RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	ADRA2C	P18825	462 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	CD80	P33681	288 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	ATP6V1E1	P36543	226 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	DDOST	P39656	456 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	CD200	P41217	278 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	GSK3A	P49840	483 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	ACTR3	P61158	418 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	GNB2	P62879	340 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	FAM3A	P98173	230 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	OR8B8	Q15620	311 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	KCTD8	Q6ZWB6	473 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM163	Q8TC26	289 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	TBX5	Q99593	518 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	NIPAL2	Q9H841	368 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	OR5V1	Q9UGF6	321 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM269	A0A1B0GVZ9	245 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	ANXA2P2	A6NMY6	339 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	ALOX5AP	P20292	161 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	PMEL	P40967	661 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	C12orf73	Q69YU5	71 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	GID4	Q8IVV7	300 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	FTMT	Q8N4E7	242 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	SPERT	Q8NA61	448 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	OR8B12	Q8NGG6	310 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	SPSB4	Q96A44	273 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	RNF7	Q9UBF6	113 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	STAB1	Q9NY15	2570 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	C3orf80	F5H4A9	247 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	EI24	O14681	340 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	APOL3	O95236	402 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	GATA4	P43694	442 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	CDC42	P60953	191 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	GMFB	P60983	142 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	CXCR4	P61073	352 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	SCGB2A2	Q13296	93 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	12.42	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	KLB	Q86Z14	1044 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	TEX29	Q8N6K0	151 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	PIGC	Q92535	297 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	ERGIC1	Q969X5	290 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	12.42	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	FAM71F1	Q96KD3	344 aa	Predicted RBP	12.42	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	OR8B2	Q96RD0	313 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	MICU1	Q9BPX6	476 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	12.42	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	RGCC	Q9H4X1	137 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM165	Q9HC07	324 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	MIOX	Q9UGB7	285 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	COPS3	Q9UNS2	423 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	RHBDD3	Q9Y3P4	386 aa		12.42	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF850	A8MQ14	1090 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	MAGEB4	O15481	346 aa	Predicted RBP	12.41	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	TCF21	O43680	179 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	PRDX4	Q13162	271 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	SNCB	Q16143	134 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	LIPN	Q5VXI9	398 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	12.41	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	TECTB	Q96PL2	329 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	OR8B4	Q96RC9	309 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	APOL4	Q9BPW4	351 aa		12.41	□□□□□ -0.42
SSR4-208	ENST00000471880	MRI1	Q9BV20	369 aa		12.41	□□□□□ -0.42

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