RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597552.1

TIMM50-208, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 50, humanhuman

TSL 2

Gene TIMM50, Length 369 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50-208ENST00000597552 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
TIMM50-208ENST00000597552 REEP6Q96HR9 211 aa8.34□□□□□ -1.07
TIMM50-208ENST00000597552 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
TIMM50-208ENST00000597552 OR8B2Q96RD0 313 aa8.34□□□□□ -1.07
TIMM50-208ENST00000597552 RASSF4Q9H2L5 321 aa8.34□□□□□ -1.07
TIMM50-208ENST00000597552 MARCH7Q9H992 704 aa8.34□□□□□ -1.07
TIMM50-208ENST00000597552 C1orf123Q9NWV4 160 aa8.34□□□□□ -1.07
TIMM50-208ENST00000597552 KIF17Q9P2E2 1029 aa8.34□□□□□ -1.07
TIMM50-208ENST00000597552 DNAJB9Q9UBS3 223 aa8.34□□□□□ -1.07
TIMM50-208ENST00000597552 DUX4Q9UBX2 424 aa8.34□□□□□ -1.07
TIMM50-208ENST00000597552 LRCH1Q9Y2L9 728 aa8.34□□□□□ -1.07
TIMM50-208ENST00000597552 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
TIMM50-208ENST00000597552 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa8.34□□□□□ -1.07
TIMM50-208ENST00000597552 TRAV40A0A0B4J280 105 aa8.33□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa8.33□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa8.33□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa8.33□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa8.33□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 CCDC182A6NF36 153 aa8.33□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 LRRC30A6NM36 301 aa8.33□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 PRR32B1ATL7 298 aa8.33□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 C22orf46C9J442 243 aa8.33□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 IFNL4K9M1U5 179 aa8.33□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 TMPRSS2O15393 492 aa8.33□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 GSC2O15499 205 aa8.33□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 XRCC2O43543 280 aa8.33□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 MITFO75030 526 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 FCN3O75636 299 aa8.33□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 GYPAP02724 150 aa8.33□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 TFF1P04155 84 aa8.33□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 LYNP07948 512 aa8.33□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 H2BFMP0C1H6 154 aa8.33□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 SLC2A5P22732 501 aa8.33□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 DAPP51397 102 aa8.33□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 GMFBP60983 142 aa8.33□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 RPS7P62081 194 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 DEFA6Q01524 100 aa8.33□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 APOFQ13790 326 aa8.33□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 GK3PQ14409 553 aa8.33□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 OR8B8Q15620 311 aa8.33□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 ZNF841Q6ZN19 808 aa8.33□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 USP43Q70EL4 1123 aa8.33□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 C1orf87Q8N0U7 546 aa8.33□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa8.33□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 OR11L1Q8NGX0 322 aa8.33□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 OTOSQ8NHW6 89 aa8.33□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 SEH1LQ96EE3 360 aa8.33□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 PGAM5Q96HS1 289 aa8.33□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 LYZL4Q96KX0 146 aa8.33□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 TECTBQ96PL2 329 aa8.33□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 JMJD8Q96S16 334 aa8.33□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 MRI1Q9BV20 369 aa8.33□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 FN3KRPQ9HA64 309 aa8.33□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 ZNF556Q9HAH1 456 aa8.33□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 SLC25A19Q9HC21 320 aa8.33□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 SMURF1Q9HCE7 757 aa8.33□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 TVP23BQ9NYZ1 205 aa8.33□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 RNF7Q9UBF6 113 aa8.33□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 MIOXQ9UGB7 285 aa8.33□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa8.33□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa8.32□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 GMDSO60547 372 aa8.32□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 ANXA8P13928 327 aa8.32□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 ACKR3P25106 362 aa8.32□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 EPHA2P29317 976 aa8.32□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 SLC15A1P46059 708 aa8.32□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 GSK3AP49840 483 aa8.32□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 PAX8Q06710 450 aa8.32□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 BNIP1Q12981 228 aa8.32□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 SNAPC1Q16533 368 aa8.32□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 DMRTC1Q5HYR2 192 aa8.32□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 DCDC5Q6ZRR9 648 aa8.32□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 SHFQ7M4L6 423 aa8.32□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 FAM90A1Q86YD7 464 aa8.32□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 PARP8Q8N3A8 854 aa8.32□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 GCSAMQ8N6F7 178 aa8.32□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 OR8B12Q8NGG6 310 aa8.32□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 OR8S1Q8NH09 359 aa8.32□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 RAB40AQ8WXH6 277 aa8.32□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 PLEKHA8Q96JA3 519 aa8.32□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 SUCNR1Q9BXA5 334 aa8.32□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 ZNF696Q9H7X3 374 aa8.32□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 CLN8Q9UBY8 286 aa8.32□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 NUP50Q9UKX7 468 aa8.32□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 COPS3Q9UNS2 423 aa8.32□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 LRP12Q9Y561 859 aa8.32□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 OOEPA6NGQ2 149 aa8.31□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa8.31□□□□□ -1.08
TIMM50-208ENST00000597552 LGALS8O00214 317 aa8.31□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms