RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328886.4

TMIGD1-201, Transcript of transmembrane and immunoglobulin domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMIGD1, Length 1,201 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1-201ENST00000328886 GMLQ99445 158 aa15□□□□□ -0.01
TMIGD1-201ENST00000328886 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
TMIGD1-201ENST00000328886 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
TMIGD1-201ENST00000328886 HDAC9Q9UKV0 1011 aa15□□□□□ -0.01
TMIGD1-201ENST00000328886 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
TMIGD1-201ENST00000328886 SPEF2Q9C093 1822 aa15□□□□□ -0.01
TMIGD1-201ENST00000328886 MYO3BQ8WXR4 1341 aa14.99□□□□□ -0.01
TMIGD1-201ENST00000328886 PI4KAP2A4QPH2 592 aa14.99□□□□□ -0.01
TMIGD1-201ENST00000328886 UBE2Q2LH0YL09 131 aa14.99□□□□□ -0.01
TMIGD1-201ENST00000328886 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
TMIGD1-201ENST00000328886 CCT4P50991 539 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
TMIGD1-201ENST00000328886 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa14.99□□□□□ -0.01
TMIGD1-201ENST00000328886 TTLL11Q8NHH1 800 aa14.99□□□□□ -0.01
TMIGD1-201ENST00000328886 GREM2Q9H772 168 aa14.99□□□□□ -0.01
TMIGD1-201ENST00000328886 MINPP1Q9UNW1 487 aa14.99□□□□□ -0.01
TMIGD1-201ENST00000328886 MYH3P11055 1940 aa14.99□□□□□ -0.01
TMIGD1-201ENST00000328886 NBPF9Q3BBW0 867 aa14.98□□□□□ -0.01
TMIGD1-201ENST00000328886 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa14.98□□□□□ -0.01
TMIGD1-201ENST00000328886 MOB2Q70IA6 237 aa14.98□□□□□ -0.01
TMIGD1-201ENST00000328886 IGKV5-2P06315 115 aa14.97□□□□□ -0.01
TMIGD1-201ENST00000328886 KCNJ4P48050 445 aa14.97□□□□□ -0.01
TMIGD1-201ENST00000328886 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
TMIGD1-201ENST00000328886 DACT2Q5SW24 774 aa14.97□□□□□ -0.01
TMIGD1-201ENST00000328886 STRIP1Q5VSL9 837 aa14.97□□□□□ -0.01
TMIGD1-201ENST00000328886 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa14.97□□□□□ -0.01
TMIGD1-201ENST00000328886 MXD3Q9BW11 206 aa14.97□□□□□ -0.01
TMIGD1-201ENST00000328886 COA1Q9GZY4 146 aa14.97□□□□□ -0.01
TMIGD1-201ENST00000328886 NEURL1BA8MQ27 555 aa14.96□□□□□ -0.01
TMIGD1-201ENST00000328886 WNT10BO00744 389 aa14.96□□□□□ -0.01
TMIGD1-201ENST00000328886 SASH1O94885 1247 aa14.96□□□□□ -0.01
TMIGD1-201ENST00000328886 SREBF2Q12772 1141 aa14.96□□□□□ -0.01
TMIGD1-201ENST00000328886 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
TMIGD1-201ENST00000328886 ARMC9Q7Z3E5 817 aa14.96□□□□□ -0.01
TMIGD1-201ENST00000328886 TSPYL6Q8N831 410 aa14.96□□□□□ -0.01
TMIGD1-201ENST00000328886 MPHOSPH8Q99549 860 aa14.96□□□□□ -0.01
TMIGD1-201ENST00000328886 ANKRD2Q9GZV1 360 aa14.96□□□□□ -0.01
TMIGD1-201ENST00000328886 LEMD3Q9Y2U8 911 aa14.96□□□□□ -0.01
TMIGD1-201ENST00000328886 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
TMIGD1-201ENST00000328886 TBC1D8O95759 1140 aa14.95□□□□□ -0.02
TMIGD1-201ENST00000328886 MMP14P50281 582 aa14.95□□□□□ -0.02
TMIGD1-201ENST00000328886 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
TMIGD1-201ENST00000328886 TTLL5Q6EMB2 1281 aa14.95□□□□□ -0.02
TMIGD1-201ENST00000328886 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
TMIGD1-201ENST00000328886 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
TMIGD1-201ENST00000328886 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
TMIGD1-201ENST00000328886 HPS5Q9UPZ3 1129 aa14.95□□□□□ -0.02
TMIGD1-201ENST00000328886 ZNF804BA4D1E1 1349 aa14.94□□□□□ -0.02
TMIGD1-201ENST00000328886 PRKG1Q13976 671 aa14.94□□□□□ -0.02
