RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292729.12

USP41-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 41, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene USP41, Length 920 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41-201ENST00000292729 IFNL1Q8IU54 200 aa13.56□□□□□ -0.24
USP41-201ENST00000292729 HYPKQ9NX55 129 aa13.56□□□□□ -0.24
USP41-201ENST00000292729 PTPN22Q9Y2R2 807 aa13.56□□□□□ -0.24
USP41-201ENST00000292729 MED23Q9ULK4 1368 aa13.56□□□□□ -0.24
USP41-201ENST00000292729 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
USP41-201ENST00000292729 ECM29Q5VYK3 1845 aa13.55□□□□□ -0.24
USP41-201ENST00000292729 MYH3P11055 1940 aa13.55□□□□□ -0.24
USP41-201ENST00000292729 CHL1O00533 1208 aa13.55□□□□□ -0.24
USP41-201ENST00000292729 PDE8AO60658 829 aa13.55□□□□□ -0.24
USP41-201ENST00000292729 STRIP1Q5VSL9 837 aa13.55□□□□□ -0.24
USP41-201ENST00000292729 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa13.55□□□□□ -0.24
USP41-201ENST00000292729 ARMC5Q96C12 935 aa13.55□□□□□ -0.24
USP41-201ENST00000292729 UNCXA6NJT0 531 aa13.54□□□□□ -0.24
USP41-201ENST00000292729 TMPOP42166 694 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
USP41-201ENST00000292729 MAP3K11Q16584 847 aa13.54□□□□□ -0.24
USP41-201ENST00000292729 DACT2Q5SW24 774 aa13.54□□□□□ -0.24
USP41-201ENST00000292729 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa13.54□□□□□ -0.24
USP41-201ENST00000292729 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
USP41-201ENST00000292729 SPEF2Q9C093 1822 aa13.53□□□□□ -0.24
USP41-201ENST00000292729 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
USP41-201ENST00000292729 PRKG1Q13976 671 aa13.53□□□□□ -0.24
USP41-201ENST00000292729 KRT24Q2M2I5 525 aa13.53□□□□□ -0.24
USP41-201ENST00000292729 CCDC191Q8NCU4 936 aa13.53□□□□□ -0.24
USP41-201ENST00000292729 SLC10A4Q96EP9 437 aa13.53□□□□□ -0.24
USP41-201ENST00000292729 TMEM106CQ9BVX2 250 aa13.53□□□□□ -0.24
USP41-201ENST00000292729 HTTP42858 3142 aa13.52□□□□□ -0.24
USP41-201ENST00000292729 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
USP41-201ENST00000292729 EN2P19622 333 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
USP41-201ENST00000292729 GOLGA2Q08379 1002 aa13.52□□□□□ -0.25
USP41-201ENST00000292729 RIC3Q7Z5B4 369 aa13.52□□□□□ -0.25
USP41-201ENST00000292729 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
USP41-201ENST00000292729 COA1Q9GZY4 146 aa13.52□□□□□ -0.25
USP41-201ENST00000292729 EFCC1Q9HA90 598 aa13.52□□□□□ -0.25
USP41-201ENST00000292729 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
USP41-201ENST00000292729 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP13.51□□□□□ -0.25
USP41-201ENST00000292729 SASH1O94885 1247 aa13.51□□□□□ -0.25
USP41-201ENST00000292729 ARHGEF6Q15052 776 aa13.51□□□□□ -0.25
USP41-201ENST00000292729 WNK4Q96J92 1243 aa13.51□□□□□ -0.25
USP41-201ENST00000292729 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa13.51□□□□□ -0.25
USP41-201ENST00000292729 CENPFP49454 3210 aa13.51□□□□□ -0.25
USP41-201ENST00000292729 SP3Q02447 781 aa13.5□□□□□ -0.25
USP41-201ENST00000292729 NBPF11Q86T75 865 aa13.5□□□□□ -0.25
USP41-201ENST00000292729 CD99L2Q8TCZ2 262 aa13.5□□□□□ -0.25
USP41-201ENST00000292729 FBXW7Q969H0 707 aa13.5□□□□□ -0.25
USP41-201ENST00000292729 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
USP41-201ENST00000292729 MXD3Q9BW11 206 aa13.5□□□□□ -0.25
USP41-201ENST00000292729 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
USP41-201ENST00000292729 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
USP41-201ENST00000292729 CCT4P50991 539 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
USP41-201ENST00000292729 TTLL5Q6EMB2 1281 aa13.49□□□□□ -0.25
USP41-201ENST00000292729 MYD88Q99836 296 aa13.49□□□□□ -0.25
USP41-201ENST00000292729 DEFB129Q9H1M3 183 aa13.49□□□□□ -0.25
USP41-201ENST00000292729 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
USP41-201ENST00000292729 MINPP1Q9UNW1 487 aa13.49□□□□□ -0.25
USP41-201ENST00000292729 LEMD3Q9Y2U8 911 aa13.49□□□□□ -0.25
USP41-201ENST00000292729 BRCA2P51587 3418 aa13.48□□□□□ -0.25
USP41-201ENST00000292729 CRHR2Q13324 411 aa13.48□□□□□ -0.25
USP41-201ENST00000292729 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa13.48□□□□□ -0.25
USP41-201ENST00000292729 ZNF333Q96JL9 665 aa13.48□□□□□ -0.25
USP41-201ENST00000292729 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
USP41-201ENST00000292729 CEP290O15078 2479 aa13.47□□□□□ -0.25
USP41-201ENST00000292729 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
USP41-201ENST00000292729 IREB2P48200 963 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
USP41-201ENST00000292729 DLGAP5Q15398 846 aa13.47□□□□□ -0.25
USP41-201ENST00000292729 DUSP27Q5VZP5 1158 aa13.47□□□□□ -0.25
USP41-201ENST00000292729 KIAA0825Q8IV33 1275 aa13.47□□□□□ -0.25
USP41-201ENST00000292729 MTMR14Q8NCE2 650 aa13.47□□□□□ -0.25
USP41-201ENST00000292729 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa13.47□□□□□ -0.25
USP41-201ENST00000292729 SSC5DA1L4H1 1573 aa13.46□□□□□ -0.25
USP41-201ENST00000292729 ZNF804BA4D1E1 1349 aa13.46□□□□□ -0.25
USP41-201ENST00000292729 MYO1BO43795 1136 aa13.46□□□□□ -0.25
USP41-201ENST00000292729 CTSWP56202 376 aa13.46□□□□□ -0.25
USP41-201ENST00000292729 NEUROD2Q15784 382 aa13.46□□□□□ -0.25
USP41-201ENST00000292729 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa13.46□□□□□ -0.25
USP41-201ENST00000292729 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa13.46□□□□□ -0.25
USP41-201ENST00000292729 CLMNQ96JQ2 1002 aa13.46□□□□□ -0.25
USP41-201ENST00000292729 FZD1Q9UP38 647 aa13.46□□□□□ -0.25
USP41-201ENST00000292729 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
USP41-201ENST00000292729 DDX58O95786 925 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
USP41-201ENST00000292729 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa13.45□□□□□ -0.26
USP41-201ENST00000292729 TTLL11Q8NHH1 800 aa13.45□□□□□ -0.26
USP41-201ENST00000292729 OTUD5Q96G74 571 aa13.45□□□□□ -0.26
USP41-201ENST00000292729 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
USP41-201ENST00000292729 CHMP4AQ9BY43 222 aa13.45□□□□□ -0.26
USP41-201ENST00000292729 ANKRD2Q9GZV1 360 aa13.45□□□□□ -0.26
USP41-201ENST00000292729 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
USP41-201ENST00000292729 TRIM35Q9UPQ4 493 aa13.45□□□□□ -0.26
USP41-201ENST00000292729 OTOFQ9HC10 1997 aa13.45□□□□□ -0.26
USP41-201ENST00000292729 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
USP41-201ENST00000292729 GTF2IP78347 998 aa13.44□□□□□ -0.26
USP41-201ENST00000292729 TXNRD3Q86VQ6 643 aa13.44□□□□□ -0.26
USP41-201ENST00000292729 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
USP41-201ENST00000292729 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
USP41-201ENST00000292729 H0YGN5 161 aa13.43□□□□□ -0.26
USP41-201ENST00000292729 USP2O75604 605 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
USP41-201ENST00000292729 PTPN18Q99952 460 aa13.43□□□□□ -0.26
USP41-201ENST00000292729 GREM2Q9H772 168 aa13.43□□□□□ -0.26
USP41-201ENST00000292729 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa13.43□□□□□ -0.26
USP41-201ENST00000292729 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa13.43□□□□□ -0.26
USP41-201ENST00000292729 GJA5P36382 358 aa13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms