RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM138Q9NPI0 162 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A0B4J203 849 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 CCL21O00585 134 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 SULT1B1O43704 296 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 MALLQ13021 153 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 UTS2BQ765I0 119 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 MRI1Q9BV20 369 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 ACTR6Q9GZN1 396 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 CHST5Q9GZS9 411 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 CDH20Q9HBT6 801 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 POLEQ07864 2286 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 ALX3O95076 343 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM166AQ6J272 317 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 OR5AS1Q8N127 324 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 OR5H6Q8NGV6 325 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 LIN7BQ9HAP6 207 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 PLGRKTQ9HBL7 147 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 STEAP1Q9UHE8 339 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 SPATA2Q9UM82 520 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC17A2O00624 439 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 CECR9P0C854 216 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 CALCBP10092 127 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 PRSS12P56730 875 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF45Q02386 682 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 ST3GAL2Q16842 350 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 OR52N4Q8NGI2 321 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 OR5L1Q8NGL2 311 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF671Q8TAW3 534 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 ITFG2Q969R8 447 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 POFUT1Q9H488 388 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 OPA3Q9H6K4 179 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 PTTG3PQ9NZH4 202 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 SMPD2O60906 423 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF35P13682 527 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 CCKARP32238 428 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 CLDN12P56749 244 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 TAB1Q15750 504 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 C3orf36Q3SXR2 165 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 SPANXN2Q5MJ10 180 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 C1orf100Q5SVJ3 147 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 LGALS14Q8TCE9 139 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 USP24Q9UPU5 2620 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 ALDOBP05062 364 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 PPA1Q15181 289 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 UBE2V2Q15819 145 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 ZBTB37Q5TC79 503 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM42Q69YG0 159 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 CDH26Q8IXH8 852 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 SAMD12Q8N8I0 201 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC25A28Q96A46 364 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 MUCL1Q96DR8 90 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 DIRAS2Q96HU8 199 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 ADAM30Q9UKF2 790 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 C16orf97H3BN30 126 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 J3QRK9 145 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 ELK1P19419 428 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 EVX1P49640 407 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 SCAND1P57086 179 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 OR6M1Q8NGM8 313 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 SSC4DQ8WTU2 575 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 BORCS5Q969J3 196 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 CMTM3Q96MX0 182 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 OR10A4Q9H209 315 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 OR5V1Q9UGF6 321 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 V9GYH0 126 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 PRF1P14222 555 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 HTR2CP28335 458 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 UCP2P55851 309 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 RAB11BQ15907 218 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 JAGN1Q8N5M9 183 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 OR51B6Q9H340 312 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 PPP5CP53041 499 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 CLVS2Q5SYC1 327 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 CNIH2Q6PI25 160 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 C22orf34Q6ZV56 151 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 KRT74Q7RTS7 529 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 SORCS2Q96PQ0 1159 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 UQCC2Q9BRT2 126 aa21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms