RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401498.6

PKDCC-202, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 5

Gene PKDCC, Length 1,550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-202ENST00000401498 SASH1O94885 1247 aa37.29■■■■□ 3.56
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PKDCC-202ENST00000401498 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP37.29■■■■□ 3.56
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PKDCC-202ENST00000401498 GLTPD2A6NH11 291 aa37.26■■■■□ 3.56
PKDCC-202ENST00000401498 G3V3G9 751 aa37.26■■■■□ 3.56
PKDCC-202ENST00000401498 DCAF8Q5TAQ9 597 aa37.26■■■■□ 3.56
PKDCC-202ENST00000401498 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa37.26■■■■□ 3.56
PKDCC-202ENST00000401498 EIF6P56537 245 aaKnown RBP37.25■■■■□ 3.55
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PKDCC-202ENST00000401498 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP37.25■■■■□ 3.55
PKDCC-202ENST00000401498 AAMPQ13685 434 aa37.25■■■■□ 3.55
PKDCC-202ENST00000401498 DPY19L2Q6NUT2 758 aa37.25■■■■□ 3.55
PKDCC-202ENST00000401498 LPIN2Q92539 896 aa37.25■■■■□ 3.55
PKDCC-202ENST00000401498 COA1Q9GZY4 146 aa37.25■■■■□ 3.55
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PKDCC-202ENST00000401498 PODNQ7Z5L7 613 aa37.23■■■■□ 3.55
PKDCC-202ENST00000401498 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP37.23■■■■□ 3.55
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PKDCC-202ENST00000401498 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP37.22■■■■□ 3.55
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PKDCC-202ENST00000401498 AKAP2Q9Y2D5 859 aa37.2■■■■□ 3.55
PKDCC-202ENST00000401498 PSME4Q14997 1843 aa37.19■■■■□ 3.54
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PKDCC-202ENST00000401498 CIAPIN1Q6FI81 312 aa37.19■■■■□ 3.54
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP37.19■■■■□ 3.54
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PKDCC-202ENST00000401498 FBXO33Q7Z6M2 555 aa37.18■■■■□ 3.54
PKDCC-202ENST00000401498 GJA3Q9Y6H8 435 aa37.18■■■■□ 3.54
PKDCC-202ENST00000401498 KDM2BQ8NHM5 1336 aa37.18■■■■□ 3.54
PKDCC-202ENST00000401498 ARAP2Q8WZ64 1704 aa37.18■■■■□ 3.54
PKDCC-202ENST00000401498 A0A1B0GUL7 405 aa37.17■■■■□ 3.54
PKDCC-202ENST00000401498 IL1R1P14778 569 aa37.17■■■■□ 3.54
PKDCC-202ENST00000401498 PSMD14O00487 310 aa37.16■■■■□ 3.54
PKDCC-202ENST00000401498 BCAMP50895 628 aa37.16■■■■□ 3.54
PKDCC-202ENST00000401498 CAVIN4Q5BKX8 364 aa37.16■■■■□ 3.54
PKDCC-202ENST00000401498 ERC1Q8IUD2 1116 aa37.16■■■■□ 3.54
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF609O15014 1411 aa37.15■■■■□ 3.54
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PKDCC-202ENST00000401498 GPR108Q9NPR9 543 aa37.15■■■■□ 3.54
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP37.15■■■■□ 3.54
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PKDCC-202ENST00000401498 ADORA1P30542 326 aa37.14■■■■□ 3.54
PKDCC-202ENST00000401498 DCTPP1Q9H773 170 aa37.14■■■■□ 3.54
PKDCC-202ENST00000401498 VPS37DQ86XT2 251 aa37.13■■■■□ 3.53
PKDCC-202ENST00000401498 RHPN1Q8TCX5 695 aa37.13■■■■□ 3.53
PKDCC-202ENST00000401498 APBB1O00213 710 aa37.12■■■■□ 3.53
PKDCC-202ENST00000401498 TNNI3KQ59H18 835 aa37.12■■■■□ 3.53
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PKDCC-202ENST00000401498 NEUROD6Q96NK8 337 aa37.12■■■■□ 3.53
PKDCC-202ENST00000401498 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP37.12■■■■□ 3.53
PKDCC-202ENST00000401498 NMRK2Q9NPI5 230 aa37.12■■■■□ 3.53
PKDCC-202ENST00000401498 USP17L3A6NCW0 530 aa37.11■■■■□ 3.53
PKDCC-202ENST00000401498 USP17L4A6NCW7 530 aa37.11■■■■□ 3.53
PKDCC-202ENST00000401498 USP17L1Q7RTZ2 530 aa37.11■■■■□ 3.53
PKDCC-202ENST00000401498 POTECB2RU33 542 aa37.1■■■■□ 3.53
PKDCC-202ENST00000401498 TTLL5Q6EMB2 1281 aa37.09■■■■□ 3.53
PKDCC-202ENST00000401498 KIF1BPQ96EK5 621 aa37.09■■■■□ 3.53
PKDCC-202ENST00000401498 RRAGCQ9HB90 399 aa37.09■■■■□ 3.53
PKDCC-202ENST00000401498 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP37.09■■■■□ 3.53
PKDCC-202ENST00000401498 GTF2IP78347 998 aa37.08■■■■□ 3.53
PKDCC-202ENST00000401498 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP37.08■■■■□ 3.53
PKDCC-202ENST00000401498 STRIP1Q5VSL9 837 aa37.08■■■■□ 3.53
PKDCC-202ENST00000401498 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa37.08■■■■□ 3.53
PKDCC-202ENST00000401498 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP37.08■■■■□ 3.53
PKDCC-202ENST00000401498 DACT2Q5SW24 774 aa37.08■■■■□ 3.53
PKDCC-202ENST00000401498 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP37.08■■■■□ 3.53
PKDCC-202ENST00000401498 PHKA1P46020 1223 aa37.07■■■■□ 3.52
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PKDCC-202ENST00000401498 FBXW7Q969H0 707 aa37.07■■■■□ 3.52
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PKDCC-202ENST00000401498 JAG2Q9Y219 1238 aa37.04■■■■□ 3.52
PKDCC-202ENST00000401498 MYH13Q9UKX3 1938 aa37.04■■■■□ 3.52
PKDCC-202ENST00000401498 DBNDD2Q9BQY9 259 aa37.04■■■■□ 3.52
PKDCC-202ENST00000401498 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP37.04■■■■□ 3.52
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PKDCC-202ENST00000401498 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP37.02■■■■□ 3.52
PKDCC-202ENST00000401498 DPF2Q92785 391 aa37.02■■■■□ 3.52
PKDCC-202ENST00000401498 GMLQ99445 158 aa37.02■■■■□ 3.52
PKDCC-202ENST00000401498 LRRCC1Q9C099 1032 aa37.02■■■■□ 3.52
PKDCC-202ENST00000401498 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP37.02■■■■□ 3.52
PKDCC-202ENST00000401498 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP37.02■■■■□ 3.52
PKDCC-202ENST00000401498 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP37.01■■■■□ 3.52
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