RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 FAHD2AQ96GK7 314 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 LPAR5Q9H1C0 372 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC22A11Q9NSA0 550 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa16.53■□□□□ 0.24
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SH3BP1-202ENST00000417536 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP1-202ENST00000417536 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
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SH3BP1-202ENST00000417536 NPIPB4C9JG80 1138 aa16.52■□□□□ 0.23
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SH3BP1-202ENST00000417536 FAM219AQ8IW50 185 aa16.5■□□□□ 0.23
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SH3BP1-202ENST00000417536 LAMA5O15230 3695 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 EXPH5Q8NEV8 1989 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa16.5■□□□□ 0.23
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SH3BP1-202ENST00000417536 ADAP1O75689 374 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 IL32P24001 234 aa16.5■□□□□ 0.23
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SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 THEM4Q5T1C6 240 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 ANKRD37Q7Z713 158 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 GPER1Q99527 375 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 RNF126Q9BV68 326 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 C5orf66Q9H5L9 145 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 MPTX1A8MV57 137 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 RER1O15258 196 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 CDC14BO60729 498 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP1-202ENST00000417536 RAD51DO75771 328 aa16.49■□□□□ 0.23
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