RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SH3BP1-201ENST00000357436 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP1-201ENST00000357436 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.14
SH3BP1-201ENST00000357436 SCARF1Q14162 830 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP1-201ENST00000357436 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC24Q8N4L8 307 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP1-201ENST00000357436 KBTBD3Q8NAB2 608 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP1-201ENST00000357436 ADCY5O95622 1261 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP1-201ENST00000357436 STK3Q13188 491 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM173BQ6P4H8 233 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP1-201ENST00000357436 TTLL11Q8NHH1 800 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP1-201ENST00000357436 GTF3C6Q969F1 213 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP1-201ENST00000357436 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP1-201ENST00000357436 TJP1Q07157 1748 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP1-201ENST00000357436 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A0G2JLW4 131 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP1-201ENST00000357436 KDM4AO75164 1064 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP1-201ENST00000357436 CYP21A2P08686 494 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP1-201ENST00000357436 IL15P40933 162 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SH3BP1-201ENST00000357436 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP1-201ENST00000357436 PALLDQ8WX93 1383 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP1-201ENST00000357436 GORABQ5T7V8 394 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP1-201ENST00000357436 SUSD4Q5VX71 490 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP1-201ENST00000357436 SH3TC1Q8TE82 1336 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP1-201ENST00000357436 GPR108Q9NPR9 543 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP1-201ENST00000357436 LAMA4Q16363 1823 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP1-201ENST00000357436 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SH3BP1-201ENST00000357436 SEC31BQ9NQW1 1179 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP1-201ENST00000357436 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SH3BP1-201ENST00000357436 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SH3BP1-201ENST00000357436 KIAA2012Q0VF49 1180 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP1-201ENST00000357436 Q6ZUG5 572 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP1-201ENST00000357436 EIF5P55010 431 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SH3BP1-201ENST00000357436 CNNM1Q9NRU3 951 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP1-201ENST00000357436 USP21Q9UK80 565 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP1-201ENST00000357436 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SH3BP1-201ENST00000357436 METTL24Q5JXM2 366 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP1-201ENST00000357436 TICAM2Q86XR7 235 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP1-201ENST00000357436 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SH3BP1-201ENST00000357436 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SH3BP1-201ENST00000357436 LIG1P18858 919 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP1-201ENST00000357436 XAGE2Q96GT9 111 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP1-201ENST00000357436 JAK2O60674 1132 aa22.14■■□□□ 1.14
SH3BP1-201ENST00000357436 CTSWP56202 376 aa22.14■■□□□ 1.14
SH3BP1-201ENST00000357436 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.14
SH3BP1-201ENST00000357436 UQCRHLA0A096LP55 91 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 UQCRHP07919 91 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC192P0DO97 292 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 HELLSQ9NRZ9 838 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 PAG1Q9NWQ8 432 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 SASS6Q6UVJ0 657 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 STOX1Q6ZVD7 989 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 LRRC2Q9BYS8 371 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 SLIT2O94813 1529 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 BCL9LQ86UU0 1499 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 SPATA32Q96LK8 384 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 CSF1RP07333 972 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 NUP62CLQ9H1M0 184 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 AP5Z1O43299 807 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 AMIGO3Q86WK7 504 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 MAP3K11Q16584 847 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 PPFIA3O75145 1194 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 RESTQ13127 1097 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 BARGINQ6ZT62 677 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 MPNDQ8N594 471 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 PIBF1Q8WXW3 757 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 BRF1Q92994 677 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 DYNC1I1O14576 645 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 TTC39AQ5SRH9 613 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 CAMTA2O94983 1202 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 ZAP70P43403 619 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 SCRN1Q12765 414 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 PFKFB2O60825 505 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 SPEF2Q9C093 1822 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 UTRNP46939 3433 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 CIAO1O76071 339 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 RBM10P98175 930 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 DACT1Q9NYF0 836 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 NRAPQ86VF7 1730 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP1-201ENST00000357436 HSPA1LP34931 641 aa22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.5 ms