RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514110.5

SNHG4-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 4, human

TSL 1 (best)

Gene SNHG4, Length 679 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleoplasm .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG4-208	ENST00000514110	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	DEFB107A	Q8IZN7	70 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	LINC00471	Q8N535	108 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	TMEM86B	Q8N661	226 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	OR4F5	Q8NH21	305 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	LHX4	Q969G2	390 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	FAM71F1	Q96KD3	344 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	OPA3	Q9H6K4	179 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	BEX1	Q9HBH7	125 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	ACOXL	Q9NUZ1	547 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	VNN3	Q9NY84	501 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	DUX4	Q9UBX2	424 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110		A0A1B0GUS0	222 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	DHRS12	A0PJE2	317 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	TBX1	O43435	398 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	XRCC2	O43543	280 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	CCNB2	O95067	398 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	NDUFA7	O95182	113 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	DDOST	P39656	456 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	CX3CR1	P49238	355 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	KRTAP10-3	P60369	221 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	CSNK2B	P67870	215 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	MZT1	Q08AG7	82 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	PDCD1	Q15116	288 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	C16orf89	Q6UX73	402 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	SLC16A9	Q7RTY1	509 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	PDZD9	Q8IXQ8	264 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	OR1M1	Q8NGA1	313 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	OR6K6	Q8NGW6	343 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	OR8S1	Q8NH09	359 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	ST8SIA4	Q92187	359 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	SGK3	Q96BR1	496 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	SEH1L	Q96EE3	360 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	REEP6	Q96HR9	211 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	MED20	Q9H944	212 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110		A0A0U1RQK1	487 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	IGHV4-59	P01825	116 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	TIGD6	Q17RP2	521 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	SPATS1	Q496A3	300 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	KLHL12	Q53G59	568 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	WDR82	Q6UXN9	313 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	DPY19L4	Q7Z388	723 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	PIP4P2	Q8N4L2	257 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	OR2T33	Q8NG76	320 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	LRRC29	Q8WV35	223 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	AMELY	Q99218	206 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	CCL13	Q99616	98 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	CITED1	Q99966	193 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	CNTD2	Q9H8S5	307 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	ACTR3B	Q9P1U1	418 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	BAIAP2	Q9UQB8	552 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110		U3KQV3	271 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	VWF	P04275	2813 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	FAM183A	A6NL82	134 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	ACOT8	O14734	319 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	GPR137B	O60478	399 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	HSD11B1	P28845	292 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	GRK5	P34947	590 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	SLC15A1	P46059	708 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	IER3	P46695	156 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	GSK3A	P49840	483 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	MXRA7	P84157	204 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	MICB	Q29980	383 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	MICA	Q29983	383 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SNHG4-208	ENST00000514110	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		10.06	□□□□□ -0.8

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