RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 TEX29Q8N6K0 151 aa6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 TCEANCQ8N8B7 351 aa6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 SETD9Q8NE22 299 aa6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 OR2AE1Q8NHA4 323 aa6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 FAM81AQ8TBF8 368 aa6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 SLAMF6Q96DU3 332 aa6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 IL4I1Q96RQ9 567 aa6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 COPS4Q9BT78 406 aa6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 MED20Q9H944 212 aa6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM100Q9NV29 134 aa6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 HAO2Q9NYQ3 351 aa6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 LAMP5Q9UJQ1 280 aa6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 PCDHB10Q9UN67 800 aa6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa6.44□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa6.44□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 IRGMA1A4Y4 181 aa6.44□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 ACOD1A6NK06 481 aa6.44□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 LRRC30A6NM36 301 aa6.44□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 H0YAE9 185 aa6.44□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM178BH3BS89 294 aa6.44□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 SLC16A6O15403 523 aa6.44□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 PRKYO43930 277 aa6.44□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF254O75437 659 aa6.44□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 HLA-DPB1P04440 258 aa6.44□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 LYNP07948 512 aa6.44□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 SLC2A1P11166 492 aa6.44□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 ANOS1P23352 680 aa6.44□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 GATA3P23771 443 aa6.44□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 HSD11B1P28845 292 aa6.44□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 HSPA13P48723 471 aa6.44□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 PRKXP51817 358 aa6.44□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 ACTC1P68032 377 aa6.44□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 ACTA1P68133 377 aa6.44□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF92Q03936 586 aa6.44□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 GLYATL3Q5SZD4 288 aa6.44□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 LINC01590Q5TEZ4 76 aa6.44□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 AADACL4Q5VUY2 407 aa6.44□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 LIPNQ5VXI9 398 aa6.44□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 SPATC1Q76KD6 591 aa6.44□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 DPY19L4Q7Z388 723 aa6.44□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 C1QL2Q7Z5L3 287 aa6.44□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 EGFL6Q8IUX8 553 aa6.44□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 TIGD4Q8IY51 512 aa6.44□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 FTMTQ8N4E7 242 aa6.44□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 OR52H1Q8NGJ2 320 aa6.44□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 OR6N2Q8NGY6 317 aa6.44□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 OTOSQ8NHW6 89 aa6.44□□□□□ -1.38
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SGMS1-201ENST00000361543 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 TEAD3Q99594 435 aa6.44□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 KCNJ15Q99712 375 aa6.44□□□□□ -1.38
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SGMS1-201ENST00000361543 C19orf24Q9BVV8 132 aa6.44□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 MROQ9BYG7 248 aa6.44□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 RGCCQ9H4X1 137 aa6.44□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa6.44□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 CENPMQ9NSP4 180 aa6.44□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 CLN6Q9NWW5 311 aa6.44□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF391Q9UJN7 358 aa6.44□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa6.44□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 PPIAL4EA0A075B759 164 aa6.43□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa6.43□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 C5orf63A6NC05 138 aa6.43□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 GGT3PA6NGU5 568 aa6.43□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 CD300LBA8K4G0 201 aa6.43□□□□□ -1.38
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SGMS1-201ENST00000361543 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa6.43□□□□□ -1.38
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SGMS1-201ENST00000361543 FOXH1O75593 365 aa6.43□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF205O95201 554 aa6.43□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 AVPP01185 164 aa6.43□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 RPSAP08865 295 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 H2BFMP0C1H6 154 aa6.43□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 PPIAL4FP0DN26 164 aa6.43□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 RPS2P15880 293 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 ADRA2CP18825 462 aa6.43□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 EPHA1P21709 976 aa6.43□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 SLC2A5P22732 501 aa6.43□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 CA6P23280 308 aa6.43□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 EPHA2P29317 976 aa6.43□□□□□ -1.38
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