RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF100Q8IYN0 542 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 CADM3Q8N126 398 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 UBE2J2Q8N2K1 259 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 PARP16Q8N5Y8 322 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 GDPD1Q8N9F7 314 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 ACOT4Q8N9L9 421 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 SCAIQ8N9R8 606 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF485Q8NCK3 441 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 C17orf47Q8NEP4 570 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 SLC7A13Q8TCU3 470 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 OSTF1Q92882 214 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 ADIPOR1Q96A54 375 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 RAB39BQ96DA2 213 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 OPALINQ96PE5 141 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 F2RL3Q96RI0 385 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 SOSTQ9BQB4 213 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 FNDC11Q9BVV2 318 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 FN3KQ9H479 309 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 GLIPR2Q9H4G4 154 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 HHATLQ9HCP6 504 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 G6PC2Q9NQR9 355 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 GIMAP4Q9NUV9 329 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 RHBDL2Q9NX52 303 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 IL20Q9NYY1 176 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 SSR3Q9UNL2 185 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 RABL2BQ9UNT1 228 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRK-211ENST00000429595 A0A087WV62 115 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 A0A1W2PR80 420 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 OR6C70A6NIJ9 312 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 TTC36A6NLP5 189 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 PPIHO43447 177 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 PLPP2O43688 288 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 OR10H3O60404 316 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 TPST2O60704 377 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 GPX5O75715 221 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 RAB36O95755 333 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 OPN1LWP04000 364 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 OR4A8P0C604 315 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 SLC35E2P0CK97 266 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 NR2F1P10589 423 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 DBTP11182 482 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 NT5EP21589 574 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 IL12BP29460 328 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 AQP1P29972 269 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 FEN1P39748 380 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 SSR2P43308 183 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 SLC9A3P48764 834 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM33P57088 247 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 KRTAP10-5P60370 271 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 TRAM1Q15629 374 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 SSX1Q16384 188 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 AADACL4Q5VUY2 407 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 SLC27A4Q6P1M0 643 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 ACSM6Q6P461 480 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF329Q86UD4 541 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 PEX5LQ8IYB4 626 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 OR7G1Q8NGA0 311 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 OR9Q2Q8NGE9 314 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 OR52N1Q8NH53 320 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 OR52J3Q8NH60 311 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 OR2V1Q8NHB1 315 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 CDC26Q8NHZ8 85 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM163Q8TC26 289 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 ABHD5Q8WTS1 349 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 ACOT12Q8WYK0 555 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 AP3S1Q92572 193 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 SLC25A46Q96AG3 418 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 ELP4Q96EB1 424 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 SLC35G5Q96KT7 338 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 SLC38A2Q96QD8 506 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 ELOVL1Q9BW60 279 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 AICDAQ9GZX7 198 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 OR51I1Q9H343 314 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 MAP6D1Q9H9H5 199 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 INPP5EQ9NRR6 644 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 TNFRSF19Q9NS68 423 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 PLEK2Q9NYT0 353 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 MED11Q9P086 117 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF69Q9UC07 566 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 PHF11Q9UIL8 331 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 PRR14LQ5THK1 2151 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 J3KTA2 159 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 J3QRE1 110 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 RHODO00212 210 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 TNFSF11O14788 317 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 SCO2O43819 266 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 PLOD3O60568 738 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRK-211ENST00000429595 NME6O75414 186 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 163.1 ms