RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP1.23□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 CACNG3O60359 315 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 CD160O95971 181 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 MT-ND4P03905 459 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGLV7-43P04211 117 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 RPN2P04844 631 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLTAP09496 248 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 CTRB1P17538 263 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 USF1P22415 310 aaPredicted RBP1.23□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 HTR1DP28221 377 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 PFN2P35080 140 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP1.23□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 CUL2Q13617 745 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 TBPL2Q6SJ96 375 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 SMARCD3Q6STE5 483 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 RTL4Q6ZR62 310 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 PQLC3Q8N755 202 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 C19orf18Q8NEA5 215 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 HAUS1Q96CS2 278 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP1.23□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRRC1Q96M27 445 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 NUDT9Q9BW91 350 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 ACP6Q9NPH0 428 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP1.23□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 INSRP06213 1382 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 UBN2Q6ZU65 1347 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 NME4O00746 187 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR7C2O60412 319 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 NMT2O60551 498 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 RAD1O60671 282 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 DEDDO75618 318 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 HLA-HP01893 362 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 PGA4P0DJD7 388 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 PGA3P0DJD8 388 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 PGA5P0DJD9 388 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 CD28P10747 220 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF35P13682 527 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 HRES1P13985 223 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 CD70P32970 193 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP1.22□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 RFC3P40938 356 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 FABP6P51161 128 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 NDUFA8P51970 172 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP1.22□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 GCSAMLQ5JQS6 135 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP1.22□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 HORMAD1Q86X24 394 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC148Q8NFR7 591 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR10W1Q8NGF6 305 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR56A4Q8NGH8 313 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR52E5Q8NH55 327 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR1L1Q8NH94 360 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 GHSRQ92847 366 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 RPEQ96AT9 228 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 SGTBQ96EQ0 304 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 C11orf70Q9BRQ4 267 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 CALN1Q9BXU9 219 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 EXO5Q9H790 373 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 AUNIPQ9H7T9 357 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 BEX1Q9HBH7 125 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP1.22□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP1.22□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 RGS18Q9NS28 235 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 TAS2R1Q9NYW7 299 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 IL37Q9NZH6 218 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 LRRC42Q9Y546 428 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP1.22□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLXNB1O43157 2135 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 NSD2O96028 1365 aa1.21□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 C4orf51C9J302 202 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANKRD65E5RJM6 399 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 BCKDKO14874 412 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 INAFM2P0DMQ5 153 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 MYL9P24844 172 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 PPICP45877 212 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 KDSRQ06136 332 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 TNFRSF9Q07011 255 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 BTN1A1Q13410 526 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 ILKQ13418 452 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 ITIH4Q14624 930 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP1.21□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP1.21□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 LUZP6Q538Z0 58 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM69Q5SWH9 247 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM53Q6P2H8 277 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 LINC00336Q6ZUF6 198 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP1.21□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.8 ms