RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375175.1

TMOD1-202, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMOD1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-202ENST00000375175 CLSTN2Q9H4D0 955 aa15.47■□□□□ 0.07
TMOD1-202ENST00000375175 CFAP45Q9UL16 551 aa15.47■□□□□ 0.07
TMOD1-202ENST00000375175 TNS3Q68CZ2 1445 aa15.47■□□□□ 0.07
TMOD1-202ENST00000375175 PFKFB2O60825 505 aa15.47■□□□□ 0.07
TMOD1-202ENST00000375175 CADPS2Q86UW7 1296 aa15.47■□□□□ 0.07
TMOD1-202ENST00000375175 EYA2O00167 538 aa15.46■□□□□ 0.07
TMOD1-202ENST00000375175 PTGS1P23219 599 aa15.46■□□□□ 0.07
TMOD1-202ENST00000375175 DSCC1Q9BVC3 393 aa15.46■□□□□ 0.07
TMOD1-202ENST00000375175 CBX8Q9HC52 389 aa15.46■□□□□ 0.07
TMOD1-202ENST00000375175 GPR108Q9NPR9 543 aa15.46■□□□□ 0.07
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
TMOD1-202ENST00000375175 PALLDQ8WX93 1383 aa15.46■□□□□ 0.07
TMOD1-202ENST00000375175 A0A1B0GUL7 405 aa15.46■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 PPFIA3O75145 1194 aa15.46■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 TPM3P06753 285 aa15.46■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa15.46■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 CHST3Q7LGC8 479 aa15.46■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa15.46■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 A0A0G2JLW4 131 aa15.45■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 SLFN14P0C7P3 912 aa15.45■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 DRC7Q8IY82 874 aa15.45■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 CCDC191Q8NCU4 936 aa15.45■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa15.45■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa15.45■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 E7EWF7 191 aa15.45■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP15.45■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 GORABQ5T7V8 394 aa15.45■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa15.45■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 PRDM11Q9NQV5 511 aa15.45■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 ABCC6O95255 1503 aa15.44■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 PTPDC1A2A3K4 754 aa15.44■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 CEP126Q9P2H0 1117 aa15.44■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 PKD1L3Q7Z443 1732 aa15.44■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 MAST3O60307 1309 aa15.43■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 ERVV-2B6SEH9 535 aa15.43■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 CTDNEP1O95476 244 aa15.43■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 TRIM5Q9C035 493 aa15.43■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa15.43■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF165P49910 485 aa15.43■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 GUCY1B3Q02153 619 aa15.43■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 LRMPQ12912 555 aa15.43■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 CCDC57Q2TAC2 916 aa15.43■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 TTLL5Q6EMB2 1281 aa15.43■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 DNAJC25Q9H1X3 360 aa15.43■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 LAMB4A4D0S4 1761 aa15.42■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 SMTNL1A8MU46 457 aa15.42■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 WASHC4Q2M389 1173 aa15.42■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 CCDC158Q5M9N0 1113 aa15.42■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 TTC39AQ5SRH9 613 aa15.42■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP15.42■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 M0R2C6 588 aa15.42■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 CPDO75976 1380 aa15.41■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 WDR17Q8IZU2 1322 aa15.41■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 CIAO1O76071 339 aa15.41■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 SYCP1Q15431 976 aa15.41■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 TAF7LQ5H9L4 462 aa15.41■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 KIF18AQ8NI77 898 aa15.41■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 OSBP2Q969R2 916 aa15.41■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 LAMA4Q16363 1823 aa15.41■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 ADD1P35611 737 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 HAND2P61296 217 aa15.4■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 CCDC186Q7Z3E2 898 aa15.4■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 ATG3Q9NT62 314 aa15.4■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 GLI3P10071 1580 aa15.4■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 DCCP43146 1447 aa15.4■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 TNNT1P13805 278 aa15.4■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 ADORA1P30542 326 aa15.4■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 AGXT2Q9BYV1 514 aa15.4■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 RCOR1Q9UKL0 485 aa15.4■□□□□ 0.06
TMOD1-202ENST00000375175 IL2RBP14784 551 aa15.39■□□□□ 0.05
TMOD1-202ENST00000375175 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF75DP51815 510 aa15.39■□□□□ 0.05
TMOD1-202ENST00000375175 TERF2Q15554 542 aa15.39■□□□□ 0.05
TMOD1-202ENST00000375175 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa15.39■□□□□ 0.05
TMOD1-202ENST00000375175 TICAM2Q86XR7 235 aa15.39■□□□□ 0.05
TMOD1-202ENST00000375175 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
TMOD1-202ENST00000375175 XAGE2Q96GT9 111 aa15.39■□□□□ 0.05
TMOD1-202ENST00000375175 USP28Q96RU2 1077 aa15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 97.7 ms