RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628078.2

TCF4-262, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 1,277 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	NDUFAB1	O14561	156 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	TIMM23	O14925	209 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	SEMG1	P04279	462 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	FABP3	P05413	133 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	SELL	P14151	372 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	TSPAN31	Q12999	210 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	KLRD1	Q13241	179 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	TAF9	Q16594	264 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	PCK2	Q16822	640 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	WDR38	Q5JTN6	314 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	DRAM2	Q6UX65	266 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078		Q6ZSV7	163 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	DPY19L4	Q7Z388	723 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	TMEM86B	Q8N661	226 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	SLC37A3	Q8NCC5	494 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	KCNJ15	Q99712	375 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	FAM107B	Q9H098	131 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	MMP27	Q9H306	513 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	GORASP2	Q9H8Y8	452 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	ACOT8	O14734	319 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	NDUFA2	O43678	99 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	IDH3B	O43837	385 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	LHB	P01229	141 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	GAST	P01350	101 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	IFNGR2	P38484	337 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	PROK1	P58294	105 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	CDON	Q4KMG0	1287 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	FAM57B	Q71RH2	274 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	SLC16A9	Q7RTY1	509 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	LINC00471	Q8N535	108 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	OR52L1	Q8NGH7	329 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	OR2T4	Q8NH00	348 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	SGK3	Q96BR1	496 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	NOP16	Q9Y3C1	178 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	CDIPT	O14735	213 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	AMY2B	P19961	511 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	FMO3	P31513	532 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	CX3CR1	P49238	355 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	ENTPD1	P49961	510 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	FAM3A	P98173	230 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	CRMP1	Q14194	572 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	TIGD6	Q17RP2	521 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	MICB	Q29980	383 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	SPERT	Q8NA61	448 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	OR1M1	Q8NGA1	313 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	OR6K6	Q8NGW6	343 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	OTULIN	Q96BN8	352 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	REEP6	Q96HR9	211 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	CDRT15	Q96T59	188 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	MED20	Q9H944	212 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	TAS2R1	Q9NYW7	299 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	CDH10	Q9Y6N8	788 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	NOTCH1	P46531	2555 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	DHRS12	A0PJE2	317 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	TNFRSF11B	O00300	401 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	ARPC2	O15144	300 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	NDUFB3	O43676	98 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	CLPX	O76031	633 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	SOX14	O95416	240 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	PAX6	P26367	422 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	EGR3	Q06889	387 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TCF4-262	ENST00000628078	WDR82	Q6UXN9	313 aa		11.09	□□□□□ -0.63

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