RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556251.1

RAD51B-223, Transcript of RAD51 paralog B, human

TSL 4

Gene RAD51B, Length 567 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAD51B-223	ENST00000556251	NDUFS8	O00217	210 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	ARPC3	O15145	178 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	CRLF1	O75462	422 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	IGHV3-13	P01766	116 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	HSD11B1	P28845	292 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	GRK5	P34947	590 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	CX3CR1	P49238	355 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	ENTPD1	P49961	510 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	DAP	P51397	102 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	MMP15	P51511	669 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	HMGA2	P52926	109 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	TPTE	P56180	551 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	LSM6	P62312	80 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	SNAPC1	Q16533	368 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	HFE	Q30201	348 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	SPATS1	Q496A3	300 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	FAM57B	Q71RH2	274 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	DPY19L4	Q7Z388	723 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	CPO	Q8IVL8	374 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	OR10S1	Q8NGN2	331 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	ST8SIA2	Q92186	375 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	PTP4A1	Q93096	173 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	SPTSSA	Q969W0	71 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	SLAMF6	Q96DU3	332 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	ZNF799	Q96GE5	643 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	OR2V2	Q96R30	315 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	OR14A2	Q96R54	314 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	AMELY	Q99218	206 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	TBX5	Q99593	518 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	COQ7	Q99807	217 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	YY1AP1	Q9H869	796 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	IL20	Q9NYY1	176 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	DNAJB9	Q9UBS3	223 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	CUBN	O60494	3623 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251		A6NLC8	198 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	MAGEB4	O15481	346 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	IDH3B	O43837	385 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	AHCYL1	O43865	530 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	GRP	P07492	148 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	H2BFM	P0C1H6	154 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	ACSM4	P0C7M7	580 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	COX5B	P10606	129 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	ANXA8	P13928	327 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	SRD5A1	P18405	259 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	ADRA2C	P18825	462 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	PAICS	P22234	425 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	CA6	P23280	308 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	FAS	P25445	335 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	CFP	P27918	469 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	EPHA2	P29317	976 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	EVX1	P49640	407 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	RASSF2	P50749	326 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	CRISP1	P54107	249 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	RAD23A	P54725	363 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	CDH15	P55291	814 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	LCN2	P80188	198 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	COX10	Q12887	443 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	APOF	Q13790	326 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	GK2	Q14410	553 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	MOG	Q16653	247 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	TIGD6	Q17RP2	521 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	ODF4	Q2M2E3	257 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	SLC27A4	Q6P1M0	643 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	SHQ1	Q6PI26	577 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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