RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000276654.9

LRP12-201, Transcript of LDL receptor related protein 12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP12, Length 4,112 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12-201ENST00000276654 VIL1P09327 827 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
LRP12-201ENST00000276654 SPRYD7Q5W111 196 aa9.94□□□□□ -0.82
LRP12-201ENST00000276654 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
LRP12-201ENST00000276654 TNFAIP1Q13829 316 aa9.93□□□□□ -0.82
LRP12-201ENST00000276654 RNF208Q9H0X6 261 aa9.93□□□□□ -0.82
LRP12-201ENST00000276654 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
LRP12-201ENST00000276654 HYPKQ9NX55 129 aa9.93□□□□□ -0.82
LRP12-201ENST00000276654 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa9.93□□□□□ -0.82
LRP12-201ENST00000276654 H0YGN5 161 aa9.93□□□□□ -0.82
LRP12-201ENST00000276654 TNNI2P48788 182 aa9.93□□□□□ -0.82
LRP12-201ENST00000276654 CCL15Q16663 113 aa9.93□□□□□ -0.82
LRP12-201ENST00000276654 MYO3BQ8WXR4 1341 aa9.93□□□□□ -0.82
LRP12-201ENST00000276654 UBXN2AP68543 259 aa9.92□□□□□ -0.82
LRP12-201ENST00000276654 OTUD5Q96G74 571 aa9.92□□□□□ -0.82
LRP12-201ENST00000276654 WNT10BO00744 389 aa9.92□□□□□ -0.82
LRP12-201ENST00000276654 SH3TC2Q8TF17 1288 aa9.92□□□□□ -0.82
LRP12-201ENST00000276654 PDE8AO60658 829 aa9.92□□□□□ -0.82
LRP12-201ENST00000276654 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa9.92□□□□□ -0.82
LRP12-201ENST00000276654 EVI5O60447 810 aa9.92□□□□□ -0.82
LRP12-201ENST00000276654 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
LRP12-201ENST00000276654 KRT24Q2M2I5 525 aa9.92□□□□□ -0.82
LRP12-201ENST00000276654 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
LRP12-201ENST00000276654 IFNL1Q8IU54 200 aa9.92□□□□□ -0.82
LRP12-201ENST00000276654 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa9.92□□□□□ -0.82
LRP12-201ENST00000276654 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
LRP12-201ENST00000276654 CRHR2Q13324 411 aa9.91□□□□□ -0.82
LRP12-201ENST00000276654 CNNM1Q9NRU3 951 aa9.91□□□□□ -0.82
LRP12-201ENST00000276654 PTPN22Q9Y2R2 807 aa9.91□□□□□ -0.82
LRP12-201ENST00000276654 TFRCP02786 760 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
LRP12-201ENST00000276654 CLMNQ96JQ2 1002 aa9.91□□□□□ -0.82
LRP12-201ENST00000276654 TCP10L2B9ZVM9 353 aa9.9□□□□□ -0.82
LRP12-201ENST00000276654 TM4SF4P48230 202 aa9.9□□□□□ -0.82
LRP12-201ENST00000276654 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
LRP12-201ENST00000276654 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa9.9□□□□□ -0.82
LRP12-201ENST00000276654 DUSP27Q5VZP5 1158 aa9.9□□□□□ -0.82
LRP12-201ENST00000276654 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
LRP12-201ENST00000276654 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa9.9□□□□□ -0.82
LRP12-201ENST00000276654 NKX2-3Q8TAU0 364 aa9.9□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 COA1Q9GZY4 146 aa9.9□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 CCT4P50991 539 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 ANKRD2Q9GZV1 360 aa9.89□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 CLSPNQ9HAW4 1339 aa9.89□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP9.89□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 WNK4Q96J92 1243 aa9.89□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 RASA3Q14644 834 aa9.89□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 STRIP1Q5VSL9 837 aa9.89□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 ZNF804AQ7Z570 1209 aa9.89□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 CFAP100Q494V2 611 aa9.88□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa9.88□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 OPTNQ96CV9 577 aa9.88□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa9.88□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa9.88□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 CACNA1SQ13698 1873 aa9.87□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa9.87□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa9.87□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 GTF2A2P52657 109 aa9.87□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 CCDC191Q8NCU4 936 aa9.87□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 ZNF804BA4D1E1 1349 aa9.87□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 RTL9Q8NET4 1388 aa9.87□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 PSMC4P43686 418 aa9.86□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 TRIM47Q96LD4 638 aa9.86□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP9.86□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 CCDC30Q5VVM6 783 aa9.86□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 CPA4Q9UI42 421 aa9.86□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 LEMD3Q9Y2U8 911 aa9.86□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 TJP1Q07157 1748 aa9.86□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 TMPOP42166 694 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 CCDC57Q2TAC2 916 aa9.86□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 TAF5LO75529 589 aa9.85□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 MYH16Q9H6N6 1097 aa9.85□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa9.85□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 GRK4P32298 578 aa9.85□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 HOOK2Q96ED9 719 aa9.85□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 MAP3K9P80192 1104 aa9.85□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 MFSD14BQ5SR56 506 aa9.85□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 WRNIP1Q96S55 665 aa9.85□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 CETPP11597 493 aa9.84□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 MINPP1Q9UNW1 487 aa9.84□□□□□ -0.83
LRP12-201ENST00000276654 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms