RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566882.5

CCNDBP1-210, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 2,746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-210ENST00000566882 GALNT16Q8N428 558 aa8.91□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 GVQW1Q8N7I0 195 aa8.91□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 UXS1Q8NBZ7 420 aa8.91□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR51S1Q8NGJ8 323 aa8.91□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR2AE1Q8NHA4 323 aa8.91□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR2V1Q8NHB1 315 aa8.91□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 AKR7LQ8NHP1 331 aa8.91□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 THRSPQ92748 146 aa8.91□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 TMEM138Q9NPI0 162 aa8.91□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 MEIKINA0A087WXM9 373 aa8.91□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 A0A0A6YYD4 124 aa8.91□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 TMEM127O75204 238 aa8.91□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 VAMP5O95183 116 aa8.91□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 GABRA1P14867 456 aa8.91□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 RAB3AP20336 220 aa8.91□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 SCAND1P57086 179 aa8.91□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 ABHD17BQ5VST6 288 aa8.91□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF774Q6NX45 483 aa8.91□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 C1QL2Q7Z5L3 287 aa8.91□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 DEFB124Q8NES8 71 aa8.91□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR5D14Q8NGL3 314 aa8.91□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 GPX8Q8TED1 209 aa8.91□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 PGAM5Q96HS1 289 aa8.91□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 SORCS2Q96PQ0 1159 aa8.91□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 BANF2Q9H503 90 aa8.91□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 PLEK2Q9NYT0 353 aa8.91□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 KLK13Q9UKR3 277 aa8.91□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 MEGF11A6BM72 1044 aa8.9□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 RAB27BO00194 218 aa8.9□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 ICMTO60725 284 aa8.9□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 CSN2P05814 226 aa8.9□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 FAHP16930 419 aa8.9□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 LSM6P62312 80 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP8.9□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa8.9□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZBTB37Q5TC79 503 aa8.9□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 TEX261Q6UWH6 196 aa8.9□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa8.9□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 AAED1Q7RTV5 226 aa8.9□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 SLC51BQ86UW2 128 aa8.9□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 IL22RA1Q8N6P7 574 aa8.9□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 CLEC1AQ8NC01 280 aa8.9□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF680Q8NEM1 530 aa8.9□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR14K1Q8NGZ2 314 aa8.9□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa8.9□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 GPR137Q96N19 417 aa8.9□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 GPR87Q9BY21 358 aa8.9□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 COPZ2Q9P299 210 aa8.9□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 CSAG2Q9Y5P2 127 aa8.9□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 U3KQ87 197 aa8.9□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 CRYZL1O95825 349 aa8.9□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 GNB3P16520 340 aa8.9□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 AP3S2P59780 193 aa8.9□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 ELFN2Q5R3F8 820 aa8.9□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 AWAT2Q6E213 333 aa8.9□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR52W1Q6IF63 320 aa8.9□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa8.9□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 VASH2Q86V25 355 aa8.9□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 FTMTQ8N4E7 242 aa8.9□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 CHST4Q8NCG5 386 aa8.9□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 GJC3Q8NFK1 279 aa8.9□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 KCNE4Q8WWG9 221 aa8.9□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 TTTY12Q9BZ98 90 aa8.9□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 MGAT4CQ9UBM8 478 aa8.9□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 DCHS1Q96JQ0 3298 aa8.89□□□□□ -0.99
CCNDBP1-210ENST00000566882 GJE1A6NN92 205 aa8.89□□□□□ -0.99
CCNDBP1-210ENST00000566882 C21orf140B9A014 251 aa8.89□□□□□ -0.99
CCNDBP1-210ENST00000566882 NDUFB6O95139 128 aa8.89□□□□□ -0.99
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR3A3P47888 321 aa8.89□□□□□ -0.99
CCNDBP1-210ENST00000566882 HIST1H3AP68431 136 aa8.89□□□□□ -0.99
CCNDBP1-210ENST00000566882 UBE2V2Q15819 145 aa8.89□□□□□ -0.99
CCNDBP1-210ENST00000566882 CEACAM16Q2WEN9 425 aa8.89□□□□□ -0.99
CCNDBP1-210ENST00000566882 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa8.89□□□□□ -0.99
CCNDBP1-210ENST00000566882 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa8.89□□□□□ -0.99
CCNDBP1-210ENST00000566882 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa8.89□□□□□ -0.99
CCNDBP1-210ENST00000566882 HIST2H3AQ71DI3 136 aa8.89□□□□□ -0.99
CCNDBP1-210ENST00000566882 GABRG1Q8N1C3 465 aa8.89□□□□□ -0.99
CCNDBP1-210ENST00000566882 SLC22A24Q8N4F4 322 aa8.89□□□□□ -0.99
CCNDBP1-210ENST00000566882 NKAIN3Q8N8D7 197 aa8.89□□□□□ -0.99
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR10K1Q8NGX5 313 aa8.89□□□□□ -0.99
CCNDBP1-210ENST00000566882 GINS4Q9BRT9 223 aa8.89□□□□□ -0.99
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa8.89□□□□□ -0.99
CCNDBP1-210ENST00000566882 RLN1P04808 185 aa8.89□□□□□ -0.99
CCNDBP1-210ENST00000566882 HCKP08631 526 aa8.89□□□□□ -0.99
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF32P17041 273 aa8.89□□□□□ -0.99
CCNDBP1-210ENST00000566882 LHX2P50458 406 aa8.89□□□□□ -0.99
CCNDBP1-210ENST00000566882 GRB2P62993 217 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
CCNDBP1-210ENST00000566882 RELQ04864 619 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms