RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495044.5

CCDC30-211, Transcript of coiled-coil domain containing 30, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC30, Length 2,021 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC30-211ENST00000495044 PNKDQ8N490 385 aa6□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 BEND2Q8NDZ0 799 aa6□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 SLC7A13Q8TCU3 470 aa6□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 RCN3Q96D15 328 aa6□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 CMTM5Q96DZ9 223 aa6□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 PRRC1Q96M27 445 aa6□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 OCSTAMPQ9BR26 566 aa6□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 VCX3BQ9H321 246 aa6□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 KAAG1Q9UBP8 84 aa6□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 NDUFAF1Q9Y375 327 aa6□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 GGT3PA6NGU5 568 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 K7EIL1 84 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 EBAG9O00559 213 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 NDUFB3O43676 98 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 CD28P10747 220 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 IGLL1P15814 213 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 CALB2P22676 271 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 GPR4P46093 362 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 UBE2E1P51965 193 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 CRYBA2P53672 197 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 DLX1P56177 255 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 IKZF1Q13422 519 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 BLMHQ13867 455 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 MEP1BQ16820 701 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 LRRC10Q5BKY1 277 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 DNM1P34Q6PK57 102 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 CORO6Q6QEF8 472 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 C16orf54Q6UWD8 224 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 ZNF826PQ6ZT77 177 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 FGFRL1Q8N441 504 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 GCSAMQ8N6F7 178 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 LY6G5BQ8NDX9 201 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 TPD52L3Q96J77 140 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 DMRTB1Q96MA1 342 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 CCL13Q99616 98 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 PITX2Q99697 317 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 ATF6BQ99941 703 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 C14orf119Q9NWQ9 140 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 LHFPL6Q9Y693 200 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 DNAH3Q8TD57 4116 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 COL7A1Q02388 2944 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 A0A1B0GW55 424 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 A0A1W2PQ09 198 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 CD300LBA8K4G0 201 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 SOCS2O14508 198 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 MRASO14807 208 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 FCN3O75636 299 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 NPPAP01160 153 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 ACSM4P0C7M7 580 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 DUX4L2P0CJ85 424 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 DUX4L3P0CJ86 424 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 DUX4L4P0CJ87 422 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 DUX4L5P0CJ88 424 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 DUX4L6P0CJ89 424 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 DUX4L7P0CJ90 424 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 SDHAP31040 664 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 GRK5P34947 590 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 PRKCDQ05655 676 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 KCNMB1Q16558 191 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 WDR38Q5JTN6 314 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 TEX36Q5VZQ5 186 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 PGBD2Q6P3X8 592 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 ZNF730Q6ZMV8 503 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 LIAT1Q6ZQX7 453 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 COLCA1Q6ZS62 124 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 ADCK1Q86TW2 530 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 LNX2Q8N448 690 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 FAM216BQ8N7L0 139 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 LINC00469Q8N7U9 141 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 OR8S1Q8NH09 359 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 FNDC11Q9BVV2 318 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 TAS2R1Q9NYW7 299 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 DUX4Q9UBX2 424 aa5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 NKX6-3A6NJ46 265 aa5.98□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 E9PQ18 207 aa5.98□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 BHLHE40O14503 412 aa5.98□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 INMTO95050 263 aa5.98□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 PF4V1P10720 104 aa5.98□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 PAICSP22234 425 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 CRABP1P29762 137 aa5.98□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 TPTEP56180 551 aa5.98□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 HIST1H3AP68431 136 aa5.98□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 SLC35A2P78381 396 aa5.98□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 FHL1Q13642 323 aa5.98□□□□□ -1.45
CCDC30-211ENST00000495044 TRAM2Q15035 370 aa5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.7 ms