RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 OR2B11Q5JQS5 317 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 CDKL4Q5MAI5 379 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 BRMS1LQ5PSV4 323 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 GPRC6AQ5T6X5 926 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 RESP18Q5W5W9 173 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF470Q6ECI4 717 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 SMIM15Q7Z3B0 74 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 MCOLN2Q8IZK6 566 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 RDH10Q8IZV5 341 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 MRAPQ8TCY5 172 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 GTF2H4Q92759 462 aa1.75□□□□□ -2.13
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PDE4D-218ENST00000509368 PGLYRP4Q96LB8 373 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 MS4A4EQ96PG1 132 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 TSSK3Q96PN8 268 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 OR5M11Q96RB7 305 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 DHRS9Q9BPW9 319 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 KLHDC3Q9BQ90 382 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM246Q9BRR3 403 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 BEX1Q9HBH7 125 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 SPANXA1Q9NS26 97 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 NRBP2Q9NSY0 501 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 KCNIP1Q9NZI2 227 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 VAPAQ9P0L0 249 aa1.75□□□□□ -2.13
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PDE4D-218ENST00000509368 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 ING4Q9UNL4 249 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF318Q5VUA4 2279 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 REV3LO60673 3130 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 PATJQ8NI35 1801 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 USP34Q70CQ2 3546 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 A0A087X002 238 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 EPOPA6NHQ4 379 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 A8MX80 341 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 LOC730098B7Z3J9 87 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 C5orf67F2Z3F1 127 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 H3BN98 237 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 MKRN2OSH3BPM6 223 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 RFXANKO14593 260 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 TOR1AO14656 332 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 DHFRP00374 187 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 HPRT1P00492 218 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 RPN2P04844 631 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 FABP1P07148 127 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 THRAP10827 490 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 PMCHP20382 165 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 ATP6V1B2P21281 511 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 OXTRP30559 389 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 SHMT2P34897 504 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 SLCO1A2P46721 670 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 CSRP3P50461 194 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 DLX1P56177 255 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 NUP107P57740 925 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 PITPNAQ00169 270 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 MADCAM1Q13477 382 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 GUK1Q16774 197 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 ZFP69Q49AA0 526 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 C5orf47Q569G3 176 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 LCE1AQ5T7P2 110 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 C1orf146Q5VVC0 180 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 CYP4Z1Q86W10 505 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF100Q8IYN0 542 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 CMTM1Q8IZ96 169 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 Q8NBF4 154 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 SUMF1Q8NBK3 374 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM35BQ8NCS4 154 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 FBXO17Q96EF6 278 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 C18orf12Q96KH6 178 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 PGLYRP2Q96PD5 576 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 RANBP9Q96S59 729 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 TEAD3Q99594 435 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 CTRCQ99895 268 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 CNPY3Q9BT09 278 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 WACQ9BTA9 647 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 TMED9Q9BVK6 235 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 OR2AG1Q9H205 316 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 SLC40A1Q9NP59 571 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 PRSS16Q9NQE7 514 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 MIEF1Q9NQG6 463 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 CTPS2Q9NRF8 586 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 PTTG3PQ9NZH4 202 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 KPTNQ9Y664 436 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 KCNE3Q9Y6H6 103 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 PLXNA3P51805 1871 aa1.75□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP1.74□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa1.74□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 FAM231BA6NCW3 169 aa1.74□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 PRR23AA6NEV1 266 aa1.74□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 PRSS44E7EML9 344 aa1.74□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 H0YJX3 145 aa1.74□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 PLPP3O14495 311 aa1.74□□□□□ -2.13
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