TMIGD1-201ENST00000328886 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
TMIGD1-201ENST00000328886 KIAA0825Q8IV33 1275 aa14.94□□□□□ -0.02
TMIGD1-201ENST00000328886 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa14.93□□□□□ -0.02
TMIGD1-201ENST00000328886 H7C1W4 665 aa14.93□□□□□ -0.02
TMIGD1-201ENST00000328886 SLC4A2P04920 1241 aa14.93□□□□□ -0.02
TMIGD1-201ENST00000328886 ITGA6P23229 1130 aa14.93□□□□□ -0.02
TMIGD1-201ENST00000328886 GTF2IP78347 998 aa14.93□□□□□ -0.02
TMIGD1-201ENST00000328886 MYH16Q9H6N6 1097 aa14.93□□□□□ -0.02
TMIGD1-201ENST00000328886 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
TMIGD1-201ENST00000328886 TM4SF4P48230 202 aa14.92□□□□□ -0.02
TMIGD1-201ENST00000328886 TXNRD3Q86VQ6 643 aa14.92□□□□□ -0.02
TMIGD1-201ENST00000328886 GPR25O00155 361 aa14.91□□□□□ -0.02
TMIGD1-201ENST00000328886 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TMIGD1-201ENST00000328886 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TMIGD1-201ENST00000328886 GCKRQ14397 625 aa14.91□□□□□ -0.02
TMIGD1-201ENST00000328886 DLGAP5Q15398 846 aa14.91□□□□□ -0.02
TMIGD1-201ENST00000328886 G2E3Q7L622 706 aa14.91□□□□□ -0.02
TMIGD1-201ENST00000328886 PLA2G12BQ9BX93 195 aa14.91□□□□□ -0.02
TMIGD1-201ENST00000328886 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TMIGD1-201ENST00000328886 CHMP3Q9Y3E7 222 aa14.91□□□□□ -0.02
TMIGD1-201ENST00000328886 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
TMIGD1-201ENST00000328886 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
TMIGD1-201ENST00000328886 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa14.9□□□□□ -0.02
TMIGD1-201ENST00000328886 FKTNO75072 461 aa14.9□□□□□ -0.02
TMIGD1-201ENST00000328886 KLRK1P26718 216 aa14.9□□□□□ -0.02
TMIGD1-201ENST00000328886 CHRNDQ07001 517 aa14.9□□□□□ -0.02
TMIGD1-201ENST00000328886 FLIIQ13045 1269 aa14.9□□□□□ -0.02
TMIGD1-201ENST00000328886 MYO1BO43795 1136 aa14.89□□□□□ -0.03
TMIGD1-201ENST00000328886 ALDH1A1P00352 501 aa14.89□□□□□ -0.03
TMIGD1-201ENST00000328886 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TMIGD1-201ENST00000328886 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TMIGD1-201ENST00000328886 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
TMIGD1-201ENST00000328886 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa14.89□□□□□ -0.03
TMIGD1-201ENST00000328886 DNAAF4Q8WXU2 420 aa14.89□□□□□ -0.03
TMIGD1-201ENST00000328886 CD209Q9NNX6 404 aa14.89□□□□□ -0.03
TMIGD1-201ENST00000328886 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
TMIGD1-201ENST00000328886 CCDC27Q2M243 656 aa14.88□□□□□ -0.03
TMIGD1-201ENST00000328886 SPRYD7Q5W111 196 aa14.88□□□□□ -0.03
TMIGD1-201ENST00000328886 ZNF804AQ7Z570 1209 aa14.88□□□□□ -0.03
TMIGD1-201ENST00000328886 WWC1Q8IX03 1113 aa14.88□□□□□ -0.03
TMIGD1-201ENST00000328886 SLC10A4Q96EP9 437 aa14.88□□□□□ -0.03
TMIGD1-201ENST00000328886 DEFB129Q9H1M3 183 aa14.88□□□□□ -0.03
TMIGD1-201ENST00000328886 PCDH10Q9P2E7 1040 aa14.88□□□□□ -0.03
TMIGD1-201ENST00000328886 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
TMIGD1-201ENST00000328886 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
TMIGD1-201ENST00000328886 F8W031 263 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
TMIGD1-201ENST00000328886 CSF1RP07333 972 aa14.87□□□□□ -0.03
TMIGD1-201ENST00000328886 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
TMIGD1-201ENST00000328886 TAF7LQ5H9L4 462 aa14.87□□□□□ -0.03
TMIGD1-201ENST00000328886 LINS1Q8NG48 757 aa14.87□□□□□ -0.03
TMIGD1-201ENST00000328886 VEZTQ9HBM0 779 aa14.87□□□□□ -0.03
TMIGD1-201ENST00000328886 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms