RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 OR4S1Q8NGB4 309 aa6.06□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa6.06□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 MYO7BQ6PIF6 2116 aa6.06□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa6.06□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 MS4A18H0YCH9 400 aa6.06□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 GPR31O00270 319 aa6.06□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 SULT1A2P50226 295 aa6.06□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 MS4A18Q3C1V0 323 aa6.06□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 PRSS45Q7RTY3 260 aa6.06□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa6.06□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 ZNF740Q8NDX6 193 aa6.06□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 NTNG2Q96CW9 530 aa6.06□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 ZIC5Q96T25 663 aa6.06□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 KCNK15Q9H427 330 aa6.06□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 FOXJ3Q9UPW0 622 aa6.06□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 TMED3Q9Y3Q3 217 aa6.06□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 OR2T8A6NH00 312 aa6.06□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 SIAH2O43255 324 aa6.06□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 CBR3O75828 277 aa6.06□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 FGF2P09038 288 aa6.06□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 OR4E1P0C645 316 aa6.06□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 EPHA2P29317 976 aa6.06□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 ARRB2P32121 409 aa6.06□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 HRH1P35367 487 aa6.06□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 DEFB103AP81534 67 aa6.06□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 ZNF385BQ569K4 471 aa6.06□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 NKAIN2Q5VXU1 208 aa6.06□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa6.06□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 GABARAPL3Q9BY60 117 aa6.06□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 SLC17A5Q9NRA2 495 aa6.06□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 FITM1A5D6W6 292 aa6.06□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 THBS4P35443 961 aa6.06□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 RPS19P39019 145 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 MMP15P51511 669 aa6.06□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 OR2M3Q8NG83 312 aa6.06□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 CLEC1BQ9P126 229 aa6.06□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 ST3GAL6Q9Y274 331 aa6.06□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 ANKUB1A6NFN9 424 aa6.05□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 ZNF716A6NP11 495 aa6.05□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 M0R143 59 aa6.05□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 SOX15O60248 233 aa6.05□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 CTSLP07711 333 aa6.05□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 COX19Q49B96 90 aa6.05□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 AFMIDQ63HM1 303 aa6.05□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 Q6ZSR9 355 aa6.05□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 TMEM123Q8N131 208 aa6.05□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 TMEM229BQ8NBD8 167 aa6.05□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 OR1N1Q8NGS0 311 aa6.05□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 HGDQ93099 445 aa6.05□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 SLC25A19Q9HC21 320 aa6.05□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa6.05□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 IDSB3KWA1 339 aa6.05□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 M0R1B8 84 aa6.05□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 TAPBPO15533 448 aa6.05□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 MDH2P40926 338 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 EVX1P49640 407 aa6.05□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 BTG2P78543 158 aa6.05□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 WDR73Q6P4I2 378 aa6.05□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 CYHR1Q6ZMK1 362 aa6.05□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 AMIGO3Q86WK7 504 aa6.05□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 UBALD2Q8IYN6 164 aa6.05□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 ZDHHC22Q8N966 263 aa6.05□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 OR1L4Q8NGR5 311 aa6.05□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 OR51E1Q8TCB6 317 aa6.05□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 BLNKQ8WV28 456 aa6.05□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 ADIPOR1Q96A54 375 aa6.05□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 RAB40CQ96S21 281 aa6.05□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 ANKRD36A6QL64 1941 aa6.05□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 PPP6CO00743 305 aa6.05□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 PRRX1P54821 245 aa6.05□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 HERVK_113P61574 105 aa6.05□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 GNG3P63215 75 aa6.05□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 BCORP1Q8N888 145 aa6.05□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 ST8SIA2Q92186 375 aa6.05□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 CLEC2DQ9UHP7 191 aa6.05□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 OR51B4Q9Y5P0 310 aa6.05□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 C5P01031 1676 aa6.05□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 ZAR1LA6NP61 321 aa6.05□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 NDUFB3O43676 98 aa6.05□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 CLDN20P56880 219 aa6.05□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 NHLH1Q02575 133 aa6.05□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 NHLH2Q02577 135 aa6.05□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 TUSC1Q2TAM9 212 aa6.05□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 OR2T2Q6IF00 324 aa6.05□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa6.05□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 OR5D13Q8NGL4 314 aa6.05□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 ANGPTL6Q8NI99 470 aa6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms