RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485019.1

RBM34-208, Transcript of RNA binding motif protein 34, human

TSL 3

Gene RBM34, Length 409 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM34-208	ENST00000485019	CD55	P08174	381 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	ADH4	P08319	380 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	LIMS3	P0CW19	117 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	LIMS4	P0CW20	117 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	TNFRSF1A	P19438	455 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	COL8A2	P25067	703 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	GNAL	P38405	381 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	MVK	Q03426	396 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	DOK3	Q7L591	496 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	ZNF786	Q8N393	782 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	PIGC	Q92535	297 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	MYDGF	Q969H8	173 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	PELI1	Q96FA3	418 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	OR2V2	Q96R30	315 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	ZNF649	Q9BS31	505 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	TREM2	Q9NZC2	230 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	IL19	Q9UHD0	177 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	CAB39	Q9Y376	341 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	DSCAM	O60469	2012 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019		F5H5P2	479 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	MYL12B	O14950	172 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	SYT7	O43581	403 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	GMDS	O60547	372 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	DHRS3	O75911	302 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	IGLV3-1	P01715	115 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	CDK1	P06493	297 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	CCDC159	P0C7I6	412 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	ATP6V1B1	P15313	513 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	ACHE	P22303	614 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	KIR3DL2	P43630	455 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	TNK1	Q13470	666 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	OR8B8	Q15620	311 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	HFE	Q30201	348 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	KLB	Q86Z14	1044 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	OR8S1	Q8NH09	359 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	YIPF5	Q969M3	257 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	DLL4	Q9NR61	685 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	CLEC2D	Q9UHP7	191 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	RHBDD3	Q9Y3P4	386 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	TRIM64	A6NGJ6	449 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	TRIM64B	A6NI03	449 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	ANXA2P2	A6NMY6	339 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	ZNF850	A8MQ14	1090 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	NDUFS8	O00217	210 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	ACKR3	P25106	362 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	CRYBB2	P43320	205 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	CCR9	P51686	369 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	MZT1	Q08AG7	82 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	PRDX4	Q13162	271 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	SPRN	Q5BIV9	151 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	FDX2	Q6P4F2	183 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	RDH10	Q8IZV5	341 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	SPERT	Q8NA61	448 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	OR52N1	Q8NH53	320 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	CCL17	Q92583	94 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	ITFG2	Q969R8	447 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	CHODL	Q9H9P2	273 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM34-208	ENST00000485019	ERGIC3	Q9Y282	383 aa		10.81	□□□□□ -0.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms