MQ27 555 aa22.9■■□□□ 1.26
HDAC11-204ENST00000404040 TM4SF4P48230 202 aa22.9■■□□□ 1.26
HDAC11-204ENST00000404040 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
HDAC11-204ENST00000404040 MMP14P50281 582 aa22.89■■□□□ 1.25
HDAC11-204ENST00000404040 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
HDAC11-204ENST00000404040 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa22.89■■□□□ 1.25
HDAC11-204ENST00000404040 LEMD3Q9Y2U8 911 aa22.89■■□□□ 1.25
HDAC11-204ENST00000404040 OTOFQ9HC10 1997 aa22.89■■□□□ 1.25
HDAC11-204ENST00000404040 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
HDAC11-204ENST00000404040 HTTP42858 3142 aa22.88■■□□□ 1.25
HDAC11-204ENST00000404040 GPR25O00155 361 aa22.88■■□□□ 1.25
HDAC11-204ENST00000404040 KLRK1P26718 216 aa22.88■■□□□ 1.25
HDAC11-204ENST00000404040 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
HDAC11-204ENST00000404040 SREBF2Q12772 1141 aa22.88■■□□□ 1.25
HDAC11-204ENST00000404040 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
HDAC11-204ENST00000404040 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
HDAC11-204ENST00000404040 ZNF804BA4D1E1 1349 aa22.87■■□□□ 1.25
HDAC11-204ENST00000404040 WWC1Q8IX03 1113 aa22.87■■□□□ 1.25
HDAC11-204ENST00000404040 CFHR5Q9BXR6 569 aa22.87■■□□□ 1.25
HDAC11-204ENST00000404040 STK31Q9BXU1 1019 aa22.87■■□□□ 1.25
HDAC11-204ENST00000404040 H7C1W4 665 aa22.86■■□□□ 1.25
HDAC11-204ENST00000404040 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
HDAC11-204ENST00000404040 ARMC9Q7Z3E5 817 aa22.86■■□□□ 1.25
HDAC11-204ENST00000404040 KIAA0825Q8IV33 1275 aa22.86■■□□□ 1.25
HDAC11-204ENST00000404040 WDR63Q8IWG1 891 aa22.86■■□□□ 1.25
HDAC11-204ENST00000404040 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
HDAC11-204ENST00000404040 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
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HDAC11-204ENST00000404040 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
HDAC11-204ENST00000404040 TTLL5Q6EMB2 1281 aa22.85■■□□□ 1.25
HDAC11-204ENST00000404040 PLA2G12BQ9BX93 195 aa22.85■■□□□ 1.25
HDAC11-204ENST00000404040 ANKRD2Q9GZV1 360 aa22.85■■□□□ 1.25
HDAC11-204ENST00000404040 SSC5DA1L4H1 1573 aa22.84■■□□□ 1.25
HDAC11-204ENST00000404040 IL16Q14005 1332 aa22.84■■□□□ 1.25
HDAC11-204ENST00000404040 ITGA6P23229 1130 aa22.84■■□□□ 1.25
HDAC11-204ENST00000404040 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
HDAC11-204ENST00000404040 G2E3Q7L622 706 aa22.84■■□□□ 1.25
HDAC11-204ENST00000404040 PRKG1Q13976 671 aa22.83■■□□□ 1.25
HDAC11-204ENST00000404040 GCKRQ14397 625 aa22.83■■□□□ 1.25
HDAC11-204ENST00000404040 LDLRAD1Q5T700 205 aa22.83■■□□□ 1.25
HDAC11-204ENST00000404040 SPRYD7Q5W111 196 aa22.83■■□□□ 1.25
HDAC11-204ENST00000404040 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
HDAC11-204ENST00000404040 FKTNO75072 461 aa22.82■■□□□ 1.24
HDAC11-204ENST00000404040 GTF2IP78347 998 aa22.82■■□□□ 1.24
HDAC11-204ENST00000404040 MPHOSPH8Q99549 860 aa22.82■■□□□ 1.24
HDAC11-204ENST00000404040 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa22.82■■□□□ 1.24
HDAC11-204ENST00000404040 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
HDAC11-204ENST00000404040 CENPFP49454 3210 aa22.81■■□□□ 1.24
HDAC11-204ENST00000404040 CASP7P55210 303 aa22.81■■□□□ 1.24
HDAC11-204ENST00000404040 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
HDAC11-204ENST00000404040 IRS2Q9Y4H2 1338 aa22.81■■□□□ 1.24
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