RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 IFNA10P01566 189 aa6.4□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF44P15621 663 aa6.4□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 FAHP16930 419 aa6.4□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 RAB5AP20339 215 aa6.4□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 PPT1P50897 306 aa6.4□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 CTXN1P60606 82 aa6.4□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 RAB4BP61018 213 aa6.4□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP6.4□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 BIKQ13323 160 aa6.4□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 FZD2Q14332 565 aa6.4□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 SGCAQ16586 387 aa6.4□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF74Q16587 644 aa6.4□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 Q3ZCU0 254 aa6.4□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 KLHL26Q53HC5 615 aa6.4□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 VAX1Q5SQQ9 334 aa6.4□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 GLYATL3Q5SZD4 288 aa6.4□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 KCTD9Q7L273 389 aa6.4□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 SLC16A13Q7RTY0 426 aa6.4□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 GKN2Q86XP6 184 aa6.4□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 ZFP82Q8N141 532 aa6.4□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa6.4□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 PRSS35Q8N3Z0 413 aa6.4□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 LCN9Q8WX39 176 aa6.4□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 SELENOIQ9C0D9 397 aa6.4□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 TOLLIPQ9H0E2 274 aa6.4□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 FKRPQ9H9S5 495 aa6.4□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 RPS10P5Q9NQ39 176 aa6.4□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 CYTL1Q9NRR1 136 aa6.4□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 CUTCQ9NTM9 273 aa6.4□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 TBC1D29Q9UFV1 150 aa6.4□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 CACFD1Q9UGQ2 172 aa6.4□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa6.4□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 FANCMQ8IYD8 2048 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 A0A1W2PR77 199 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 SERINC4A6NH21 518 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 PSMD9O00233 223 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 SIGLEC5O15389 551 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 OR6A2O95222 327 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 CSTBP04080 98 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 FCGR3AP08637 254 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 SERPINF1P36955 418 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 SLC6A8P48029 635 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 PLA2G7Q13093 441 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 ARL6IP1Q15041 203 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 MST1LQ2TV78 715 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 DEFB134Q4QY38 66 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 WDR38Q5JTN6 314 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 STPG1Q5TH74 334 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 RTL6Q6ICC9 239 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 DEGS2Q6QHC5 323 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 BTNL8Q6UX41 500 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 CD163Q86VB7 1156 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 HOGA1Q86XE5 327 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 C10orf53Q8N6V4 93 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 LYPD6BQ8NI32 183 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 ASB5Q8WWX0 329 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 C2orf50Q96LR7 162 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 MACROD1Q9BQ69 325 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 SYT3Q9BQG1 590 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 PLEKHA2Q9HB19 425 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 GHRLQ9UBU3 117 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 KCNG2Q9UJ96 466 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 FBXO4Q9UKT5 387 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 TMED3Q9Y3Q3 217 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 CACNA1AO00555 2505 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 A6NCN8 305 aa6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 NPIPA7E9PJI5 369 aa6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 CCSO14618 274 aa6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 GMFGO60234 142 aa6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 ALOX12BO75342 701 aa6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 SFT2D2O95562 160 aa6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 TSPAN15O95858 294 aa6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 ASAH2BP0C7U1 165 aa6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 NPIPA8P0DM63 369 aa6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 CXCR1P25024 350 aa6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 NFYBP25208 207 aa6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 LAP3P28838 519 aa6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 HSD11B1P28845 292 aa6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 GRPRP30550 384 aa6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 CD80P33681 288 aa6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 KIR3DL2P43630 455 aa6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF260Q3ZCT1 412 aa6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 DPY19L4Q7Z388 723 aa6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 DCXRQ7Z4W1 244 aa6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-201ENST00000372616 RABEPKQ7Z6M1 372 aa6.38□□□□□ -1.39
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