RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397611.7

PTPRD-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 8,242 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-205ENST00000397611 CLDN16Q9Y5I7 305 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 RP1P56715 2156 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 ZNF264O43296 627 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 MBTPS2O43462 519 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 YIF1AO95070 293 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 IL33O95760 270 aa4.9□□□□□ -1.63
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PTPRD-205ENST00000397611 PCP4P48539 62 aa4.9□□□□□ -1.63
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PTPRD-205ENST00000397611 NINJ1Q92982 152 aa4.9□□□□□ -1.63
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PTPRD-205ENST00000397611 ENY2Q9NPA8 101 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 GPR27Q9NS67 375 aa4.9□□□□□ -1.63
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PTPRD-205ENST00000397611 OR5D14Q8NGL3 314 aa4.9□□□□□ -1.63
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PTPRD-205ENST00000397611 SEMA6CQ9H3T2 930 aa4.89□□□□□ -1.63
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PTPRD-205ENST00000397611 FAM58AQ8N1B3 248 aa4.89□□□□□ -1.63
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PTPRD-205ENST00000397611 A8MVM7 634 aa4.89□□□□□ -1.63
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PTPRD-205ENST00000397611 JTBO76095 146 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 HNF1AP20823 631 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP4.89□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 GLO1Q04760 184 aa4.89□□□□□ -1.63
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PTPRD-205ENST00000397611 ZNF266Q14584 549 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRD-205ENST00000397611 COL19A1Q14993 1142 aa4.89□□□□□ -1.63
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