RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324394.7

ZNF404-201, Transcript of zinc finger protein 404, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF404, Length 1,844 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF404-201ENST00000324394 PRR12Q9ULL5 1215 aa6.72□□□□□ -1.33
ZNF404-201ENST00000324394 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.33
ZNF404-201ENST00000324394 CEP120Q8N960 986 aa6.71□□□□□ -1.33
ZNF404-201ENST00000324394 OSMRQ99650 979 aa6.71□□□□□ -1.33
ZNF404-201ENST00000324394 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa6.71□□□□□ -1.33
ZNF404-201ENST00000324394 USP31Q70CQ4 1352 aa6.71□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 J3QW42 95 aa6.71□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 HYAL2Q12891 473 aa6.71□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 HFE2Q6ZVN8 426 aa6.71□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 SYT9Q86SS6 491 aa6.71□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 HHIPQ96QV1 700 aa6.71□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 NRLP54845 237 aa6.7□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 NEUROD1Q13562 356 aa6.7□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 LCE3BQ5TA77 95 aa6.7□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 C3orf58Q8NDZ4 430 aa6.7□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 TRPM4Q8TD43 1214 aa6.7□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 TCF12Q99081 682 aa6.7□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 LIN7BQ9HAP6 207 aa6.7□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 DZANK1Q9NVP4 752 aa6.7□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 FCGRTP55899 365 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 GPLD1P80108 840 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 PODNQ7Z5L7 613 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 ABCB6Q9NP58 842 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 TRAK1Q9UPV9 953 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 METTL12A8MUP2 240 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 NFKBIEO00221 500 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 BMP4P12644 408 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 GSTT1P30711 240 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 SIK1P57059 783 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 GAS6Q14393 721 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 CCNJLQ8IV13 435 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 SPACA7Q96KW9 195 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 PPP4R2Q9NY27 417 aa6.69□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.68□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 MX2P20592 715 aa6.68□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 BAG6P46379 1132 aa6.68□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 GRIA4P48058 902 aa6.68□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 ZNF394Q53GI3 561 aa6.68□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 C8orf37Q96NL8 207 aa6.68□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 KLF15Q9UIH9 416 aa6.68□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa6.68□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa6.68□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 ATP11AP98196 1134 aa6.67□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 NAALADL2Q58DX5 795 aa6.67□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 RASSF4Q9H2L5 321 aa6.67□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 SIN3BO75182 1162 aa6.66□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 ST13P50502 369 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 RACK1P63244 317 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 SPRED3Q2MJR0 410 aa6.66□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 DTHD1Q6ZMT9 781 aa6.66□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 HS2ST1Q7LGA3 356 aa6.66□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 USP35Q9P2H5 1018 aa6.66□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 GGT7Q9UJ14 662 aa6.66□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 AKAP2Q9Y2D5 859 aa6.66□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 FBXO24O75426 580 aa6.66□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 NXPE3Q969Y0 559 aa6.66□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 TGIF2Q9GZN2 237 aa6.66□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 ACBD3Q9H3P7 528 aa6.66□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 GHRHP01286 108 aa6.65□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 USP48Q86UV5 1035 aa6.65□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 FAM35AQ86V20 835 aa6.65□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 TNFRSF25Q93038 417 aa6.65□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 PBX4Q9BYU1 374 aa6.65□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 COPRSQ9NQ92 184 aa6.65□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
ZNF404-201ENST00000324394 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
ZNF404-201ENST00000324394 CPB1P15086 417 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF404-201ENST00000324394 TNNI2P48788 182 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF404-201ENST00000324394 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF404-201ENST00000324394 ASAP3Q8TDY4 903 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF404-201ENST00000324394 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF404-201ENST00000324394 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
ZNF404-201ENST00000324394 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
ZNF404-201ENST00000324394 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
ZNF404-201ENST00000324394 NAGPAQ9UK23 515 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF404-201ENST00000324394 F6X3S4 739 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF404-201ENST00000324394 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
ZNF404-201ENST00000324394 PCSK7Q16549 785 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF404-201ENST00000324394 FCHSD1Q86WN1 690 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF404-201ENST00000324394 CCSER2Q9H7U1 834 aa6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 660.6 ms