RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628904.2

PKP4-217, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

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Gene PKP4, Length 3,856 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-217ENST00000628904 PINLYPA6NC86 204 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 HS3ST1O14792 307 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 EFSO43281 561 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 ZNF432O94892 652 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 SP9P0CG40 484 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 CD34P28906 385 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 IFITM2Q01629 132 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 CLEC9AQ6UXN8 241 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 LINC00299Q6ZSB3 139 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 NAXDQ8IW45 347 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 GJC3Q8NFK1 279 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 PNPLA2Q96AD5 504 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 NIPAL2Q9H841 368 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 UFSP2Q9NUQ7 469 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 B4GALT7Q9UBV7 327 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 OR14J1Q9UGF5 321 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 ZGRF1Q86YA3 2104 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 E9PQ18 207 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 SLC17A2O00624 439 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 ZNF254O75437 659 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 MMP15P51511 669 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 RIN1Q13671 783 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 ZNF585AQ6P3V2 769 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 HDDC2Q7Z4H3 204 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 C1QL2Q7Z5L3 287 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 C5orf24Q7Z6I8 188 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 SLC22A24Q8N4F4 322 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 SUMF1Q8NBK3 374 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 OR11H4Q8NGC9 324 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 OR6M1Q8NGM8 313 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 CCDC107Q8WV48 283 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 TRIM63Q969Q1 353 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 HYLS1Q96M11 299 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 RAB33BQ9H082 229 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 DEPPQ9NTK1 212 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 FAM208BQ5VWN6 2430 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 PIEZO1Q92508 2521 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 A0A0A6YYH2 397 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 A6NJ64 397 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 F5H0A9 414 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 LYZL6O75951 148 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 IGHV3-13P01766 116 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 IGHV3-7P01780 117 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 RRASP10301 218 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 MSX1P28360 303 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 GZMKP49863 264 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 SNAI3Q3KNW1 292 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 RNLSQ5VYX0 342 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 SPERTQ8NA61 448 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 STEAP2Q8NFT2 490 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 OR5H2Q8NGV7 314 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 ZNF519Q8TB69 540 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 RDH5Q92781 318 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 KCNK17Q96T54 332 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 MARVELD1Q9BSK0 173 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 A0A1W2PQD3 144 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 DISC1C4P0D8 188 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 HSPA12AO43301 675 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 AQP8O94778 261 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 GLSO94925 669 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 LIFP15018 202 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 ACTBP60709 375 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 ACTG1P63261 375 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 PLP2Q04941 152 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 ACSM1Q08AH1 577 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 CAMK2BQ13554 666 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 PCK2Q16822 640 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 GSG1Q2KHT4 349 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 ABCA11PQ4W5N1 156 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 TSPO2Q5TGU0 170 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 ST8SIA4Q92187 359 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 ZBTB8AQ96BR9 441 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 FAAP24Q9BTP7 215 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 B3GAT1Q9P2W7 334 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 OR2AT4A6NND4 320 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 FTCDNL1E5RQL4 147 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 TSPAN4O14817 238 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 KISS1Q15726 138 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 HIKESHIQ53FT3 197 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 METTL11BQ5VVY1 283 aa6.62□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 SLC25A26Q70HW3 274 aa6.62□□□□□ -1.35
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