RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
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PTPRB-204ENST00000538708 SFTPA2Q8IWL1 248 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRB-204ENST00000538708 WDR31Q8NA23 367 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRB-204ENST00000538708 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
PTPRB-204ENST00000538708 CCL19Q99731 98 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRB-204ENST00000538708 CHST2Q9Y4C5 530 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRB-204ENST00000538708 WNK3Q9BYP7 1800 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRB-204ENST00000538708 A0A0B4J2E0 115 aa8.46□□□□□ -1.05
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