RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629219.1

PKP4-218, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PKP4, Length 162 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-218ENST00000629219 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
PKP4-218ENST00000629219 ZNF154Q13106 437 aa7.59□□□□□ -1.19
PKP4-218ENST00000629219 TIGD6Q17RP2 521 aa7.59□□□□□ -1.19
PKP4-218ENST00000629219 KDM4DQ6B0I6 523 aa7.59□□□□□ -1.19
PKP4-218ENST00000629219 PLBD1Q6P4A8 553 aa7.59□□□□□ -1.19
PKP4-218ENST00000629219 BTNL3Q6UXE8 466 aa7.59□□□□□ -1.19
PKP4-218ENST00000629219 LRRN1Q6UXK5 716 aa7.59□□□□□ -1.19
PKP4-218ENST00000629219 SLC16A9Q7RTY1 509 aa7.59□□□□□ -1.19
PKP4-218ENST00000629219 CPOQ8IVL8 374 aa7.59□□□□□ -1.19
PKP4-218ENST00000629219 HS3ST5Q8IZT8 346 aa7.59□□□□□ -1.19
PKP4-218ENST00000629219 OR56B2PQ8NGI1 322 aa7.59□□□□□ -1.19
PKP4-218ENST00000629219 OR2AE1Q8NHA4 323 aa7.59□□□□□ -1.19
PKP4-218ENST00000629219 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
PKP4-218ENST00000629219 FAM216AQ8WUB2 273 aa7.59□□□□□ -1.19
PKP4-218ENST00000629219 ASB17Q8WXJ9 295 aa7.59□□□□□ -1.19
PKP4-218ENST00000629219 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
PKP4-218ENST00000629219 REEP6Q96HR9 211 aa7.59□□□□□ -1.19
PKP4-218ENST00000629219 TMEM246Q9BRR3 403 aa7.59□□□□□ -1.19
PKP4-218ENST00000629219 MRI1Q9BV20 369 aa7.59□□□□□ -1.19
PKP4-218ENST00000629219 TLNRD1Q9H1K6 362 aa7.59□□□□□ -1.19
PKP4-218ENST00000629219 OR51V1Q9H2C8 321 aa7.59□□□□□ -1.19
PKP4-218ENST00000629219 HAO2Q9NYQ3 351 aa7.59□□□□□ -1.19
PKP4-218ENST00000629219 KIF17Q9P2E2 1029 aa7.59□□□□□ -1.19
PKP4-218ENST00000629219 RNF7Q9UBF6 113 aa7.59□□□□□ -1.19
PKP4-218ENST00000629219 KAAG1Q9UBP8 84 aa7.59□□□□□ -1.19
PKP4-218ENST00000629219 MPC1Q9Y5U8 109 aa7.59□□□□□ -1.19
PKP4-218ENST00000629219 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa7.58□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa7.58□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa7.58□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 TMEM210A6NLX4 147 aa7.58□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 ZAR1LA6NP61 321 aa7.58□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 G3V2T6 193 aa7.58□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 TRAPPC2LH3BP13 241 aa7.58□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 LGALS8O00214 317 aa7.58□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 FAM20BO75063 409 aa7.58□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 CST4P01036 141 aa7.58□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 IGLV3-1P01715 115 aa7.58□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 HLA-DPB1P04440 258 aa7.58□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 LIPFP07098 398 aa7.58□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 H2BFMP0C1H6 154 aa7.58□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 POU1F1P28069 291 aa7.58□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 COMPP49747 757 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 DAPP51397 102 aa7.58□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 GNB2P62879 340 aa7.58□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 IL5RAQ01344 420 aa7.58□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 SNAPC1Q16533 368 aa7.58□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 ZBTB37Q5TC79 503 aa7.58□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 SLX4IPQ5VYV7 408 aa7.58□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 NXNL2Q5VZ03 156 aa7.58□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 TEX36Q5VZQ5 186 aa7.58□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa7.58□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 GALNT4Q8N4A0 578 aa7.58□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 OR10Z1Q8NGY1 313 aa7.58□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 RAB40AQ8WXH6 277 aa7.58□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 SGK3Q96BR1 496 aa7.58□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 UPRTQ96BW1 309 aa7.58□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 TEAD3Q99594 435 aa7.58□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 DNTTIP1Q9H147 329 aa7.58□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 MOB1AQ9H8S9 216 aa7.58□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 MED20Q9H944 212 aa7.58□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 CLN8Q9UBY8 286 aa7.58□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 NUP50Q9UKX7 468 aa7.58□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 AP4S1Q9Y587 144 aa7.58□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 AUP1Q9Y679 476 aa7.58□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 C5orf63A6NC05 138 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 CCDC182A6NF36 153 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 OOEPA6NGQ2 149 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 SLC22A31A6NKX4 558 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 ANXA2P2A6NMY6 339 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 CLDN34H7C241 214 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 TRIM77I1YAP6 450 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 GPR37O15354 613 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 SELENOFO60613 162 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 VENTXO95231 258 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 SLC2A1P11166 492 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 PRKACGP22612 351 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 ANOS1P23352 680 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 PITPNBP48739 271 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 GSK3AP49840 483 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 TMED1Q13445 227 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 MPPED2Q15777 294 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 KLHL12Q53G59 568 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 ARMCX4Q5H9R4 360 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 FAM76BQ5HYJ3 339 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 C1orf146Q5VVC0 180 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 CD276Q5ZPR3 534 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 C12orf73Q69YU5 71 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 ZNF841Q6ZN19 808 aa7.57□□□□□ -1.2
PKP4-218ENST00000629219 Q6ZSR3 168 aa7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.2 ms