RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498054.1

POLR1B-215, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1B, Length 636 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-215ENST00000498054 EPGNQ6UW88 154 aa3.01□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 NIPA1Q7RTP0 329 aa3.01□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 IQCF2Q8IXL9 164 aa3.01□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 CPNE9Q8IYJ1 553 aa3.01□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 PGAM4Q8N0Y7 254 aa3.01□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 PNKDQ8N490 385 aa3.01□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 PACRGLQ8N7B6 248 aa3.01□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 OR10G3Q8NGC4 313 aa3.01□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 OR6C4Q8NGE1 309 aa3.01□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 ACMSDQ8TDX5 336 aa3.01□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 ARPC1AQ92747 370 aa3.01□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 SMARCD2Q92925 531 aa3.01□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 CMTM5Q96DZ9 223 aa3.01□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 TCEAL4Q96EI5 215 aa3.01□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 TMEM101Q96IK0 257 aa3.01□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 CNBD2Q96M20 576 aa3.01□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 SLC29A1Q99808 456 aa3.01□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 ROGDIQ9GZN7 287 aa3.01□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 UGT1A7Q9HAW7 530 aa3.01□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 UGT1A10Q9HAW8 530 aa3.01□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 UGT1A8Q9HAW9 530 aa3.01□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 PARVGQ9HBI0 331 aa3.01□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 ZFP14Q9HCL3 533 aa3.01□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa3.01□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 MMP17Q9ULZ9 603 aa3.01□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 CCDC160A6NGH7 325 aa3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 CENPBD1B2RD01 187 aa3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 H0Y8G0 127 aa3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 PIAS1O75925 651 aa3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 LYPLA2O95372 231 aa3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 APOEP02649 317 aa3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 DNAH10OSP0CZ25 163 aa3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 BCKDHBP21953 392 aa3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 HTR1EP28566 365 aa3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 OR1G1P47890 313 aa3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 SULT1E1P49888 294 aa3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 SERPINB9P50453 376 aa3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 TMBIM6P55061 237 aa3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 ARPC4P59998 168 aa3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 GNB2P62879 340 aa3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 IFITM3Q01628 133 aa3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 SCRN3Q0VDG4 424 aa3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 CDC20Q12834 499 aa3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 PMS2P3Q13401 168 aa3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 RGS21Q2M5E4 152 aa3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 CCDC14Q49A88 953 aa3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 TFDP3Q5H9I0 405 aa3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 GPR157Q5UAW9 335 aa3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 PDPK2PQ6A1A2 396 aa3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 SLC8B1Q6J4K2 584 aa3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 TTC23LQ6PF05 361 aa3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 CD300LGQ6UXG3 332 aa3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF620Q6ZNG0 422 aa3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 C19orf35Q6ZS72 473 aa3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 PAQR7Q86WK9 346 aa3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 PDIK1LQ8N165 341 aa3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 TRIML2Q8N7C3 387 aa3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 C20orf203Q8NBC4 194 aa3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 OR1L6Q8NGR2 347 aa3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 ACTL9Q8TC94 416 aa3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 LRRC39Q96DD0 335 aa3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 ITCHQ96J02 903 aa3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 SERPINI1Q99574 410 aa3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 RASL11BQ9BPW5 248 aa3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 TCHPQ9BT92 498 aa3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 HES7Q9BYE0 225 aa3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 ASB8Q9H765 288 aa3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 CXorf21Q9HAI6 301 aa3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 SIAEQ9HAT2 523 aa3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 PARVBQ9HBI1 364 aa3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 GID8Q9NWU2 228 aa3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 RAB20Q9NX57 234 aa3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 CD300AQ9UGN4 299 aa3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF639Q9UID6 485 aa3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 PLXNA2O75051 1894 aa3□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 NOTCH2Q04721 2471 aa2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 GJE1A6NN92 205 aa2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 A8MU10 97 aa2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 F8VP50 259 aa2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 GOLGA8MH3BSY2 632 aa2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 J3QRK9 145 aa2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 UBXN8O00124 270 aa2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms