RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335523.7

VSTM2B-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 2B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene VSTM2B, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2B-201ENST00000335523 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa23.75■■□□□ 1.39
VSTM2B-201ENST00000335523 PODXL2Q9NZ53 605 aa23.75■■□□□ 1.39
VSTM2B-201ENST00000335523 PHKA1P46020 1223 aa23.74■■□□□ 1.39
VSTM2B-201ENST00000335523 TGFB2P61812 414 aa23.74■■□□□ 1.39
VSTM2B-201ENST00000335523 VPS37DQ86XT2 251 aa23.74■■□□□ 1.39
VSTM2B-201ENST00000335523 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
VSTM2B-201ENST00000335523 SYT17Q9BSW7 474 aa23.74■■□□□ 1.39
VSTM2B-201ENST00000335523 GGA1Q9UJY5 639 aa23.74■■□□□ 1.39
VSTM2B-201ENST00000335523 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
VSTM2B-201ENST00000335523 BCAMP50895 628 aa23.73■■□□□ 1.39
VSTM2B-201ENST00000335523 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
VSTM2B-201ENST00000335523 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP23.72■■□□□ 1.39
VSTM2B-201ENST00000335523 TICAM2Q86XR7 235 aa23.72■■□□□ 1.39
VSTM2B-201ENST00000335523 PAG1Q9NWQ8 432 aa23.72■■□□□ 1.39
VSTM2B-201ENST00000335523 SPEF2Q9C093 1822 aa23.72■■□□□ 1.39
VSTM2B-201ENST00000335523 HIP1O00291 1037 aa23.71■■□□□ 1.39
VSTM2B-201ENST00000335523 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
VSTM2B-201ENST00000335523 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
VSTM2B-201ENST00000335523 UFL1O94874 794 aa23.7■■□□□ 1.38
VSTM2B-201ENST00000335523 DPEP1P16444 411 aa23.7■■□□□ 1.38
VSTM2B-201ENST00000335523 CHMLP26374 656 aa23.7■■□□□ 1.38
VSTM2B-201ENST00000335523 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa23.7■■□□□ 1.38
VSTM2B-201ENST00000335523 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
VSTM2B-201ENST00000335523 FBXO33Q7Z6M2 555 aa23.7■■□□□ 1.38
VSTM2B-201ENST00000335523 MPNDQ8N594 471 aa23.7■■□□□ 1.38
VSTM2B-201ENST00000335523 TTLL6Q8N841 843 aa23.7■■□□□ 1.38
VSTM2B-201ENST00000335523 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
VSTM2B-201ENST00000335523 FSD1Q9BTV5 496 aa23.7■■□□□ 1.38
VSTM2B-201ENST00000335523 CD2APQ9Y5K6 639 aa23.7■■□□□ 1.38
VSTM2B-201ENST00000335523 A0A0G2JLW4 131 aa23.69■■□□□ 1.38
VSTM2B-201ENST00000335523 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
VSTM2B-201ENST00000335523 GYG1P46976 350 aa23.69■■□□□ 1.38
VSTM2B-201ENST00000335523 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa23.69■■□□□ 1.38
VSTM2B-201ENST00000335523 C6orf229H3BNL8 230 aa23.68■■□□□ 1.38
VSTM2B-201ENST00000335523 GOLIM4O00461 696 aa23.68■■□□□ 1.38
VSTM2B-201ENST00000335523 MCAMP43121 646 aa23.68■■□□□ 1.38
VSTM2B-201ENST00000335523 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
VSTM2B-201ENST00000335523 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
VSTM2B-201ENST00000335523 TBC1D16Q8TBP0 767 aa23.68■■□□□ 1.38
VSTM2B-201ENST00000335523 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
VSTM2B-201ENST00000335523 SNRKQ9NRH2 765 aa23.68■■□□□ 1.38
VSTM2B-201ENST00000335523 SEMA3EO15041 775 aa23.68■■□□□ 1.38
VSTM2B-201ENST00000335523 SCARF1Q14162 830 aa23.68■■□□□ 1.38
VSTM2B-201ENST00000335523 GRIPAP1Q4V328 841 aa23.68■■□□□ 1.38
VSTM2B-201ENST00000335523 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
VSTM2B-201ENST00000335523 KBTBD3Q8NAB2 608 aa23.68■■□□□ 1.38
VSTM2B-201ENST00000335523 SPATA5Q8NB90 893 aa23.68■■□□□ 1.38
VSTM2B-201ENST00000335523 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa23.68■■□□□ 1.38
VSTM2B-201ENST00000335523 ZAP70P43403 619 aa23.67■■□□□ 1.38
