RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523237.1

CLN8-206, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, human

TSL 3

Gene CLN8, Length 835 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLN8-206	ENST00000523237	HAX1	O00165	279 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	PHYH	O14832	338 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	GSC2	O15499	205 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	GRP	P07492	148 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	CD80	P33681	288 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	FAM3A	P98173	230 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	PAX2	Q02962	417 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	OR8S1	Q8NH09	359 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	THEM6	Q8WUY1	208 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	SGK3	Q96BR1	496 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	PGAM5	Q96HS1	289 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	BRD7	Q9NPI1	651 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	C1orf123	Q9NWV4	160 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	LGALS8	O00214	317 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	SELENOF	O60613	162 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	PSMB10	P40306	273 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	NAA10	P41227	235 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	NPY4R	P50391	375 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	RASSF2	P50749	326 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	BNIP1	Q12981	228 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	OR8B8	Q15620	311 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	SNCB	Q16143	134 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	FTMT	Q8N4E7	242 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	RGCC	Q9H4X1	137 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	C3orf80	F5H4A9	247 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	NDUFA2	O43678	99 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	TIPRL	O75663	272 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	GNAL	P38405	381 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	GSK3A	P49840	483 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	CRISP1	P54107	249 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	SNAPC1	Q16533	368 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	BBS1	Q8NFJ9	593 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	NIPAL2	Q9H841	368 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	ZNF69	Q9UC07	566 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CLN8-206	ENST00000523237	OOEP	A6NGQ2	149 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CLN8-206	ENST00000523237	SLC2A5	P22732	501 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CLN8-206	ENST00000523237	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
CLN8-206	ENST00000523237	APOF	Q13790	326 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CLN8-206	ENST00000523237	FAHD1	Q6P587	224 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CLN8-206	ENST00000523237	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CLN8-206	ENST00000523237	PARP8	Q8N3A8	854 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CLN8-206	ENST00000523237	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CLN8-206	ENST00000523237	ZDHHC22	Q8N966	263 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CLN8-206	ENST00000523237	OR5K1	Q8NHB7	308 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CLN8-206	ENST00000523237	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
CLN8-206	ENST00000523237	UPRT	Q96BW1	309 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CLN8-206	ENST00000523237	TECTB	Q96PL2	329 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CLN8-206	ENST00000523237	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
CLN8-206	ENST00000523237	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CLN8-206	ENST00000523237	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CLN8-206	ENST00000523237	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
CLN8-206	ENST00000523237	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CLN8-206	ENST00000523237	ESM1	Q9NQ30	184 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CLN8-206	ENST00000523237	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CLN8-206	ENST00000523237	ZNF391	Q9UJN7	358 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CLN8-206	ENST00000523237	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CLN8-206	ENST00000523237	ANXA2P2	A6NMY6	339 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CLN8-206	ENST00000523237	ADAM20	O43506	726 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CLN8-206	ENST00000523237	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
CLN8-206	ENST00000523237	ATP5H	O75947	161 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CLN8-206	ENST00000523237	ALOX5AP	P20292	161 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CLN8-206	ENST00000523237	DAP	P51397	102 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CLN8-206	ENST00000523237	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
CLN8-206	ENST00000523237	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
CLN8-206	ENST00000523237	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CLN8-206	ENST00000523237	CD276	Q5ZPR3	534 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CLN8-206	ENST00000523237	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
CLN8-206	ENST00000523237	DOK3	Q7L591	496 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CLN8-206	ENST00000523237	KRT77	Q7Z794	578 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CLN8-206	ENST00000523237	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CLN8-206	ENST00000523237	OR1M1	Q8NGA1	313 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CLN8-206	ENST00000523237	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		13.51	□□□□□ -0.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms