RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 FSD1Q9BTV5 496 aa5.59□□□□□ -1.51
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PTPRD-201ENST00000355233 CEP170Q5SW79 1584 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 RTL9Q8NET4 1388 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 SOGA3Q5TF21 947 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
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PTPRD-201ENST00000355233 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRD-201ENST00000355233 TTC39AQ5SRH9 613 aa5.57□□□□□ -1.52
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