RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505490.2

ALYREF-202, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ALYREF, Length 1,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-202ENST00000505490 A0A1B0GVI7 797 aa24.84■■□□□ 1.57
ALYREF-202ENST00000505490 XRCC2O43543 280 aa24.84■■□□□ 1.57
ALYREF-202ENST00000505490 GMNNO75496 209 aa24.84■■□□□ 1.57
ALYREF-202ENST00000505490 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
ALYREF-202ENST00000505490 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa24.84■■□□□ 1.57
ALYREF-202ENST00000505490 Q6ZSV7 163 aa24.84■■□□□ 1.57
ALYREF-202ENST00000505490 FGFRL1Q8N441 504 aa24.84■■□□□ 1.57
ALYREF-202ENST00000505490 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa24.84■■□□□ 1.57
ALYREF-202ENST00000505490 DPAGT1Q9H3H5 408 aa24.84■■□□□ 1.57
ALYREF-202ENST00000505490 V9GYQ6 96 aa24.84■■□□□ 1.57
ALYREF-202ENST00000505490 A0A1B0GW55 424 aa24.83■■□□□ 1.57
ALYREF-202ENST00000505490 SLC22A31A6NKX4 558 aa24.83■■□□□ 1.57
ALYREF-202ENST00000505490 A6NLC8 198 aa24.83■■□□□ 1.57
ALYREF-202ENST00000505490 DUX4L2P0CJ85 424 aa24.83■■□□□ 1.57
ALYREF-202ENST00000505490 DUX4L3P0CJ86 424 aa24.83■■□□□ 1.57
ALYREF-202ENST00000505490 DUX4L4P0CJ87 422 aa24.83■■□□□ 1.57
ALYREF-202ENST00000505490 DUX4L5P0CJ88 424 aa24.83■■□□□ 1.57
ALYREF-202ENST00000505490 DUX4L6P0CJ89 424 aa24.83■■□□□ 1.57
ALYREF-202ENST00000505490 DUX4L7P0CJ90 424 aa24.83■■□□□ 1.57
ALYREF-202ENST00000505490 PRKXP51817 358 aa24.83■■□□□ 1.57
ALYREF-202ENST00000505490 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
ALYREF-202ENST00000505490 VMO1Q7Z5L0 202 aa24.83■■□□□ 1.57
ALYREF-202ENST00000505490 SLAMF6Q96DU3 332 aa24.83■■□□□ 1.57
ALYREF-202ENST00000505490 COPS4Q9BT78 406 aa24.83■■□□□ 1.57
ALYREF-202ENST00000505490 DUX4Q9UBX2 424 aa24.83■■□□□ 1.57
ALYREF-202ENST00000505490 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa24.83■■□□□ 1.57
ALYREF-202ENST00000505490 TSPAN9O75954 239 aa24.82■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 FABP3P05413 133 aa24.82■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 SLC2A1P11166 492 aa24.82■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 ENTPD1P49961 510 aa24.82■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 FAM3AP98173 230 aa24.82■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 POU4F2Q12837 409 aa24.82■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 WDR82Q6UXN9 313 aa24.82■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 SCCPDHQ8NBX0 429 aa24.82■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 SLC37A3Q8NCC5 494 aa24.82■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 LRTOMTQ8WZ04 291 aa24.82■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 ST8SIA4Q92187 359 aa24.82■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 TLNRD1Q9H1K6 362 aa24.82■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 ZNRD1Q9P1U0 126 aa24.82■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa24.81■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa24.81■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 GPR37O15354 613 aa24.81■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 AMY2BP19961 511 aa24.81■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 GRK5P34947 590 aa24.81■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 MICBQ29980 383 aa24.81■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 WDR38Q5JTN6 314 aa24.81■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 SLC16A9Q7RTY1 509 aa24.81■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 PRSS45Q7RTY3 260 aa24.81■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 LNX2Q8N448 690 aa24.81■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 OR1M1Q8NGA1 313 aa24.81■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 OR52L1Q8NGH7 329 aa24.81■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 OR51L1Q8NGJ5 315 aa24.81■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 OR8D4Q8NGM9 314 aa24.81■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 C8orf46Q8TAG6 207 aa24.81■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 MCUR1Q96AQ8 359 aa24.81■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 BTBD10Q9BSF8 475 aa24.81■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 ZNF878C9JN71 531 aa24.8■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 TGM4P49221 684 aa24.8■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 LRRC29Q8WV35 223 aa24.8■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 CCL13Q99616 98 aa24.8■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa24.8■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa24.79■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 TIPRLO75663 272 aa24.79■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 KRT36O76013 467 aa24.79■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 SLC25A1P53007 311 aa24.79■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 KLHL12Q53G59 568 aa24.79■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa24.79■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 Q8N7P7 452 aa24.79■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 ZNF511Q8NB15 262 aa24.79■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 SGK3Q96BR1 496 aa24.79■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 PKP2Q99959 881 aa24.79■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 TCF7L1Q9HCS4 588 aa24.79■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 VPREB3Q9UKI3 123 aa24.79■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa24.78■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 ARPC2O15144 300 aa24.78■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 TSPAN15O95858 294 aa24.78■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 FBP1P09467 338 aa24.78■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 SPARCP09486 303 aa24.78■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 FMO3P31513 532 aa24.78■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 LINC01590Q5TEZ4 76 aa24.78■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa24.78■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 PDZD9Q8IXQ8 264 aa24.78■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 LINC00471Q8N535 108 aa24.78■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 FAM216BQ8N7L0 139 aa24.78■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa24.78■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 OR8S1Q8NH09 359 aa24.78■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 TNFRSF14Q92956 283 aa24.78■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 UBE2FQ969M7 185 aa24.78■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 NSMCE2Q96MF7 247 aa24.78■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 DCTN5Q9BTE1 182 aa24.78■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 CENPMQ9NSP4 180 aa24.78■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa24.77■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 GRB2P62993 217 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
ALYREF-202ENST00000505490 CSNK2BP67870 215 aa24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.5 ms