VSTM2B-201ENST00000335523 RUFY2Q8WXA3 655 aa23.67■■□□□ 1.38
VSTM2B-201ENST00000335523 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
VSTM2B-201ENST00000335523 HMG20BQ9P0W2 317 aa23.67■■□□□ 1.38
VSTM2B-201ENST00000335523 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa23.67■■□□□ 1.38
VSTM2B-201ENST00000335523 DCAF8L1A6NGE4 600 aa23.66■■□□□ 1.38
VSTM2B-201ENST00000335523 ZBTB22O15209 634 aa23.66■■□□□ 1.38
VSTM2B-201ENST00000335523 KCNA3P22001 575 aa23.66■■□□□ 1.38
VSTM2B-201ENST00000335523 ZNF804AQ7Z570 1209 aa23.66■■□□□ 1.38
VSTM2B-201ENST00000335523 PIM2Q9P1W9 311 aa23.66■■□□□ 1.38
VSTM2B-201ENST00000335523 POLLQ9UGP5 575 aa23.66■■□□□ 1.38
VSTM2B-201ENST00000335523 DENND2AQ9ULE3 1009 aa23.66■■□□□ 1.38
VSTM2B-201ENST00000335523 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
VSTM2B-201ENST00000335523 SEC24BO95487 1268 aa23.65■■□□□ 1.38
VSTM2B-201ENST00000335523 RASGRF1Q13972 1273 aa23.65■■□□□ 1.38
VSTM2B-201ENST00000335523 SLC51AQ86UW1 340 aa23.65■■□□□ 1.38
VSTM2B-201ENST00000335523 C7orf43Q8WVR3 580 aa23.65■■□□□ 1.38
VSTM2B-201ENST00000335523 KLRK1P26718 216 aa23.64■■□□□ 1.38
VSTM2B-201ENST00000335523 EYA3Q99504 573 aa23.64■■□□□ 1.38
VSTM2B-201ENST00000335523 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
VSTM2B-201ENST00000335523 IRS2Q9Y4H2 1338 aa23.64■■□□□ 1.37
VSTM2B-201ENST00000335523 RFX7Q2KHR2 1363 aa23.64■■□□□ 1.37
VSTM2B-201ENST00000335523 TXNRD3Q86VQ6 643 aa23.63■■□□□ 1.37
VSTM2B-201ENST00000335523 KLHL34Q8N239 644 aa23.63■■□□□ 1.37
VSTM2B-201ENST00000335523 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa23.63■■□□□ 1.37
VSTM2B-201ENST00000335523 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
VSTM2B-201ENST00000335523 REC8O95072 547 aa23.62■■□□□ 1.37
VSTM2B-201ENST00000335523 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
VSTM2B-201ENST00000335523 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
VSTM2B-201ENST00000335523 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa23.62■■□□□ 1.37
VSTM2B-201ENST00000335523 PI16Q6UXB8 463 aa23.62■■□□□ 1.37
VSTM2B-201ENST00000335523 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP23.62■■□□□ 1.37
VSTM2B-201ENST00000335523 ANTXR1Q9H6X2 564 aa23.62■■□□□ 1.37
VSTM2B-201ENST00000335523 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
VSTM2B-201ENST00000335523 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
VSTM2B-201ENST00000335523 WASHC4Q2M389 1173 aa23.62■■□□□ 1.37
VSTM2B-201ENST00000335523 SOGA3Q5TF21 947 aa23.62■■□□□ 1.37
VSTM2B-201ENST00000335523 OLFM4Q6UX06 510 aa23.62■■□□□ 1.37
VSTM2B-201ENST00000335523 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
VSTM2B-201ENST00000335523 ARAP2Q8WZ64 1704 aa23.61■■□□□ 1.37
VSTM2B-201ENST00000335523 MED23Q9ULK4 1368 aa23.61■■□□□ 1.37
VSTM2B-201ENST00000335523 C21orf2O43822 256 aa23.61■■□□□ 1.37
VSTM2B-201ENST00000335523 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
VSTM2B-201ENST00000335523 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
VSTM2B-201ENST00000335523 RTKN2Q8IZC4 609 aa23.61■■□□□ 1.37
VSTM2B-201ENST00000335523 SUPT20HQ8NEM7 779 aa23.61■■□□□ 1.37
VSTM2B-201ENST00000335523 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
VSTM2B-201ENST00000335523 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
VSTM2B-201ENST00000335523 CCDC93Q567U6 631 aa23.6■■□□□ 1.37
VSTM2B-201ENST00000335523 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
VSTM2B-201ENST00000335523 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
VSTM2B-201ENST00000335523 A0A1B0GUL6 1792 aa23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.7 ms