RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 CST11Q9H112 138 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 SEC61A2Q9H9S3 476 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 LOXL2Q9Y4K0 774 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 CACNA1GO43497 2377 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF878C9JN71 531 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 OR2F2O95006 317 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 IGHG1P01857 330 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 CCL3P10147 92 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 GNB3P16520 340 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 TCN2P20062 427 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 OR2F1Q13607 317 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 C11orf87Q6NUJ2 197 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 MOB3CQ70IA8 216 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 RNF144BQ7Z419 303 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 ANGPTL5Q86XS5 388 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 MOB1AQ9H8S9 216 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 KCNK7Q9Y2U2 307 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF814B7Z6K7 855 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 LIPCP11150 499 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 COX6A1P12074 109 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 CD96P40200 585 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 PPP1R1AQ13522 171 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 LIN54Q6MZP7 749 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 OR2M3Q8NG83 312 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 OR10R2Q8NGX6 335 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 YKT6O15498 198 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 SSX5O60225 188 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 ONECUT2O95948 504 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 CDAP32320 146 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 HRH1P35367 487 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM122CQ6P4D5 195 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 MITD1Q8WV92 249 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 SELENOIQ9C0D9 397 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 MED13Q9UHV7 2174 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A1B0GW55 424 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 C9orf170A2RU37 121 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 C9J4A7 227 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 DUX4L2P0CJ85 424 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 DUX4L3P0CJ86 424 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 DUX4L4P0CJ87 422 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 DUX4L5P0CJ88 424 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 DUX4L6P0CJ89 424 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 DUX4L7P0CJ90 424 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 CARD17Q5XLA6 110 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 AWAT2Q6E213 333 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 RTN4RL2Q86UN3 420 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 WDSUB1Q8N9V3 476 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 OR52H1Q8NGJ2 320 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 OR10K1Q8NGX5 313 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 DUX4Q9UBX2 424 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 OR2AT4A6NND4 320 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 CCSO14618 274 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 DKK1O94907 266 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 AVPR2P30518 371 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 MC2RQ01718 297 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 DHRS13Q6UX07 377 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 OR5AS1Q8N127 324 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 OR6X1Q8NH79 312 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 OR5B2Q96R09 309 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 IFT46Q9NQC8 304 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 POLR1DQ9Y2S0 133 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 LOC100509620A0A075B734 347 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 ABOP16442 354 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF20P17024 532 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 CASRP41180 1078 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 PRKXP51817 358 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 TAF13Q15543 124 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 OR8B12Q8NGG6 310 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 ELP5Q8TE02 316 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 FAHD2AQ96GK7 314 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 SEC22AQ96IW7 307 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 AIFM2Q9BRQ8 373 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 NICN1Q9BSH3 213 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 SOX7Q9BT81 388 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 LPAR5Q9H1C0 372 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 COMMD9Q9P000 198 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF319Q9P2F9 582 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 BCL2L11O43521 198 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF17P17021 662 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 TBPP20226 339 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 GABREP78334 506 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1-201ENST00000357436 HIST3H3Q16695 136 aa16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.2 ms