RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006275.8

TRAPPC6A-201, Transcript of trafficking protein particle complex 6A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC6A, Length 805 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GMLQ99445 158 aa24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MYH16Q9H6N6 1097 aa24.22■■□□□ 1.47
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZNF521Q96K83 1311 aa24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CCDC152Q4G0S7 254 aa24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RIC3Q7Z5B4 369 aa24.21■■□□□ 1.47
TRAPPC6A-201ENST00000006275 USP17L3A6NCW0 530 aa24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC6A-201ENST00000006275 USP17L4A6NCW7 530 aa24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC6A-201ENST00000006275 USP17L1Q7RTZ2 530 aa24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
TRAPPC6A-201ENST00000006275 XDHP47989 1333 aa24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GPR25O00155 361 aa24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC6A-201ENST00000006275 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC6A-201ENST00000006275 STK31Q9BXU1 1019 aa24.19■■□□□ 1.46
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PODNQ7Z5L7 613 aa24.18■■□□□ 1.46
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ATP2B4P23634 1241 aa24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NF2P35240 595 aa24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TM4SF4P48230 202 aa24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa24.17■■□□□ 1.46
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PDE8AO60658 829 aa24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NBPF9Q3BBW0 867 aa24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MYD88Q99836 296 aa24.16■■□□□ 1.46
TRAPPC6A-201ENST00000006275 VAMP4O75379 141 aa24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SREBF2Q12772 1141 aa24.15■■□□□ 1.46
TRAPPC6A-201ENST00000006275 DDX58O95786 925 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC6A-201ENST00000006275 OGFOD1Q8N543 542 aa24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CCDC191Q8NCU4 936 aa24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC6A-201ENST00000006275 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PSME4Q14997 1843 aa24.14■■□□□ 1.45
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FKTNO75072 461 aa24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SLC4A2P04920 1241 aa24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FBXW7Q969H0 707 aa24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC6A-201ENST00000006275 E9PSI1 815 aa24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GCC1Q96CN9 775 aa24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MXD3Q9BW11 206 aa24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC6A-201ENST00000006275 WNT10BO00744 389 aa24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ARMC9Q7Z3E5 817 aa24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC6A-201ENST00000006275 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PRKG1Q13976 671 aa24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC6A-201ENST00000006275 DACT2Q5SW24 774 aa24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MED23Q9ULK4 1368 aa24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MYO3BQ8WXR4 1341 aa24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SASH1O94885 1247 aa24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CFHR5Q9BXR6 569 aa24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC6A-201ENST00000006275 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CACNA1FO60840 1977 aa24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SLFN5Q08AF3 891 aa24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC6A-201ENST00000006275 G2E3Q7L622 706 aa24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CTSWP56202 376 aa24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC6A-201ENST00000006275 STRIP1Q5VSL9 837 aa24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC6A-201ENST00000006275 KSR2Q6VAB6 950 aa24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PI4KAP2A4QPH2 592 aa24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ALDH1A1P00352 501 aa24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SPRYD7Q5W111 196 aa24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC6A-201ENST00000006275 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC6A-201ENST00000006275 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC6A-201ENST00000006275 COA1Q9GZY4 146 aa24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC6A-201ENST00000006275 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MINPP1Q9UNW1 487 aa24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CCT4P50991 539 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FLIIQ13045 1269 aa24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TRIM17Q9Y577 477 aa24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MMP14P50281 582 aa24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC6A-201ENST00000006275 LDLRAD1Q5T700 205 aa24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC6A-201ENST00000006275 KIAA0825Q8IV33 1275 aa24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GREM2Q9H772 168 aa24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NEXNQ0ZGT2 675 aa24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC6A-201ENST00000006275 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TTLL11Q8NHH1 800 aa24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TTLL5Q6EMB2 1281 aa24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TXNRD3Q86VQ6 643 aa24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SLC10A4Q96EP9 437 aa24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC6A-201ENST00000006275 INHBEP58166 350 aa24■■□□□ 1.43
TRAPPC6A-201ENST00000006275 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
TRAPPC6A-201ENST00000006275 OTOP1Q7RTM1 612 aa24■■□□□ 1.43
TRAPPC6A-201ENST00000006275 IFNL1Q8IU54 200 aa24■■□□□ 1.43
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FZD1Q9UP38 647 aa24■■□□□ 1.43
TRAPPC6A-201ENST00000006275 LEMD3Q9Y2U8 911 aa24■■□□□ 1.43
TRAPPC6A-201ENST00000006275 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC6A-201ENST00000006275 POTEFA5A3E0 1075 aa23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC6A-201ENST00000006275 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC6A-201ENST00000006275 DNAAF4Q8WXU2 420 aa23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC6A-201ENST00000006275 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
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