RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 SGCAQ16586 387 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 ST3GAL2Q16842 350 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 SNAI3Q3KNW1 292 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 LINC00303Q3SY05 128 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 Q5BKY6 102 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 ZBTB37Q5TC79 503 aa4.93□□□□□ -1.62
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PTPRC-210ENST00000462363 CD276Q5ZPR3 534 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 SLC25A25Q6KCM7 469 aa4.93□□□□□ -1.62
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PTPRC-210ENST00000462363 SLC16A14Q7RTX9 510 aa4.93□□□□□ -1.62
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PTPRC-210ENST00000462363 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
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PTPRC-210ENST00000462363 SLC22A24Q8N4F4 322 aa4.93□□□□□ -1.62
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PTPRC-210ENST00000462363 SGK3Q96BR1 496 aa4.93□□□□□ -1.62
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PTPRC-210ENST00000462363 ACTR6Q9GZN1 396 aa4.93□□□□□ -1.62
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PTPRC-210ENST00000462363 C20orf85Q9H1P6 137 aa4.93□□□□□ -1.62
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PTPRC-210ENST00000462363 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
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PTPRC-210ENST00000462363 OR14I1A6ND48 311 aa4.92□□□□□ -1.62
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PTPRC-210ENST00000462363 CXCL3P19876 107 aa4.92□□□□□ -1.62
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PTPRC-210ENST00000462363 RFC3P40938 356 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 OR3A4PP47883 348 aa4.92□□□□□ -1.62
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PTPRC-210ENST00000462363 INPP1P49441 399 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 MEOX1P50221 254 aa4.92□□□□□ -1.62
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PTPRC-210ENST00000462363 PLAC9Q5JTB6 97 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 SFRP5Q5T4F7 317 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 OR10K2Q6IF99 312 aa4.92□□□□□ -1.62
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PTPRC-210ENST00000462363 LINC00696Q6ZRV3 163 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 Q6ZTK2 550 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 ASCL5Q7RTU5 278 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
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