RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328024.10

RAB11B-201, Transcript of RAB11B, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB11B, Length 1,751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11B-201ENST00000328024 ECE2O60344 883 aa25■■□□□ 1.59
RAB11B-201ENST00000328024 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
RAB11B-201ENST00000328024 TFCP2Q12800 502 aa24.99■■□□□ 1.59
RAB11B-201ENST00000328024 PPP4R2Q9NY27 417 aa24.99■■□□□ 1.59
RAB11B-201ENST00000328024 CEP126Q9P2H0 1117 aa24.99■■□□□ 1.59
RAB11B-201ENST00000328024 DDNO94850 711 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
RAB11B-201ENST00000328024 CXCL9Q07325 125 aa24.98■■□□□ 1.59
RAB11B-201ENST00000328024 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP24.98■■□□□ 1.59
RAB11B-201ENST00000328024 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
RAB11B-201ENST00000328024 GLTPD2A6NH11 291 aa24.98■■□□□ 1.59
RAB11B-201ENST00000328024 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa24.97■■□□□ 1.59
RAB11B-201ENST00000328024 SCN9AQ15858 1988 aa24.97■■□□□ 1.59
RAB11B-201ENST00000328024 RAD17O75943 681 aa24.96■■□□□ 1.59
RAB11B-201ENST00000328024 GYG1P46976 350 aa24.96■■□□□ 1.59
RAB11B-201ENST00000328024 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
RAB11B-201ENST00000328024 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
RAB11B-201ENST00000328024 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
RAB11B-201ENST00000328024 EIF6P56537 245 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.59
RAB11B-201ENST00000328024 COA1Q9GZY4 146 aa24.95■■□□□ 1.58
RAB11B-201ENST00000328024 CD209Q9NNX6 404 aa24.95■■□□□ 1.58
RAB11B-201ENST00000328024 G3V3G9 751 aa24.94■■□□□ 1.58
RAB11B-201ENST00000328024 HMMRO75330 724 aa24.94■■□□□ 1.58
RAB11B-201ENST00000328024 ATP2B3Q16720 1220 aa24.94■■□□□ 1.58
RAB11B-201ENST00000328024 DCAF8Q5TAQ9 597 aa24.94■■□□□ 1.58
RAB11B-201ENST00000328024 DPY19L2Q6NUT2 758 aa24.94■■□□□ 1.58
RAB11B-201ENST00000328024 LPIN2Q92539 896 aa24.94■■□□□ 1.58
RAB11B-201ENST00000328024 TIMM10P62072 90 aa24.93■■□□□ 1.58
RAB11B-201ENST00000328024 PODNQ7Z5L7 613 aa24.93■■□□□ 1.58
RAB11B-201ENST00000328024 POTECB2RU33 542 aa24.93■■□□□ 1.58
RAB11B-201ENST00000328024 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
RAB11B-201ENST00000328024 FBXO33Q7Z6M2 555 aa24.93■■□□□ 1.58
RAB11B-201ENST00000328024 GJA3Q9Y6H8 435 aa24.93■■□□□ 1.58
RAB11B-201ENST00000328024 PSMD14O00487 310 aa24.92■■□□□ 1.58
RAB11B-201ENST00000328024 BCAMP50895 628 aa24.92■■□□□ 1.58
RAB11B-201ENST00000328024 CIAPIN1Q6FI81 312 aa24.92■■□□□ 1.58
RAB11B-201ENST00000328024 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
RAB11B-201ENST00000328024 ADORA1P30542 326 aa24.91■■□□□ 1.58
RAB11B-201ENST00000328024 GPC2Q8N158 579 aa24.91■■□□□ 1.58
RAB11B-201ENST00000328024 NMRK2Q9NPI5 230 aa24.91■■□□□ 1.58
RAB11B-201ENST00000328024 SLC5A1P13866 664 aa24.9■■□□□ 1.58
RAB11B-201ENST00000328024 IL1R1P14778 569 aa24.9■■□□□ 1.58
RAB11B-201ENST00000328024 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
RAB11B-201ENST00000328024 ZNF804AQ7Z570 1209 aa24.9■■□□□ 1.58
RAB11B-201ENST00000328024 KDM2BQ8NHM5 1336 aa24.9■■□□□ 1.58
RAB11B-201ENST00000328024 A0A1B0GUL7 405 aa24.9■■□□□ 1.58
RAB11B-201ENST00000328024 RRAGCQ9HB90 399 aa24.89■■□□□ 1.57
RAB11B-201ENST00000328024 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.57
RAB11B-201ENST00000328024 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
RAB11B-201ENST00000328024 MXD3Q9BW11 206 aa24.88■■□□□ 1.57
RAB11B-201ENST00000328024 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa24.88■■□□□ 1.57
RAB11B-201ENST00000328024 AKAP2Q9Y2D5 859 aa24.88■■□□□ 1.57
RAB11B-201ENST00000328024 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
RAB11B-201ENST00000328024 ZNF609O15014 1411 aa24.88■■□□□ 1.57
RAB11B-201ENST00000328024 APBB1O00213 710 aa24.88■■□□□ 1.57
RAB11B-201ENST00000328024 VIL1P09327 827 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
RAB11B-201ENST00000328024 TNIP1Q15025 636 aa24.88■■□□□ 1.57
RAB11B-201ENST00000328024 TNNI3KQ59H18 835 aa24.88■■□□□ 1.57
RAB11B-201ENST00000328024 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
RAB11B-201ENST00000328024 DCTPP1Q9H773 170 aa24.88■■□□□ 1.57
RAB11B-201ENST00000328024 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
RAB11B-201ENST00000328024 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
RAB11B-201ENST00000328024 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa24.88■■□□□ 1.57
RAB11B-201ENST00000328024 WDR90Q96KV7 1748 aa24.87■■□□□ 1.57
RAB11B-201ENST00000328024 USP17L3A6NCW0 530 aa24.87■■□□□ 1.57
RAB11B-201ENST00000328024 USP17L4A6NCW7 530 aa24.87■■□□□ 1.57
RAB11B-201ENST00000328024 SCNN1DP51172 638 aa24.87■■□□□ 1.57
RAB11B-201ENST00000328024 AAMPQ13685 434 aa24.87■■□□□ 1.57
RAB11B-201ENST00000328024 USP17L1Q7RTZ2 530 aa24.87■■□□□ 1.57
RAB11B-201ENST00000328024 RHPN1Q8TCX5 695 aa24.87■■□□□ 1.57
RAB11B-201ENST00000328024 XAGE2Q96GT9 111 aa24.87■■□□□ 1.57
RAB11B-201ENST00000328024 GPR108Q9NPR9 543 aa24.87■■□□□ 1.57
RAB11B-201ENST00000328024 PSME4Q14997 1843 aa24.87■■□□□ 1.57
RAB11B-201ENST00000328024 GTF2IP78347 998 aa24.86■■□□□ 1.57
RAB11B-201ENST00000328024 CAVIN4Q5BKX8 364 aa24.86■■□□□ 1.57
RAB11B-201ENST00000328024 NEUROD6Q96NK8 337 aa24.86■■□□□ 1.57
RAB11B-201ENST00000328024 JAG2Q9Y219 1238 aa24.86■■□□□ 1.57
RAB11B-201ENST00000328024 ARAP2Q8WZ64 1704 aa24.86■■□□□ 1.57
RAB11B-201ENST00000328024 PHKA1P46020 1223 aa24.85■■□□□ 1.57
RAB11B-201ENST00000328024 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
RAB11B-201ENST00000328024 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa24.85■■□□□ 1.57
RAB11B-201ENST00000328024 DACT2Q5SW24 774 aa24.85■■□□□ 1.57
RAB11B-201ENST00000328024 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
RAB11B-201ENST00000328024 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa24.85■■□□□ 1.57
RAB11B-201ENST00000328024 SHTN1A0MZ66 631 aa24.85■■□□□ 1.57
RAB11B-201ENST00000328024 TTLL5Q6EMB2 1281 aa24.85■■□□□ 1.57
RAB11B-201ENST00000328024 ERC1Q8IUD2 1116 aa24.85■■□□□ 1.57
RAB11B-201ENST00000328024 STRIP1Q5VSL9 837 aa24.84■■□□□ 1.57
RAB11B-201ENST00000328024 VPS37DQ86XT2 251 aa24.84■■□□□ 1.57
RAB11B-201ENST00000328024 FBXW7Q969H0 707 aa24.84■■□□□ 1.57
RAB11B-201ENST00000328024 RAB11FIP3O75154 756 aa24.83■■□□□ 1.57
RAB11B-201ENST00000328024 CCDC102BQ68D86 513 aa24.83■■□□□ 1.57
RAB11B-201ENST00000328024 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
RAB11B-201ENST00000328024 DBNDD2Q9BQY9 259 aa24.83■■□□□ 1.57
RAB11B-201ENST00000328024 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
RAB11B-201ENST00000328024 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
RAB11B-201ENST00000328024 KIF3CO14782 793 aa24.82■■□□□ 1.56
RAB11B-201ENST00000328024 EPS15P42566 896 aa24.82■■□□□ 1.56
RAB11B-201ENST00000328024 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
RAB11B-201ENST00000328024 KIF1BPQ96EK5 621 aa24.82■■□□□ 1.56
RAB11B-201ENST00000328024 GMLQ99445 158 aa24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.7 ms